31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0219 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0219  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  308  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0216  hypothetical protein  85.99 
 
 		 159 aa  259  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.851915  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0195  hypothetical protein  86.62 
 
 		 159 aa  258  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0264  hypothetical protein  71.7 
 
 		 160 aa  226  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5479  hypothetical protein  54.9 
 
 		 153 aa  153  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0288  hypothetical protein  62.7 
 
 		 147 aa  150  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47530  hypothetical protein  53.69 
 
 		 149 aa  140  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0053  hypothetical protein  47.37 
 
 		 158 aa  140  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0137  hypothetical protein  45.62 
 
 		 162 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5999  hypothetical protein  54.2 
 
 		 159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69350  hypothetical protein  46.2 
 
 		 159 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3137  hypothetical protein  49.07 
 
 		 171 aa  88.6  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.46555  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4729  hypothetical protein  40.57 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0715  hypothetical protein  33.78 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2273  hypothetical protein  44.23 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131993  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1092  hypothetical protein  39.86 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347644  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1307  hypothetical protein  42.27 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1885  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0909  hypothetical protein  40.71 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0545261 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4701  hypothetical protein  34.21 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.182755  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2729  hypothetical protein  43.81 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0746343  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4933  hypothetical protein  35.9 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7537  hypothetical protein  35.45 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3713  hypothetical protein  37.25 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.767201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0472  hypothetical protein  38.89 
 
 		 180 aa  52.4  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2768  hypothetical protein  39.81 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3883  hypothetical protein  40.51 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.086934  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0297  hypothetical protein  30.69 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0902  hypothetical protein  34.23 
 
 		 170 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0135492  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3302  hypothetical protein  34 
 
 		 159 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.970623  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3590  hypothetical protein  27.04 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000185848  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4002  hypothetical protein  30 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.186831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>