20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002283 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002283  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  332  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.715737  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00071  hypothetical protein  88.68 
 
 		 159 aa  286  8e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2187  hypothetical protein  66.04 
 
 		 161 aa  203  8e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.45701  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0297  hypothetical protein  39.86 
 
 		 160 aa  93.2  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3179  hypothetical protein  37.27 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0862  hypothetical protein  33.62 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0885  hypothetical protein  33.62 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3285  hypothetical protein  34 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0898  hypothetical protein  32.76 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3477  hypothetical protein  32.76 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0592  hypothetical protein  37.36 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.321076 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3713  hypothetical protein  29.46 
 
 		 158 aa  52  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.767201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0677  hypothetical protein  32.48 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2997  hypothetical protein  32.23 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4729  hypothetical protein  27.45 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0740  hypothetical protein  31.9 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3394  hypothetical protein  31.9 
 
 		 153 aa  44.7  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3282  hypothetical protein  32.76 
 
 		 153 aa  44.7  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0884  hypothetical protein  34.65 
 
 		 137 aa  44.7  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3302  hypothetical protein  43.59 
 
 		 159 aa  40.8  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.970623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>