30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0216 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0216  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  307  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.851915  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0195  hypothetical protein  96.23 
 
 		 159 aa  295  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0219  hypothetical protein  85.99 
 
 		 160 aa  259  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0264  hypothetical protein  73.25 
 
 		 160 aa  224  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0288  hypothetical protein  58.21 
 
 		 147 aa  147  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5479  hypothetical protein  53.64 
 
 		 153 aa  147  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0137  hypothetical protein  46.88 
 
 		 162 aa  140  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47530  hypothetical protein  54.36 
 
 		 149 aa  140  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0053  hypothetical protein  48.67 
 
 		 158 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5999  hypothetical protein  51.91 
 
 		 159 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69350  hypothetical protein  44.94 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3137  hypothetical protein  46.3 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.46555  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4729  hypothetical protein  38.68 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2273  hypothetical protein  41.75 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131993  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0715  hypothetical protein  34.26 
 
 		 181 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7537  hypothetical protein  36.94 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1307  hypothetical protein  40.21 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1885  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4933  hypothetical protein  35.29 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0909  hypothetical protein  39.09 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0545261 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1092  hypothetical protein  36.5 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347644  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4701  hypothetical protein  32.46 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.182755  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2768  hypothetical protein  40 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3713  hypothetical protein  35.29 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.767201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2729  hypothetical protein  39.42 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0746343  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0297  hypothetical protein  31.68 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0902  hypothetical protein  36.7 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0135492  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0472  hypothetical protein  40.28 
 
 		 180 aa  47.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3302  hypothetical protein  33.67 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.970623  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3883  hypothetical protein  37.97 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.086934  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4002  hypothetical protein  30.56 
 
 		 198 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.186831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>