29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0137 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0137  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  323  7e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0053  hypothetical protein  77.64 
 
 		 158 aa  249  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0195  hypothetical protein  47.5 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0216  hypothetical protein  46.88 
 
 		 159 aa  140  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.851915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0219  hypothetical protein  45.62 
 
 		 160 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0264  hypothetical protein  47.4 
 
 		 160 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5479  hypothetical protein  47.4 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47530  hypothetical protein  47.74 
 
 		 149 aa  131  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0288  hypothetical protein  47.02 
 
 		 147 aa  130  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5999  hypothetical protein  47.33 
 
 		 159 aa  120  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69350  hypothetical protein  43.14 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4729  hypothetical protein  37.62 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3137  hypothetical protein  34.4 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.46555  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7537  hypothetical protein  33.07 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2273  hypothetical protein  39.39 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131993  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3713  hypothetical protein  33.87 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.767201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0909  hypothetical protein  37.21 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0545261 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4701  hypothetical protein  34.48 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.182755  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4933  hypothetical protein  40.19 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1307  hypothetical protein  38.14 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1885  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2729  hypothetical protein  37.86 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0746343  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1092  hypothetical protein  34.38 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347644  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0297  hypothetical protein  34.31 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3302  hypothetical protein  34.69 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.970623  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0715  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  48.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3883  hypothetical protein  31.67 
 
 		 167 aa  47.8  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.086934  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2768  hypothetical protein  35.21 
 
 		 189 aa  47.4  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3590  hypothetical protein  28.69 
 
 		 165 aa  44.3  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000185848  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0902  hypothetical protein  31.19 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0135492  normal  0.076763 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>