21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3590 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3590  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  328  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000185848  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3713  hypothetical protein  27.62 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.767201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69350  hypothetical protein  29.66 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0909  hypothetical protein  29.93 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0545261 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5999  hypothetical protein  31.03 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1092  hypothetical protein  34.72 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347644  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0053  hypothetical protein  35.43 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0715  hypothetical protein  25.47 
 
 		 181 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0219  hypothetical protein  27.04 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7537  hypothetical protein  24.67 
 
 		 173 aa  45.1  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4729  hypothetical protein  27.18 
 
 		 155 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0137  hypothetical protein  28.69 
 
 		 162 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0902  hypothetical protein  29.49 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0135492  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3302  hypothetical protein  31.17 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.970623  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3137  hypothetical protein  30.38 
 
 		 171 aa  42.4  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.46555  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5479  hypothetical protein  26.06 
 
 		 153 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0288  hypothetical protein  27.7 
 
 		 147 aa  42  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0297  hypothetical protein  32.14 
 
 		 160 aa  41.2  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4701  hypothetical protein  26.23 
 
 		 171 aa  40.8  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.182755  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1307  hypothetical protein  28.71 
 
 		 163 aa  40.8  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1885  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3883  hypothetical protein  39.06 
 
 		 167 aa  40.8  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.086934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>