18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0472 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0472  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  365  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3137  hypothetical protein  37.5 
 
 
171 aa  55.1  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.46555  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0219  hypothetical protein  37.74 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0264  hypothetical protein  39 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2273  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  52.8  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131993  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0195  hypothetical protein  38 
 
 
159 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41313  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3713  hypothetical protein  31.15 
 
 
158 aa  49.3  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.767201  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0216  hypothetical protein  35 
 
 
159 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.851915  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1092  hypothetical protein  31.51 
 
 
165 aa  48.1  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347644  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47530  hypothetical protein  38 
 
 
149 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0909  hypothetical protein  31.1 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0545261 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4729  hypothetical protein  35.24 
 
 
155 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69350  hypothetical protein  35.58 
 
 
159 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5999  hypothetical protein  33.88 
 
 
159 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1307  hypothetical protein  35.64 
 
 
163 aa  42.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1885  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0288  hypothetical protein  33.01 
 
 
147 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0053  hypothetical protein  30.25 
 
 
158 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0715  hypothetical protein  25 
 
 
181 aa  41.2  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>