18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3118 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3118  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  337  5e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0862  hypothetical protein  71.14 
 
 
153 aa  227  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0898  hypothetical protein  71.14 
 
 
153 aa  226  7e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0885  hypothetical protein  70.47 
 
 
153 aa  226  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3477  hypothetical protein  69.8 
 
 
153 aa  224  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3282  hypothetical protein  74.51 
 
 
153 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0740  hypothetical protein  74.51 
 
 
153 aa  214  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3394  hypothetical protein  73.86 
 
 
153 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0884  hypothetical protein  76.64 
 
 
137 aa  187  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2997  hypothetical protein  52.59 
 
 
148 aa  122  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3285  hypothetical protein  46.26 
 
 
163 aa  120  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3179  hypothetical protein  44 
 
 
147 aa  117  6e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0677  hypothetical protein  41.1 
 
 
145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0592  hypothetical protein  43.05 
 
 
149 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.321076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3862  hypothetical protein  43.45 
 
 
145 aa  101  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3502  hypothetical protein  42.86 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0297  hypothetical protein  34.69 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0063  arylsulfate sulfotransferase  35.8 
 
 
589 aa  40.4  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>