37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0297 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0297  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  321  3e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2187  hypothetical protein  42.55 
 
 		 161 aa  97.4  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.45701  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00071  hypothetical protein  42.03 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002283  hypothetical protein  39.86 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.715737  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0677  hypothetical protein  36.13 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3713  hypothetical protein  27.19 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.767201  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0137  hypothetical protein  34.31 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03979  hypothetical protein  32.43 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2997  hypothetical protein  32.81 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4729  hypothetical protein  23.24 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0219  hypothetical protein  30.69 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0216  hypothetical protein  31.68 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.851915  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0195  hypothetical protein  30.69 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0592  hypothetical protein  33.93 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.321076 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3883  hypothetical protein  35.8 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.086934  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0053  hypothetical protein  36.99 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3302  hypothetical protein  42.86 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.970623  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3477  hypothetical protein  32.48 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3862  hypothetical protein  34.09 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0264  hypothetical protein  28.43 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3179  hypothetical protein  32.71 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0898  hypothetical protein  31.62 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69350  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0885  hypothetical protein  31.62 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0862  hypothetical protein  31.62 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3285  hypothetical protein  35.96 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5999  hypothetical protein  28.7 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5479  hypothetical protein  30.77 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1307  hypothetical protein  38.1 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1885  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3282  hypothetical protein  31.3 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2273  hypothetical protein  25 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131993  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0884  hypothetical protein  34.11 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0740  hypothetical protein  31.3 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3137  hypothetical protein  40.91 
 
 		 171 aa  42.4  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.46555  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47530  hypothetical protein  32.05 
 
 		 149 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3590  hypothetical protein  32.14 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000185848  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3394  hypothetical protein  30.53 
 
 		 153 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>