More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1973 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1973  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 576 aa  1177    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  39.66 
 
 		 571 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  40.42 
 
 		 572 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  40.42 
 
 		 572 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  40.42 
 
 		 572 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  40.42 
 
 		 572 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  40.42 
 
 		 572 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  40.42 
 
 		 572 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  40.07 
 
 		 572 aa  438  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  40.24 
 
 		 572 aa  438  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  40.07 
 
 		 572 aa  437  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  39.48 
 
 		 571 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  40.07 
 
 		 572 aa  433  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  39.76 
 
 		 572 aa  431  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  37.26 
 
 		 568 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  37.26 
 
 		 568 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2597  acetyl-CoA synthetase  38.54 
 
 		 588 aa  359  8e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0867997  hitchhiker  0.000215379 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1854  AMP-dependent synthetase and ligase  39.22 
 
 		 567 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0927  acetyl-CoA synthetase  38.21 
 
 		 588 aa  347  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3600  acetyl-CoA synthetase  36.36 
 
 		 584 aa  344  2.9999999999999997e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1412  acetyl-CoA synthetase  37.5 
 
 		 587 aa  343  5e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1608  acetyl-CoA synthetase  36.52 
 
 		 584 aa  340  5e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.281409  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0511  acetyl-CoA synthetase  36.72 
 
 		 607 aa  336  5.999999999999999e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4644  acetyl-CoA synthetase  38.08 
 
 		 588 aa  334  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3568  acetyl-CoA synthetase  38.08 
 
 		 588 aa  334  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207513  normal  0.0354675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3465  AMP-dependent synthetase and ligase  36.3 
 
 		 598 aa  328  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1407  acetyl-CoA synthetase  37.21 
 
 		 598 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959258 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2174  acetyl-CoA synthetase  34.86 
 
 		 588 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0761  acetyl-CoA synthetase  35.62 
 
 		 592 aa  321  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000550868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0388  acetyl-CoA synthetase  38.15 
 
 		 602 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7028  acetyl-CoA synthetase  37.35 
 
 		 585 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.277819 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2708  acetyl-CoA synthetase  35.2 
 
 		 576 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.180648  hitchhiker  0.00000972511 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  34.75 
 
 		 632 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2340  AMP-dependent synthetase and ligase  36.54 
 
 		 539 aa  296  5e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  34.62 
 
 		 649 aa  296  6e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2783  acetate/CoA ligase  33.04 
 
 		 651 aa  295  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.943311 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  33.56 
 
 		 635 aa  294  2e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  34.14 
 
 		 629 aa  295  2e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  35.74 
 
 		 632 aa  294  3e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  34.96 
 
 		 625 aa  293  8e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  34.04 
 
 		 653 aa  291  3e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  33.17 
 
 		 629 aa  288  2e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  35.05 
 
 		 626 aa  288  2e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  32.16 
 
 		 632 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  31.79 
 
 		 631 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  32.16 
 
 		 632 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  31.98 
 
 		 631 aa  286  9e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2222  acetate--CoA ligase  31.93 
 
 		 648 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  34.27 
 
 		 650 aa  283  7.000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 654 aa  281  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1300  AMP-dependent synthetase and ligase  33.98 
 
 		 627 aa  280  7e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  32.68 
 
 		 629 aa  279  9e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2823  acetyl-coenzyme A synthetase  31.83 
 
 		 659 aa  278  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252504  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  31.52 
 
 		 643 aa  278  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  33.15 
 
 		 659 aa  277  3e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  31.9 
 
 		 631 aa  277  4e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  34.39 
 
 		 656 aa  276  5e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  33.63 
 
 		 666 aa  276  9e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  34.09 
 
 		 632 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  34.31 
 
 		 629 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  32.17 
 
 		 552 aa  274  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  34.22 
 
 		 667 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  32.89 
 
 		 670 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  33.51 
 
 		 666 aa  273  9e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  31.89 
 
 		 644 aa  272  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  33.98 
 
 		 658 aa  272  1e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3166  acetate/CoA ligase  32.28 
 
 		 648 aa  271  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  34.94 
 
 		 657 aa  271  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  32.68 
 
 		 658 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  33.58 
 
 		 658 aa  270  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  32.68 
 
 		 658 aa  269  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  30.43 
 
 		 652 aa  268  2e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  32.88 
 
 		 649 aa  268  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3955  acetyl-CoA synthetase  33.16 
 
 		 648 aa  268  2.9999999999999995e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  31.75 
 
 		 638 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  30.25 
 
 		 652 aa  267  4e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  34.33 
 
 		 652 aa  267  4e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  30.56 
 
 		 660 aa  267  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  32.11 
 
 		 552 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  35.21 
 
 		 668 aa  265  1e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  32.78 
 
 		 660 aa  265  1e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1868  acetate/CoA ligase  33.16 
 
 		 652 aa  265  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.477544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  31.96 
 
 		 639 aa  263  4e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  32.26 
 
 		 650 aa  264  4e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  31.28 
 
 		 653 aa  263  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  32.21 
 
 		 631 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  32.74 
 
 		 648 aa  263  6e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  30.21 
 
 		 652 aa  263  8e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  31.82 
 
 		 661 aa  263  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  30.54 
 
 		 660 aa  262  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  30.45 
 
 		 660 aa  262  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  32.46 
 
 		 649 aa  261  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  32.67 
 
 		 661 aa  261  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  33.72 
 
 		 664 aa  261  3e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1301  transcriptional regulator, IclR family  32.5 
 
 		 880 aa  260  4e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203526 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  32.62 
 
 		 666 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0624  acetyl-CoA synthetase  31.67 
 
 		 651 aa  260  5.0000000000000005e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0391564 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  31.91 
 
 		 650 aa  259  9e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  30.1 
 
 		 660 aa  259  1e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  32.44 
 
 		 656 aa  258  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>