21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3502 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3502  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  309  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0677  hypothetical protein  50 
 
 
145 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0592  hypothetical protein  51.32 
 
 
149 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.321076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3862  hypothetical protein  51.3 
 
 
145 aa  134  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3285  hypothetical protein  43.97 
 
 
163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2997  hypothetical protein  45.19 
 
 
148 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3179  hypothetical protein  39.72 
 
 
147 aa  97.1  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0862  hypothetical protein  40.67 
 
 
153 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0885  hypothetical protein  38.93 
 
 
153 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0898  hypothetical protein  40 
 
 
153 aa  95.1  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3477  hypothetical protein  38.93 
 
 
153 aa  94  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3394  hypothetical protein  43.67 
 
 
153 aa  93.6  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3282  hypothetical protein  43.67 
 
 
153 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0740  hypothetical protein  43.67 
 
 
153 aa  90.5  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3118  hypothetical protein  42.04 
 
 
164 aa  87  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0884  hypothetical protein  44.29 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0297  hypothetical protein  39.64 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2187  hypothetical protein  41.05 
 
 
161 aa  48.1  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.45701  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00071  hypothetical protein  36.17 
 
 
159 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002283  hypothetical protein  36.17 
 
 
162 aa  45.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.715737  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5479  hypothetical protein  34.29 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>