30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0053 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0053  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  318  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0137  hypothetical protein  77.64 
 
 		 162 aa  249  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5479  hypothetical protein  50.67 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0195  hypothetical protein  50 
 
 		 159 aa  140  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0264  hypothetical protein  47.33 
 
 		 160 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0219  hypothetical protein  47.37 
 
 		 160 aa  140  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0216  hypothetical protein  48.67 
 
 		 159 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.851915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0288  hypothetical protein  48.67 
 
 		 147 aa  134  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47530  hypothetical protein  49.01 
 
 		 149 aa  130  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5999  hypothetical protein  44.1 
 
 		 159 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69350  hypothetical protein  44 
 
 		 159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4729  hypothetical protein  38.61 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0909  hypothetical protein  37.5 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0545261 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3137  hypothetical protein  37.01 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.46555  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4933  hypothetical protein  36.69 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3713  hypothetical protein  34.82 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.767201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3302  hypothetical protein  37.76 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.970623  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7537  hypothetical protein  31.5 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1307  hypothetical protein  39.18 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1885  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1092  hypothetical protein  32.79 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347644  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4701  hypothetical protein  36.84 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.182755  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2273  hypothetical protein  38.52 
 
 		 185 aa  53.9  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131993  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0902  hypothetical protein  32.47 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0135492  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2729  hypothetical protein  36.89 
 
 		 187 aa  52.4  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0746343  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0715  hypothetical protein  30.77 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0297  hypothetical protein  36.99 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2768  hypothetical protein  32.81 
 
 		 189 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3883  hypothetical protein  31.78 
 
 		 167 aa  48.1  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.086934  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3590  hypothetical protein  35.43 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000185848  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0472  hypothetical protein  32.43 
 
 		 180 aa  41.2  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>