128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0132 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0132  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 195 aa  402  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000437504  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  35.77 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  30.48 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3375  mutT/nudix family protein  28.66 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  29.21 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  30.47 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2624  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 221 aa  62  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 198 aa  62  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  27.98 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3249  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  28.68 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  24.02 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 		 210 aa  57.8  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3526  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  28.66 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  30.3 
 
 		 168 aa  57  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  31.06 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  30.3 
 
 		 168 aa  57  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  24.86 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0918  NUDIX hydrolase  28.92 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3592  NUDIX hydrolase  27.82 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0119  hypothetical protein  31.18 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  30.49 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  26.32 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1918  NUDIX hydrolase  26.9 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.63498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2393  NUDIX hydrolase  27.33 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.024172  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  27.87 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0521  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 254 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  26.83 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0068  NUDIX hydrolase  25.81 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.979316 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  27.33 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2950  NUDIX hydrolase  27.07 
 
 		 226 aa  52.8  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.639343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2968  NUDIX hydrolase  26.26 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  0.0271269 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  25.15 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3227  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  33.83 
 
 		 218 aa  51.6  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0110  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 225 aa  51.2  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2914  NUDIX hydrolase  25.95 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0196675  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4290  NUDIX hydrolase  32.16 
 
 		 300 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2465  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 288 aa  50.1  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316655 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  24.19 
 
 		 245 aa  50.1  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  26.38 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1651  NUDIX hydrolase  29.88 
 
 		 230 aa  48.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.295983  hitchhiker  0.00316867 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  25.9 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2890  NUDIX hydrolase  26.02 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  26.89 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  24.62 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1805  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000497318  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3159  mutT/nudix family protein  27.63 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  25.31 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  24.26 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  27.34 
 
 		 267 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1513  hypothetical protein  23.77 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  26.4 
 
 		 243 aa  46.2  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4847  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4735  NUDIX hydrolase  29.25 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0687682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  24.6 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0265  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.306188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  25.41 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 		 237 aa  45.4  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4477  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 233 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.475451  hitchhiker  0.00156335 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  24.48 
 
 		 235 aa  45.4  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0115  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 		 201 aa  45.1  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0257  NUDIX hydrolase  29.07 
 
 		 246 aa  45.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0421  NUDIX hydrolase  29.23 
 
 		 233 aa  45.4  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218959  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  25.3 
 
 		 191 aa  45.1  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0279  NUDIX hydrolase  30.38 
 
 		 196 aa  45.1  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.113972  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  22.09 
 
 		 231 aa  44.7  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  27.88 
 
 		 192 aa  44.7  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  28.23 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16300  NTP pyrophosphohydrolase  30.3 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0533  NUDIX hydrolase  27.56 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0466336  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1470  hypothetical protein  22.95 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 225 aa  43.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2649  NUDIX hydrolase  26.32 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0213367  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1916  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000191981  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  28.23 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1949  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112365  normal  0.784908 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49040  predicted protein  25.71 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00913566  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2377  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000154779  normal  0.335752 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>