32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_69350 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_69350  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  311  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5999  hypothetical protein  81.13 
 
 
159 aa  246  7e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0219  hypothetical protein  46.2 
 
 
160 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0195  hypothetical protein  46.2 
 
 
159 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41313  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47530  hypothetical protein  53.79 
 
 
149 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0216  hypothetical protein  44.94 
 
 
159 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.851915  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0288  hypothetical protein  54.39 
 
 
147 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0264  hypothetical protein  43.67 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0137  hypothetical protein  43.14 
 
 
162 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0053  hypothetical protein  44 
 
 
158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5479  hypothetical protein  41.56 
 
 
153 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3137  hypothetical protein  39.69 
 
 
171 aa  77  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.46555  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7537  hypothetical protein  31.39 
 
 
173 aa  70.9  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4729  hypothetical protein  45.28 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2729  hypothetical protein  46.6 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0746343  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4933  hypothetical protein  39.81 
 
 
186 aa  64.3  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361826  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3713  hypothetical protein  38.24 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.767201  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1307  hypothetical protein  39.8 
 
 
163 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1885  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2273  hypothetical protein  43.64 
 
 
185 aa  60.1  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131993  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4002  hypothetical protein  37.27 
 
 
198 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.186831 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0715  hypothetical protein  34.82 
 
 
181 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1092  hypothetical protein  34.26 
 
 
165 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347644  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0909  hypothetical protein  36.7 
 
 
153 aa  54.7  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0545261 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3590  hypothetical protein  29.66 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000185848  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3302  hypothetical protein  36.08 
 
 
159 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.970623  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3883  hypothetical protein  30.99 
 
 
167 aa  50.8  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.086934  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4701  hypothetical protein  32.77 
 
 
171 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.182755  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0902  hypothetical protein  37.27 
 
 
170 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0135492  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2768  hypothetical protein  38.3 
 
 
189 aa  47.4  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0297  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2997  hypothetical protein  34.95 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0472  hypothetical protein  34.78 
 
 
180 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>