More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0514 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2884  peptidase M24  93.87 
 
 
604 aa  1128    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.185025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1861  peptidase M24  61.75 
 
 
602 aa  752    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137789  normal  0.370091 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2238  peptidase M24  61.09 
 
 
633 aa  757    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0671  peptidase, M24 family protein  84.93 
 
 
604 aa  1043    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3585  M24 family metallopeptidase  85.1 
 
 
604 aa  1048    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519065  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3437  peptidase, M24 family protein  60.74 
 
 
602 aa  748    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193845  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0507  peptidase, M24 family protein  84.93 
 
 
604 aa  1043    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660051  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3518  peptidase M24  77.15 
 
 
604 aa  964    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.517955  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3219  peptidase M24  62.08 
 
 
602 aa  765    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.538784  normal  0.627944 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3598  peptidase, M24 family protein  85.1 
 
 
604 aa  1048    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.979645  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3911  peptidase M24  62.63 
 
 
602 aa  767    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102431  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3601  peptidase M24  96.69 
 
 
604 aa  1161    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.735851  normal  0.937642 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3435  peptidase M24  61.73 
 
 
602 aa  765    Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00259513  normal  0.40455 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3609  M24 family metallopeptidase  85.1 
 
 
604 aa  1048    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.827614  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0444  peptidase M24  94.04 
 
 
604 aa  1139    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.739665  normal  0.291512 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2217  putative peptidase, M24 family protein  62.96 
 
 
605 aa  747    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.50313  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2717  peptidase M24  77.15 
 
 
604 aa  964    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2927  peptidase, M24 family protein  85.1 
 
 
604 aa  1046    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0440  putative Xaa-Pro aminopeptidase  77.15 
 
 
604 aa  966    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2924  peptidase M24  63.51 
 
 
605 aa  739    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.579237  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3502  peptidase M24  61.09 
 
 
602 aa  758    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0384792  normal  0.580745 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2590  peptidase M24  100 
 
 
604 aa  1223    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0418  peptidase M24  94.54 
 
 
604 aa  1143    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2965  peptidase M24  63.71 
 
 
606 aa  756    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0967  peptidase, M24 family protein  84.93 
 
 
604 aa  1043    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.022418  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0514  peptidase M24  100 
 
 
604 aa  1223    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232311  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0486  peptidase M24  99.67 
 
 
604 aa  1219    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1938  peptidase, M24 family protein  84.93 
 
 
604 aa  1043    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.480402  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1974  metallopeptidase protein  53.59 
 
 
605 aa  629  1e-179  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0562373  normal  0.0522977 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2334  peptidase M24  51.98 
 
 
607 aa  629  1e-179  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.565369  normal  0.315472 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2273  peptidase M24  53.42 
 
 
605 aa  626  1e-178  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000600713 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0681  M24 family peptidase  46.1 
 
 
596 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0961695  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0756  M24 family peptidase  45.94 
 
 
596 aa  573  1.0000000000000001e-162  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1346  M24 family peptidase  45.44 
 
 
596 aa  567  1e-160  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4014  Xaa-Pro aminopeptidase  44.33 
 
 
591 aa  536  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4587  peptidase M24  41.33 
 
 
590 aa  485  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000648735  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1210  M24 family peptidase  43 
 
 
595 aa  478  1e-133  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.472186 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1218  Xaa-Pro aminopeptidase  43.51 
 
 
589 aa  478  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0854  M24 family metallopeptidase  39.53 
 
 
591 aa  474  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.701483  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0866  M24 family metallopeptidase  40.59 
 
 
591 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23062  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1045  peptidase M24  37.82 
 
 
589 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.472357  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003662  Xaa-Pro aminopeptidase  39.43 
 
 
598 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1482  peptidase, M24 family protein  38.82 
 
 
585 aa  435  1e-120  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00151346  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41838  predicted protein  40.48 
 
 
626 aa  405  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0141589 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52141  predicted protein  40.43 
 
 
608 aa  397  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.70287  decreased coverage  0.00225388 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11005  aminopeptidase P, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08050)  35.74 
 
 
654 aa  368  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2743  peptidase M24  39.77 
 
 
600 aa  366  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32611  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0438  peptidase M24  38.47 
 
 
601 aa  360  5e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0949825  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0161  M24 family peptidase  36.56 
 
 
597 aa  360  5e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1096  peptidase M24  35.55 
 
 
595 aa  360  5e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.37425  normal  0.472019 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1758  peptidase M24  37.19 
 
 
608 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284065  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2193  peptidase M24  37.94 
 
 
605 aa  358  9.999999999999999e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2865  peptidase M24  40.1 
 
 
677 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2033  Xaa-Pro aminopeptidase  36.39 
 
 
607 aa  357  2.9999999999999997e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2721  putative metallopeptidase  38.87 
 
 
618 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0993196  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1975  aminopeptidase P  39.1 
 
 
598 aa  357  5e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0068  putative peptidase  35.32 
 
 
592 aa  354  2e-96  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00360  Xaa-Pro aminopeptidase  36.05 
 
 
596 aa  353  5.9999999999999994e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1086  peptidase M24  38.97 
 
 
601 aa  353  5.9999999999999994e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.466224  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1418  aminopeptidase P  37.13 
 
 
608 aa  350  5e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.413075  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1374  aminopeptidase P  37.13 
 
 
608 aa  350  5e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.993767  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2571  peptidase M24  38.54 
 
 
611 aa  349  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2832  Xaa-Pro aminopeptidase  38.7 
 
 
628 aa  349  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.109252 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0684  aminopeptidase P, putative  37.58 
 
 
599 aa  348  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3072  peptidase M24  38.99 
 
 
598 aa  349  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.782089 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0952  peptidase M24  36.39 
 
 
595 aa  348  2e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0920  peptidase M24  34.27 
 
 
595 aa  348  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00313884  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1024  peptidase M24  35.27 
 
 
595 aa  347  5e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0487462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2434  peptidase M24  36.89 
 
 
604 aa  347  5e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411421  normal  0.660909 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2994  peptidase M24  37.89 
 
 
608 aa  346  6e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.020362 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0683  peptidase M24  38.44 
 
 
598 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6160  putative aminopeptidase P  38.6 
 
 
607 aa  345  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0482402 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2055  peptidase M24  39 
 
 
611 aa  344  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268676  normal  0.0972871 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2990  putative metallopeptidase  34.45 
 
 
597 aa  344  2.9999999999999997e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4945  peptidase M24  38.94 
 
 
612 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.988879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2986  peptidase M24  35.66 
 
 
604 aa  343  5e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02680  cytoplasm protein, putative  35.34 
 
 
647 aa  343  7e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.980721  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4033  peptidase M24  37.54 
 
 
609 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0371285  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3250  peptidase M24  40.13 
 
 
617 aa  342  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.54286  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3047  peptidase M24  34.49 
 
 
595 aa  342  1e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2368  peptidase M24  37.69 
 
 
644 aa  341  2e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.436268  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2447  aminopeptidase P  35.82 
 
 
597 aa  341  2e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4994  peptidase M24  38.81 
 
 
610 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.651828  normal  0.317885 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4480  peptidase M24  38.84 
 
 
612 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.831039  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2807  peptidase M24  35.16 
 
 
605 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.155072  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4443  peptidase M24  40.73 
 
 
611 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1388  aminopeptidase P, putative  35.66 
 
 
601 aa  339  7e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2747  peptidase M24  37.6 
 
 
630 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1994  peptidase M24  37.4 
 
 
608 aa  338  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2890  peptidase M24  34.99 
 
 
605 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3379  peptidase M24  36.91 
 
 
609 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379289  decreased coverage  0.00212976 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11174  predicted protein  35.96 
 
 
627 aa  337  2.9999999999999997e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0482679  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0641  peptidase M24  38.27 
 
 
594 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0936  M24 family peptidase  34.29 
 
 
607 aa  337  5.999999999999999e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.217659  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3291  peptidase M24  37.19 
 
 
608 aa  336  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1198  peptidase M24  35.66 
 
 
595 aa  334  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0887  peptidase M24  35.23 
 
 
604 aa  334  3e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002078  Xaa-Pro aminopeptidase  35.51 
 
 
564 aa  333  4e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2063  peptidase M24  35.91 
 
 
612 aa  333  6e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.507411 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2545  peptidase M24  34.78 
 
 
599 aa  332  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>