More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_3598 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2334  peptidase M24  52.81 
 
 
607 aa  641    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.565369  normal  0.315472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1861  peptidase M24  62.09 
 
 
602 aa  749    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137789  normal  0.370091 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2238  peptidase M24  61.09 
 
 
633 aa  752    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2965  peptidase M24  64.72 
 
 
606 aa  759    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0444  peptidase M24  86.59 
 
 
604 aa  1056    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.739665  normal  0.291512 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3502  peptidase M24  61.92 
 
 
602 aa  761    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0384792  normal  0.580745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3437  peptidase, M24 family protein  61.41 
 
 
602 aa  753    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193845  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2217  putative peptidase, M24 family protein  63.95 
 
 
605 aa  741    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.50313  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2884  peptidase M24  86.42 
 
 
604 aa  1049    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.185025 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0671  peptidase, M24 family protein  99.83 
 
 
604 aa  1214    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0507  peptidase, M24 family protein  99.83 
 
 
604 aa  1214    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660051  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3518  peptidase M24  78.48 
 
 
604 aa  961    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.517955  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3219  peptidase M24  62.58 
 
 
602 aa  766    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.538784  normal  0.627944 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1974  metallopeptidase protein  54.92 
 
 
605 aa  650    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0562373  normal  0.0522977 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3598  peptidase, M24 family protein  100 
 
 
604 aa  1218    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.979645  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3911  peptidase M24  62.46 
 
 
602 aa  758    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102431  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3601  peptidase M24  85.6 
 
 
604 aa  1043    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.735851  normal  0.937642 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3609  M24 family metallopeptidase  100 
 
 
604 aa  1218    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.827614  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0486  peptidase M24  85.1 
 
 
604 aa  1062    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2927  peptidase, M24 family protein  98.01 
 
 
604 aa  1192    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0440  putative Xaa-Pro aminopeptidase  78.15 
 
 
604 aa  960    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2924  peptidase M24  65.54 
 
 
605 aa  747    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.579237  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2273  peptidase M24  54.76 
 
 
605 aa  645    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000600713 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3435  peptidase M24  61.9 
 
 
602 aa  759    Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00259513  normal  0.40455 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2590  peptidase M24  85.1 
 
 
604 aa  1061    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0418  peptidase M24  86.26 
 
 
604 aa  1053    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2717  peptidase M24  77.98 
 
 
604 aa  966    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0967  peptidase, M24 family protein  99.83 
 
 
604 aa  1214    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.022418  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3585  M24 family metallopeptidase  100 
 
 
604 aa  1218    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519065  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0514  peptidase M24  85.1 
 
 
604 aa  1061    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232311  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1938  peptidase, M24 family protein  99.83 
 
 
604 aa  1214    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.480402  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0681  M24 family peptidase  45.44 
 
 
596 aa  569  1e-161  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0961695  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0756  M24 family peptidase  45.27 
 
 
596 aa  566  1e-160  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1346  M24 family peptidase  44.78 
 
 
596 aa  561  1e-158  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4014  Xaa-Pro aminopeptidase  44.5 
 
 
591 aa  536  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4587  peptidase M24  43.2 
 
 
590 aa  497  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000648735  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1210  M24 family peptidase  43.41 
 
 
595 aa  478  1e-133  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.472186 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1218  Xaa-Pro aminopeptidase  41.99 
 
 
589 aa  472  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0866  M24 family metallopeptidase  40.24 
 
 
591 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23062  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0854  M24 family metallopeptidase  39.03 
 
 
591 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.701483  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1482  peptidase, M24 family protein  39.63 
 
 
585 aa  446  1.0000000000000001e-124  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00151346  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003662  Xaa-Pro aminopeptidase  39.93 
 
 
598 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1045  peptidase M24  36.97 
 
 
589 aa  439  1e-121  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.472357  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41838  predicted protein  39.77 
 
 
626 aa  385  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0141589 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11005  aminopeptidase P, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08050)  36.89 
 
 
654 aa  381  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52141  predicted protein  39.71 
 
 
608 aa  377  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.70287  decreased coverage  0.00225388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4945  peptidase M24  41.09 
 
 
612 aa  372  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.988879 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2193  peptidase M24  39.27 
 
 
605 aa  371  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4480  peptidase M24  41.42 
 
 
612 aa  368  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.831039  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0438  peptidase M24  39.74 
 
 
601 aa  364  2e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0949825  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2721  putative metallopeptidase  39.64 
 
 
618 aa  362  2e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0993196  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0161  M24 family peptidase  36.39 
 
 
597 aa  360  5e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2865  peptidase M24  40.27 
 
 
677 aa  360  5e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4994  peptidase M24  40.37 
 
 
610 aa  359  7e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.651828  normal  0.317885 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2055  peptidase M24  39.67 
 
 
611 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268676  normal  0.0972871 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1975  aminopeptidase P  38.87 
 
 
598 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1758  peptidase M24  36.82 
 
 
608 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284065  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2743  peptidase M24  39.01 
 
 
600 aa  357  3.9999999999999996e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32611  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2033  Xaa-Pro aminopeptidase  36.05 
 
 
607 aa  357  5e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11174  predicted protein  37.16 
 
 
627 aa  353  5e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0482679  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0068  putative peptidase  34.01 
 
 
592 aa  352  1e-95  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2434  peptidase M24  37.13 
 
 
604 aa  351  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411421  normal  0.660909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2571  peptidase M24  38.04 
 
 
611 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3250  peptidase M24  40.65 
 
 
617 aa  350  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.54286  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1374  aminopeptidase P  36.84 
 
 
608 aa  350  6e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.993767  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1418  aminopeptidase P  36.84 
 
 
608 aa  349  7e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.413075  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2832  Xaa-Pro aminopeptidase  37.54 
 
 
628 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.109252 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1994  peptidase M24  37.86 
 
 
608 aa  348  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1086  peptidase M24  38.69 
 
 
601 aa  348  1e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.466224  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2368  peptidase M24  38.36 
 
 
644 aa  348  2e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.436268  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0920  peptidase M24  34.22 
 
 
595 aa  347  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00313884  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02680  cytoplasm protein, putative  35.74 
 
 
647 aa  346  5e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.980721  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3072  peptidase M24  39.3 
 
 
598 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.782089 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2994  peptidase M24  38.4 
 
 
608 aa  342  1e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.020362 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0936  M24 family peptidase  33.92 
 
 
607 aa  342  2e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.217659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0683  peptidase M24  38.08 
 
 
598 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4443  peptidase M24  41.12 
 
 
611 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3291  peptidase M24  37.35 
 
 
608 aa  339  9e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2747  peptidase M24  37.77 
 
 
630 aa  339  9e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3379  peptidase M24  36.29 
 
 
609 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379289  decreased coverage  0.00212976 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0641  peptidase M24  39.43 
 
 
594 aa  338  9.999999999999999e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3047  peptidase M24  34.27 
 
 
595 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2337  peptidase M24  39.83 
 
 
612 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6160  putative aminopeptidase P  37.94 
 
 
607 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0482402 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2301  peptidase M24  39.04 
 
 
633 aa  337  5.999999999999999e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.0238378 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4033  peptidase M24  36.35 
 
 
609 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0371285  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1096  peptidase M24  33.77 
 
 
595 aa  336  7e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.37425  normal  0.472019 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0684  aminopeptidase P, putative  36.15 
 
 
599 aa  334  2e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2855  aminopeptidase P  35.49 
 
 
615 aa  333  7.000000000000001e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151191  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2063  peptidase M24  36.29 
 
 
612 aa  333  7.000000000000001e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.507411 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0952  peptidase M24  34.97 
 
 
595 aa  332  9e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2010  peptidase M24  36.38 
 
 
609 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.623866  normal  0.492859 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2986  peptidase M24  33.72 
 
 
604 aa  332  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1024  peptidase M24  34.33 
 
 
595 aa  330  3e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0487462 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2545  peptidase M24  34.81 
 
 
599 aa  330  4e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3095  peptidase M24  33.39 
 
 
595 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1282  peptidase M24  33.67 
 
 
595 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3238  peptidase M24  34 
 
 
595 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.470182  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2807  peptidase M24  33.22 
 
 
605 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.155072  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00360  Xaa-Pro aminopeptidase  34.44 
 
 
596 aa  327  3e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>