24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3862 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3862  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  292  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0677  hypothetical protein  70.34 
 
 		 145 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0592  hypothetical protein  56.25 
 
 		 149 aa  163  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.321076 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0885  hypothetical protein  51.06 
 
 		 153 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0898  hypothetical protein  48.94 
 
 		 153 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2997  hypothetical protein  48.12 
 
 		 148 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3477  hypothetical protein  50.35 
 
 		 153 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0862  hypothetical protein  49.65 
 
 		 153 aa  127  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3502  hypothetical protein  51.3 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3179  hypothetical protein  42.75 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3285  hypothetical protein  41.5 
 
 		 163 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3282  hypothetical protein  43.24 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3394  hypothetical protein  43.24 
 
 		 153 aa  103  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0740  hypothetical protein  42.57 
 
 		 153 aa  102  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3118  hypothetical protein  44.14 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0884  hypothetical protein  45.04 
 
 		 137 aa  96.7  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0297  hypothetical protein  34.09 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2187  hypothetical protein  36.7 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.45701  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4729  hypothetical protein  25.26 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3713  hypothetical protein  36.92 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.767201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7537  hypothetical protein  27.59 
 
 		 173 aa  47  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00071  hypothetical protein  37.35 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002283  hypothetical protein  33.7 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.715737  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0909  hypothetical protein  25 
 
 		 153 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0545261 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>