19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0884 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0884  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  279  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3282  hypothetical protein  92.7 
 
 		 153 aa  236  8e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0740  hypothetical protein  91.97 
 
 		 153 aa  234  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3394  hypothetical protein  90.51 
 
 		 153 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3477  hypothetical protein  75.18 
 
 		 153 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0862  hypothetical protein  75.18 
 
 		 153 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0898  hypothetical protein  75.18 
 
 		 153 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0885  hypothetical protein  74.45 
 
 		 153 aa  210  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3118  hypothetical protein  76.64 
 
 		 164 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2997  hypothetical protein  51.61 
 
 		 148 aa  110  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3285  hypothetical protein  43.57 
 
 		 163 aa  105  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3179  hypothetical protein  43.31 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3862  hypothetical protein  45.04 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0677  hypothetical protein  40.91 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0592  hypothetical protein  44.36 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.321076 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3502  hypothetical protein  44.29 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0297  hypothetical protein  34.11 
 
 		 160 aa  53.5  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00071  hypothetical protein  36.63 
 
 		 159 aa  51.6  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002283  hypothetical protein  34.65 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.715737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>