34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4729 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4729  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  300  5.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1307  hypothetical protein  58.23 
 
 
163 aa  130  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1885  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3302  hypothetical protein  54.43 
 
 
159 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.970623  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1092  hypothetical protein  41.94 
 
 
165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347644  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3713  hypothetical protein  37.72 
 
 
158 aa  86.3  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.767201  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4701  hypothetical protein  38.26 
 
 
171 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.182755  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5999  hypothetical protein  47.41 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0264  hypothetical protein  42.24 
 
 
160 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4933  hypothetical protein  46.15 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361826  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2729  hypothetical protein  47.17 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0746343  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0288  hypothetical protein  44.72 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3137  hypothetical protein  41.9 
 
 
171 aa  74.3  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.46555  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0909  hypothetical protein  43.64 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0545261 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2273  hypothetical protein  38.93 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131993  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0219  hypothetical protein  40.35 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69350  hypothetical protein  43.97 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0053  hypothetical protein  38.61 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7537  hypothetical protein  38.18 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0715  hypothetical protein  38.35 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47530  hypothetical protein  45 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0195  hypothetical protein  40.35 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41313  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0137  hypothetical protein  37.38 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0216  hypothetical protein  38.6 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.851915  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5479  hypothetical protein  38.31 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2768  hypothetical protein  41.73 
 
 
189 aa  64.3  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4002  hypothetical protein  32.58 
 
 
198 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.186831 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3883  hypothetical protein  31.3 
 
 
167 aa  60.5  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.086934  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0902  hypothetical protein  38.39 
 
 
170 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0135492  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0677  hypothetical protein  30.34 
 
 
145 aa  55.1  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0297  hypothetical protein  23.24 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3590  hypothetical protein  26.61 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000185848  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0472  hypothetical protein  35.9 
 
 
180 aa  44.3  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3862  hypothetical protein  26.14 
 
 
145 aa  41.2  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00071  hypothetical protein  27.86 
 
 
159 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>