More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4587 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4587  peptidase M24  100 
 
 
590 aa  1222    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000648735  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0866  M24 family metallopeptidase  53.37 
 
 
591 aa  653    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23062  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0854  M24 family metallopeptidase  53.48 
 
 
591 aa  668    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.701483  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1210  M24 family peptidase  45.5 
 
 
595 aa  529  1e-149  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.472186 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003662  Xaa-Pro aminopeptidase  43.74 
 
 
598 aa  521  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2717  peptidase M24  44.46 
 
 
604 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1482  peptidase, M24 family protein  44.05 
 
 
585 aa  502  1e-141  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00151346  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1045  peptidase M24  40.82 
 
 
589 aa  501  1e-140  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.472357  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0440  putative Xaa-Pro aminopeptidase  43.37 
 
 
604 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3518  peptidase M24  43.12 
 
 
604 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.517955  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2273  peptidase M24  43.14 
 
 
605 aa  489  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000600713 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0418  peptidase M24  42.52 
 
 
604 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4014  Xaa-Pro aminopeptidase  42.52 
 
 
591 aa  490  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0671  peptidase, M24 family protein  43.2 
 
 
604 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3585  M24 family metallopeptidase  43.2 
 
 
604 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519065  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0507  peptidase, M24 family protein  43.2 
 
 
604 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660051  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3598  peptidase, M24 family protein  43.2 
 
 
604 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.979645  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0967  peptidase, M24 family protein  43.2 
 
 
604 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.022418  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0444  peptidase M24  42.35 
 
 
604 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.739665  normal  0.291512 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2590  peptidase M24  41.33 
 
 
604 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3609  M24 family metallopeptidase  43.2 
 
 
604 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.827614  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1938  peptidase, M24 family protein  43.2 
 
 
604 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.480402  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0514  peptidase M24  41.33 
 
 
604 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232311  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0486  peptidase M24  41.5 
 
 
604 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2927  peptidase, M24 family protein  43.2 
 
 
604 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2884  peptidase M24  41.16 
 
 
604 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.185025 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3911  peptidase M24  42.08 
 
 
602 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102431  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3219  peptidase M24  42.52 
 
 
602 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.538784  normal  0.627944 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1974  metallopeptidase protein  41.81 
 
 
605 aa  473  1e-132  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0562373  normal  0.0522977 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3601  peptidase M24  41.5 
 
 
604 aa  475  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.735851  normal  0.937642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3437  peptidase, M24 family protein  41.67 
 
 
602 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193845  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2924  peptidase M24  41.29 
 
 
605 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.579237  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2334  peptidase M24  41.74 
 
 
607 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.565369  normal  0.315472 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3435  peptidase M24  40.78 
 
 
602 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00259513  normal  0.40455 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2217  putative peptidase, M24 family protein  41.92 
 
 
605 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.50313  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0681  M24 family peptidase  41.55 
 
 
596 aa  467  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0961695  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0756  M24 family peptidase  41.22 
 
 
596 aa  462  1e-129  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1346  M24 family peptidase  41.39 
 
 
596 aa  461  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2965  peptidase M24  40.81 
 
 
606 aa  456  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2238  peptidase M24  40.85 
 
 
633 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3502  peptidase M24  41.02 
 
 
602 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0384792  normal  0.580745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1861  peptidase M24  41.53 
 
 
602 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137789  normal  0.370091 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1218  Xaa-Pro aminopeptidase  39.9 
 
 
589 aa  447  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0161  M24 family peptidase  39.86 
 
 
597 aa  429  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2033  Xaa-Pro aminopeptidase  39.86 
 
 
607 aa  428  1e-118  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11005  aminopeptidase P, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08050)  40.43 
 
 
654 aa  419  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0438  peptidase M24  39.7 
 
 
601 aa  409  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0949825  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2994  peptidase M24  39.9 
 
 
608 aa  409  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.020362 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02680  cytoplasm protein, putative  37.75 
 
 
647 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.980721  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2447  aminopeptidase P  38.98 
 
 
597 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2434  peptidase M24  39.12 
 
 
604 aa  402  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411421  normal  0.660909 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2063  peptidase M24  38.84 
 
 
612 aa  399  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.507411 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2545  peptidase M24  38.72 
 
 
599 aa  397  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2865  peptidase M24  38.54 
 
 
677 aa  395  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2990  putative metallopeptidase  37.16 
 
 
597 aa  394  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41838  predicted protein  37.62 
 
 
626 aa  392  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0141589 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52141  predicted protein  37.79 
 
 
608 aa  385  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.70287  decreased coverage  0.00225388 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00360  Xaa-Pro aminopeptidase  37.33 
 
 
596 aa  389  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1282  peptidase M24  37.77 
 
 
595 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3238  peptidase M24  37.88 
 
 
595 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.470182  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0068  putative peptidase  36.13 
 
 
592 aa  385  1e-106  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1198  peptidase M24  37.94 
 
 
595 aa  386  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1388  aminopeptidase P, putative  37.71 
 
 
601 aa  385  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3085  peptidase M24  37.54 
 
 
595 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.055146  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2807  peptidase M24  37.71 
 
 
605 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.155072  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2890  peptidase M24  37.54 
 
 
605 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0920  peptidase M24  37.29 
 
 
595 aa  383  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00313884  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2986  peptidase M24  37.71 
 
 
604 aa  385  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0936  M24 family peptidase  37.1 
 
 
607 aa  384  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.217659  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3095  peptidase M24  37.54 
 
 
595 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0887  peptidase M24  37.56 
 
 
604 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3047  peptidase M24  37.97 
 
 
595 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2855  aminopeptidase P  37.37 
 
 
615 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151191  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3250  peptidase M24  37.13 
 
 
617 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.54286  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2721  putative metallopeptidase  37.44 
 
 
618 aa  375  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0993196  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1086  peptidase M24  36.89 
 
 
601 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.466224  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0684  aminopeptidase P, putative  36.99 
 
 
599 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4033  peptidase M24  36.9 
 
 
609 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0371285  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2368  peptidase M24  36.46 
 
 
644 aa  373  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.436268  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1024  peptidase M24  37.29 
 
 
595 aa  373  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0487462 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75738  X-Pro aminopeptidase  37.3 
 
 
710 aa  371  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.511861 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2055  peptidase M24  37.75 
 
 
611 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268676  normal  0.0972871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3291  peptidase M24  37.41 
 
 
608 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2747  peptidase M24  36.8 
 
 
630 aa  371  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1096  peptidase M24  36.44 
 
 
595 aa  371  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.37425  normal  0.472019 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0952  peptidase M24  36.95 
 
 
595 aa  366  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2010  peptidase M24  36.22 
 
 
609 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.623866  normal  0.492859 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2193  peptidase M24  36.01 
 
 
605 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1758  peptidase M24  37.38 
 
 
608 aa  365  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284065  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002078  Xaa-Pro aminopeptidase  37.48 
 
 
564 aa  363  4e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1975  aminopeptidase P  37.56 
 
 
598 aa  363  7.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1994  peptidase M24  36.26 
 
 
608 aa  362  8e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6160  putative aminopeptidase P  35.48 
 
 
607 aa  361  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0482402 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2832  Xaa-Pro aminopeptidase  36.87 
 
 
628 aa  361  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.109252 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3379  peptidase M24  36.12 
 
 
609 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379289  decreased coverage  0.00212976 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4994  peptidase M24  36.66 
 
 
610 aa  361  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.651828  normal  0.317885 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2571  peptidase M24  36.47 
 
 
611 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1418  aminopeptidase P  37.4 
 
 
608 aa  358  1.9999999999999998e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.413075  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1374  aminopeptidase P  37.4 
 
 
608 aa  358  1.9999999999999998e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.993767  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0547  peptidase M24  35.03 
 
 
574 aa  355  1e-96  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.621521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>