23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0592 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0592  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  298  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.321076 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0677  hypothetical protein  54.86 
 
 		 145 aa  157  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3862  hypothetical protein  56.25 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3285  hypothetical protein  44.76 
 
 		 163 aa  120  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2997  hypothetical protein  48.87 
 
 		 148 aa  120  9e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3179  hypothetical protein  46.15 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3477  hypothetical protein  47.95 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0862  hypothetical protein  47.48 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3502  hypothetical protein  51.32 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0885  hypothetical protein  46.76 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0898  hypothetical protein  46.43 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3282  hypothetical protein  40.67 
 
 		 153 aa  94.4  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0740  hypothetical protein  40.67 
 
 		 153 aa  94  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3394  hypothetical protein  40.67 
 
 		 153 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3118  hypothetical protein  42 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0884  hypothetical protein  40.6 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00071  hypothetical protein  42.68 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0297  hypothetical protein  33.93 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2187  hypothetical protein  37.36 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.45701  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7537  hypothetical protein  28.57 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002283  hypothetical protein  37.36 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.715737  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3713  hypothetical protein  30.97 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.767201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3137  hypothetical protein  32.69 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.46555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>