24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0677 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0677  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  289  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3862  hypothetical protein  70.34 
 
 
145 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0592  hypothetical protein  54.86 
 
 
149 aa  157  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.321076 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2997  hypothetical protein  48.85 
 
 
148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0885  hypothetical protein  47.37 
 
 
153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0898  hypothetical protein  45.33 
 
 
153 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0862  hypothetical protein  46.71 
 
 
153 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3477  hypothetical protein  47.37 
 
 
153 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3502  hypothetical protein  50 
 
 
157 aa  121  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3179  hypothetical protein  44.36 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3285  hypothetical protein  44.9 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3118  hypothetical protein  41.33 
 
 
164 aa  100  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3282  hypothetical protein  41.67 
 
 
153 aa  97.8  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0740  hypothetical protein  41.67 
 
 
153 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3394  hypothetical protein  41.67 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0884  hypothetical protein  41.67 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0297  hypothetical protein  36.13 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4729  hypothetical protein  30.34 
 
 
155 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2187  hypothetical protein  37.74 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.45701  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00071  hypothetical protein  33.62 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7537  hypothetical protein  25.86 
 
 
173 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002283  hypothetical protein  32.48 
 
 
162 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.715737  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3713  hypothetical protein  26.56 
 
 
158 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.767201  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3137  hypothetical protein  33.72 
 
 
171 aa  40.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.46555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>