22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4002 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4002  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.186831 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7537  hypothetical protein  33.57 
 
 		 173 aa  84.7  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0902  hypothetical protein  34.75 
 
 		 170 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0135492  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4729  hypothetical protein  36.17 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4701  hypothetical protein  30.57 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.182755  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0909  hypothetical protein  30 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0545261 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4933  hypothetical protein  28.23 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69350  hypothetical protein  37.27 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3137  hypothetical protein  32.08 
 
 		 171 aa  52  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.46555  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5999  hypothetical protein  35.45 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47530  hypothetical protein  33.1 
 
 		 149 aa  49.3  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0715  hypothetical protein  30.91 
 
 		 181 aa  48.1  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0264  hypothetical protein  29.63 
 
 		 160 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0288  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3883  hypothetical protein  31.48 
 
 		 167 aa  46.2  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.086934  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2768  hypothetical protein  33.62 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0195  hypothetical protein  31.48 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0219  hypothetical protein  30 
 
 		 160 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0862  hypothetical protein  30 
 
 		 153 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0898  hypothetical protein  29.69 
 
 		 153 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0216  hypothetical protein  30.56 
 
 		 159 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.851915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0885  hypothetical protein  29.23 
 
 		 153 aa  41.2  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>