20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3282 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3282  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  315  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0740  hypothetical protein  99.35 
 
 		 153 aa  313  7e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3394  hypothetical protein  96.73 
 
 		 153 aa  285  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0898  hypothetical protein  73.2 
 
 		 153 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3477  hypothetical protein  73.2 
 
 		 153 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0884  hypothetical protein  92.7 
 
 		 137 aa  236  8e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0862  hypothetical protein  72.55 
 
 		 153 aa  235  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0885  hypothetical protein  71.9 
 
 		 153 aa  234  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3118  hypothetical protein  74.51 
 
 		 164 aa  214  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2997  hypothetical protein  51.13 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3285  hypothetical protein  46.81 
 
 		 163 aa  120  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0592  hypothetical protein  44 
 
 		 149 aa  110  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.321076 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0677  hypothetical protein  40.97 
 
 		 145 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3179  hypothetical protein  43.38 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3862  hypothetical protein  43.24 
 
 		 145 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3502  hypothetical protein  43.67 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0297  hypothetical protein  31.3 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00071  hypothetical protein  33.62 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002283  hypothetical protein  32.76 
 
 		 162 aa  50.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.715737  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2187  hypothetical protein  31.67 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.45701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>