17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2187 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2187  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  327  5.0000000000000004e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.45701  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002283  hypothetical protein  66.04 
 
 		 162 aa  203  7e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.715737  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00071  hypothetical protein  63.52 
 
 		 159 aa  193  8.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0297  hypothetical protein  42.55 
 
 		 160 aa  103  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3179  hypothetical protein  36.43 
 
 		 147 aa  67  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0677  hypothetical protein  37.74 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3285  hypothetical protein  34.58 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0898  hypothetical protein  32.35 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0862  hypothetical protein  32.35 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2997  hypothetical protein  35.78 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0592  hypothetical protein  37.36 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.321076 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0885  hypothetical protein  32.35 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3477  hypothetical protein  31.62 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3713  hypothetical protein  28.46 
 
 		 158 aa  51.6  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.767201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3862  hypothetical protein  36.7 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4729  hypothetical protein  28.97 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03979  hypothetical protein  28.7 
 
 		 167 aa  40.4  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>