21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3285 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3285  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  335  9.999999999999999e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3179  hypothetical protein  59.21 
 
 		 147 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2997  hypothetical protein  44 
 
 		 148 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0592  hypothetical protein  44.76 
 
 		 149 aa  120  8e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.321076 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3477  hypothetical protein  45.77 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0677  hypothetical protein  44.9 
 
 		 145 aa  115  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0898  hypothetical protein  44.44 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0862  hypothetical protein  45.07 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0885  hypothetical protein  45.07 
 
 		 153 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3118  hypothetical protein  46.26 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3282  hypothetical protein  46.81 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3394  hypothetical protein  46.81 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0740  hypothetical protein  47.83 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3862  hypothetical protein  41.5 
 
 		 145 aa  97.1  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0884  hypothetical protein  43.57 
 
 		 137 aa  89.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3502  hypothetical protein  42.86 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00071  hypothetical protein  38 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002283  hypothetical protein  34 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.715737  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2187  hypothetical protein  34.58 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.45701  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0297  hypothetical protein  35.96 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3713  hypothetical protein  31.25 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.767201  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>