More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3437 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_3585  M24 family metallopeptidase  60.76 
 
 		 604 aa  746    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519065  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3609  M24 family metallopeptidase  60.76 
 
 		 604 aa  746    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.827614  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2238  peptidase M24  67.11 
 
 		 633 aa  840    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0967  peptidase, M24 family protein  60.6 
 
 		 604 aa  741    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.022418  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3437  peptidase, M24 family protein  100 
 
 		 602 aa  1234    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193845  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0671  peptidase, M24 family protein  60.6 
 
 		 604 aa  741    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1938  peptidase, M24 family protein  60.6 
 
 		 604 aa  741    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.480402  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2884  peptidase M24  62.08 
 
 		 604 aa  744    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.185025 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0507  peptidase, M24 family protein  60.6 
 
 		 604 aa  741    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660051  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3219  peptidase M24  91.36 
 
 		 602 aa  1135    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.538784  normal  0.627944 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2965  peptidase M24  58.21 
 
 		 606 aa  694    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3598  peptidase, M24 family protein  60.76 
 
 		 604 aa  746    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.979645  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3911  peptidase M24  75.25 
 
 		 602 aa  939    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3601  peptidase M24  60.74 
 
 		 604 aa  734    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.735851  normal  0.937642 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3435  peptidase M24  67.77 
 
 		 602 aa  856    Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00259513  normal  0.40455 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2217  putative peptidase, M24 family protein  56.81 
 
 		 605 aa  689    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.50313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2717  peptidase M24  59.27 
 
 		 604 aa  741    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2927  peptidase, M24 family protein  61.24 
 
 		 604 aa  743    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0440  putative Xaa-Pro aminopeptidase  61.26 
 
 		 604 aa  767    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2924  peptidase M24  58.18 
 
 		 605 aa  698    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.579237  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1861  peptidase M24  67.44 
 
 		 602 aa  834    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137789  normal  0.370091 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2590  peptidase M24  60.74 
 
 		 604 aa  748    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0444  peptidase M24  61.41 
 
 		 604 aa  743    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.739665  normal  0.291512 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0418  peptidase M24  60.6 
 
 		 604 aa  741    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3518  peptidase M24  62.25 
 
 		 604 aa  772    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.517955  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3502  peptidase M24  66.45 
 
 		 602 aa  837    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0384792  normal  0.580745 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2334  peptidase M24  53.3 
 
 		 607 aa  649    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.565369  normal  0.315472 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0514  peptidase M24  60.74 
 
 		 604 aa  748    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232311  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0486  peptidase M24  60.74 
 
 		 604 aa  748    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1974  metallopeptidase protein  53.1 
 
 		 605 aa  625  1e-178  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0562373  normal  0.0522977 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2273  peptidase M24  53.17 
 
 		 605 aa  621  1e-176  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600713 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0681  M24 family peptidase  49.24 
 
 		 596 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0961695  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0756  M24 family peptidase  49.08 
 
 		 596 aa  580  1e-164  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1346  M24 family peptidase  48.57 
 
 		 596 aa  573  1.0000000000000001e-162  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4014  Xaa-Pro aminopeptidase  41.96 
 
 		 591 aa  496  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0866  M24 family metallopeptidase  41.55 
 
 		 591 aa  486  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23062  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0854  M24 family metallopeptidase  41.21 
 
 		 591 aa  486  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.701483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4587  peptidase M24  41.67 
 
 		 590 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000648735  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1210  M24 family peptidase  41.71 
 
 		 595 aa  468  9.999999999999999e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.472186 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1045  peptidase M24  38.75 
 
 		 589 aa  449  1e-125  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.472357  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003662  Xaa-Pro aminopeptidase  38.46 
 
 		 598 aa  444  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1482  peptidase, M24 family protein  38.31 
 
 		 585 aa  422  1e-117  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00151346  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1218  Xaa-Pro aminopeptidase  39.32 
 
 		 589 aa  420  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11005  aminopeptidase P, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08050)  37.5 
 
 		 654 aa  374  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1024  peptidase M24  37.29 
 
 		 595 aa  372  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0487462 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2033  Xaa-Pro aminopeptidase  37.56 
 
 		 607 aa  372  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0161  M24 family peptidase  37.83 
 
 		 597 aa  371  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41838  predicted protein  35.45 
 
 		 626 aa  365  2e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0141589 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02680  cytoplasm protein, putative  36.61 
 
 		 647 aa  363  4e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.980721  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1096  peptidase M24  36.62 
 
 		 595 aa  363  7.0000000000000005e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.37425  normal  0.472019 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2434  peptidase M24  37.83 
 
 		 604 aa  360  3e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411421  normal  0.660909 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2994  peptidase M24  38.05 
 
 		 608 aa  359  8e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.020362 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52141  predicted protein  35.35 
 
 		 608 aa  359  9e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.70287  decreased coverage  0.00225388 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0887  peptidase M24  37.62 
 
 		 604 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0920  peptidase M24  35.11 
 
 		 595 aa  353  5e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00313884  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4994  peptidase M24  38.66 
 
 		 610 aa  351  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.651828  normal  0.317885 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2447  aminopeptidase P  38.65 
 
 		 597 aa  350  3e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1994  peptidase M24  37.42 
 
 		 608 aa  350  3e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2890  peptidase M24  35.82 
 
 		 605 aa  350  3e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0068  putative peptidase  35.09 
 
 		 592 aa  350  4e-95  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2986  peptidase M24  35.74 
 
 		 604 aa  350  4e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0952  peptidase M24  36.98 
 
 		 595 aa  350  6e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2545  peptidase M24  37.13 
 
 		 599 aa  348  1e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3047  peptidase M24  36.71 
 
 		 595 aa  348  1e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0684  aminopeptidase P, putative  36.54 
 
 		 599 aa  348  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1388  aminopeptidase P, putative  35.68 
 
 		 601 aa  348  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11174  predicted protein  36.16 
 
 		 627 aa  347  4e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0482679  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2807  peptidase M24  35.49 
 
 		 605 aa  345  1e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.155072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0438  peptidase M24  37.16 
 
 		 601 aa  344  2.9999999999999997e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0949825  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4945  peptidase M24  37.88 
 
 		 612 aa  342  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.988879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3250  peptidase M24  38.63 
 
 		 617 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.54286  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1198  peptidase M24  35.6 
 
 		 595 aa  340  4e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00360  Xaa-Pro aminopeptidase  36.27 
 
 		 596 aa  340  5e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75738  X-Pro aminopeptidase  34.91 
 
 		 710 aa  340  5e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.511861 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1282  peptidase M24  35.1 
 
 		 595 aa  339  7e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3095  peptidase M24  35.1 
 
 		 595 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2990  putative metallopeptidase  34.73 
 
 		 597 aa  337  2.9999999999999997e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3085  peptidase M24  34.93 
 
 		 595 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.055146  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4480  peptidase M24  37.37 
 
 		 612 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.831039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1975  aminopeptidase P  36.73 
 
 		 598 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3238  peptidase M24  35.1 
 
 		 595 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.470182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2865  peptidase M24  36.38 
 
 		 677 aa  334  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2721  putative metallopeptidase  37.21 
 
 		 618 aa  334  3e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0993196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1758  peptidase M24  34.88 
 
 		 608 aa  333  8e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284065  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6160  putative aminopeptidase P  35.55 
 
 		 607 aa  332  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0482402 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002078  Xaa-Pro aminopeptidase  37.02 
 
 		 564 aa  332  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2063  peptidase M24  36.63 
 
 		 612 aa  330  5.0000000000000004e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.507411 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2193  peptidase M24  36.49 
 
 		 605 aa  330  5.0000000000000004e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0683  peptidase M24  37.11 
 
 		 598 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4033  peptidase M24  35.23 
 
 		 609 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0371285  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2368  peptidase M24  36.36 
 
 		 644 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.436268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1086  peptidase M24  36.82 
 
 		 601 aa  326  8.000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.466224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2337  peptidase M24  36.41 
 
 		 612 aa  323  5e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4443  peptidase M24  38.63 
 
 		 611 aa  323  6e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2743  peptidase M24  36.61 
 
 		 600 aa  322  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3291  peptidase M24  35.38 
 
 		 608 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0936  M24 family peptidase  34.06 
 
 		 607 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.217659  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3072  peptidase M24  37.81 
 
 		 598 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.782089 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0641  peptidase M24  36.82 
 
 		 594 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2159  peptidase M24  35.55 
 
 		 612 aa  321  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>