More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3158 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3158  aconitate hydratase domain-containing protein  100 
 
 		 174 aa  358  3e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000105863  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1905  isopropylmalate isomerase subunit  58.96 
 
 		 176 aa  210  7e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000126275  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0623  aconitate hydratase domain-containing protein  58.29 
 
 		 175 aa  208  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1927  aconitate hydratase domain-containing protein  58.29 
 
 		 175 aa  208  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.771156  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2736  aconitate hydratase domain protein  56.57 
 
 		 175 aa  207  8e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000388405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1505  aconitate hydratase domain protein  56.57 
 
 		 175 aa  206  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.599997 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3166  aconitate hydratase domain protein  55.11 
 
 		 175 aa  205  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00446541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1269  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  55.43 
 
 		 175 aa  203  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0316378  hitchhiker  0.00000000000877692 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1902  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit, putative  56.82 
 
 		 175 aa  201  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3708  aconitate hydratase domain-containing protein  54.29 
 
 		 175 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000223492  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4368  isopropylmalate isomerase small subunit  34.46 
 
 		 217 aa  101  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3609  isopropylmalate isomerase small subunit  35.75 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1246  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  34.36 
 
 		 212 aa  100  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3040  isopropylmalate isomerase small subunit  35.03 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1718  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  33.9 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3610  isopropylmalate isomerase small subunit  35.88 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.607492  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3798  isopropylmalate isomerase small subunit  35.29 
 
 		 200 aa  99.4  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2585  isopropylmalate isomerase small subunit  33.9 
 
 		 216 aa  99  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3232  isopropylmalate isomerase small subunit  33.9 
 
 		 216 aa  99  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1222  isopropylmalate isomerase small subunit  33.89 
 
 		 217 aa  98.6  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.489719  normal  0.012692 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3271  isopropylmalate isomerase small subunit  37.75 
 
 		 208 aa  98.6  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0796  isopropylmalate isomerase small subunit  36.05 
 
 		 214 aa  98.2  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.030547  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0619  isopropylmalate isomerase small subunit  36.47 
 
 		 201 aa  98.2  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  35.88 
 
 		 200 aa  97.8  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1935  isopropylmalate isomerase small subunit  35.39 
 
 		 216 aa  97.4  8e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.217033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1048  isopropylmalate isomerase small subunit  35.96 
 
 		 216 aa  97.4  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1851  isopropylmalate isomerase small subunit  34.05 
 
 		 216 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30576  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1727  isopropylmalate isomerase small subunit  34.05 
 
 		 216 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1921  isopropylmalate isomerase small subunit  35.4 
 
 		 212 aa  97.1  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.691189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0776  isopropylmalate isomerase small subunit  34.05 
 
 		 216 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0211151  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1642  isopropylmalate isomerase small subunit  34.05 
 
 		 216 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.865269  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2452  isopropylmalate isomerase small subunit  34.05 
 
 		 216 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0522  isopropylmalate isomerase small subunit  34.05 
 
 		 216 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503105  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0365  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  41.72 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2314  isopropylmalate isomerase small subunit  34.05 
 
 		 216 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0382  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  41.72 
 
 		 164 aa  96.7  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4211  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  34.92 
 
 		 198 aa  96.7  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1676  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  32.97 
 
 		 215 aa  96.3  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3846  isopropylmalate isomerase small subunit  34.05 
 
 		 216 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.817461 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  32.83 
 
 		 216 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2888  isopropylmalate isomerase small subunit  35.14 
 
 		 217 aa  96.7  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6848  isopropylmalate isomerase small subunit  33.51 
 
 		 217 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0246289  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0591  isopropylmalate isomerase small subunit  39.29 
 
 		 200 aa  96.3  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3342  isopropylmalate isomerase small subunit  34.05 
 
 		 216 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0629  isopropylmalate isomerase small subunit  35.29 
 
 		 200 aa  96.7  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3577  isopropylmalate isomerase small subunit  34.59 
 
 		 216 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0126  isopropylmalate isomerase small subunit  35.88 
 
 		 201 aa  95.5  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  0.029238 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4416  isopropylmalate isomerase small subunit  34.59 
 
 		 216 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3951  isopropylmalate isomerase small subunit  34.59 
 
 		 216 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1013  isopropylmalate isomerase small subunit  34.54 
 
 		 214 aa  95.1  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  32.32 
 
 		 216 aa  95.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1412  isopropylmalate isomerase small subunit  35.2 
 
 		 216 aa  94.7  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162707  normal  0.547785 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0126  isopropylmalate isomerase small subunit  35.29 
 
 		 201 aa  94.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0673  isopropylmalate isomerase small subunit  34.05 
 
 		 216 aa  95.1  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000646407  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0076  isopropylmalate isomerase small subunit  34.71 
 
 		 201 aa  94.7  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001659  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  35.88 
 
 		 200 aa  95.1  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0119  isopropylmalate isomerase small subunit  35.29 
 
 		 201 aa  94.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0121  isopropylmalate isomerase small subunit  35.29 
 
 		 201 aa  94.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886111  normal  0.157977 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  33.83 
 
 		 216 aa  94.7  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1573  isopropylmalate isomerase small subunit  35.2 
 
 		 216 aa  94.7  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.292006  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00073  isopropylmalate isomerase small subunit  34.71 
 
 		 201 aa  94.4  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3527  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  34.71 
 
 		 201 aa  94.4  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0074  isopropylmalate isomerase small subunit  34.71 
 
 		 201 aa  94.4  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0065  isopropylmalate isomerase small subunit  34.71 
 
 		 201 aa  94.4  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3586  isopropylmalate isomerase small subunit  34.71 
 
 		 201 aa  94.4  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00072  hypothetical protein  34.71 
 
 		 201 aa  94.4  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0076  isopropylmalate isomerase small subunit  34.71 
 
 		 201 aa  94.4  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0078  isopropylmalate isomerase small subunit  34.71 
 
 		 201 aa  94.4  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0584  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.14 
 
 		 165 aa  94.4  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00990382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00814  isopropylmalate isomerase small subunit  35.29 
 
 		 200 aa  94.4  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0122  isopropylmalate isomerase small subunit  34.71 
 
 		 201 aa  94.4  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14126  normal  0.46492 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2132  isopropylmalate isomerase small subunit  34.05 
 
 		 216 aa  94  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0198572 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1564  isopropylmalate isomerase small subunit  34.71 
 
 		 215 aa  94  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126411  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1446  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  33.71 
 
 		 215 aa  93.6  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00452839  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1382  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  33.71 
 
 		 215 aa  93.6  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  0.419844 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34270  3-isopropylmalate dehydratase small subunit , LeuD  40.15 
 
 		 215 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2064  isopropylmalate isomerase small subunit  35.1 
 
 		 212 aa  92.8  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1421  isopropylmalate isomerase small subunit  35.53 
 
 		 216 aa  92.8  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0863  isopropylmalate isomerase small subunit  33.7 
 
 		 212 aa  93.2  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000359889  hitchhiker  0.000927879 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5237  isopropylmalate isomerase small subunit  33.33 
 
 		 217 aa  93.2  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2486  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  39.38 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2452  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  35.44 
 
 		 215 aa  93.2  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.162518  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3069  isopropylmalate isomerase small subunit  37.04 
 
 		 212 aa  92.4  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2312  isopropylmalate isomerase small subunit  36 
 
 		 216 aa  91.7  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.845153  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1890  isopropylmalate isomerase small subunit  35.58 
 
 		 214 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2473  isopropylmalate isomerase small subunit  35.15 
 
 		 216 aa  92  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0929979  normal  0.412419 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4709  isopropylmalate isomerase small subunit  37.41 
 
 		 192 aa  92  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0228  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  36.97 
 
 		 163 aa  91.7  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1919  isopropylmalate isomerase small subunit  37.96 
 
 		 212 aa  91.7  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1794  isopropylmalate isomerase small subunit  32.96 
 
 		 216 aa  91.7  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0337  isopropylmalate isomerase small subunit  35.93 
 
 		 201 aa  91.7  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0195  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  39.34 
 
 		 197 aa  91.7  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3817  isopropylmalate isomerase small subunit  34.36 
 
 		 201 aa  91.7  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23760  isopropylmalate isomerase small subunit  35.62 
 
 		 212 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177244 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02612  isopropylmalate isomerase small subunit  36.3 
 
 		 215 aa  91.3  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1811  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  34.42 
 
 		 240 aa  90.9  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.382373  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0374  isopropylmalate isomerase small subunit  36.13 
 
 		 200 aa  90.9  9e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1173  isopropylmalate isomerase small subunit  38.69 
 
 		 202 aa  90.5  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.981045  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2521  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  34.03 
 
 		 210 aa  90.1  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0949356 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2163  isopropylmalate isomerase small subunit  33.9 
 
 		 216 aa  90.5  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>