More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3238 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1198  peptidase M24  91.43 
 
 
595 aa  1134    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2447  aminopeptidase P  54.1 
 
 
597 aa  649    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2545  peptidase M24  56.52 
 
 
599 aa  704    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3238  peptidase M24  100 
 
 
595 aa  1235    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.470182  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3095  peptidase M24  96.97 
 
 
595 aa  1198    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1388  aminopeptidase P, putative  91.23 
 
 
601 aa  1132    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1282  peptidase M24  97.48 
 
 
595 aa  1207    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002078  Xaa-Pro aminopeptidase  54.9 
 
 
564 aa  638    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3085  peptidase M24  97.14 
 
 
595 aa  1203    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.055146  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00360  Xaa-Pro aminopeptidase  54.64 
 
 
596 aa  664    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0952  peptidase M24  74.96 
 
 
595 aa  931    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0920  peptidase M24  72.77 
 
 
595 aa  915    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00313884  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0887  peptidase M24  75.96 
 
 
604 aa  956    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2990  putative metallopeptidase  53.81 
 
 
597 aa  658    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2807  peptidase M24  91.91 
 
 
605 aa  1135    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.155072  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2890  peptidase M24  91.74 
 
 
605 aa  1138    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3047  peptidase M24  77.48 
 
 
595 aa  968    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1096  peptidase M24  74.96 
 
 
595 aa  949    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.37425  normal  0.472019 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1024  peptidase M24  73.95 
 
 
595 aa  926    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0487462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2986  peptidase M24  92.41 
 
 
604 aa  1142    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0684  aminopeptidase P, putative  75.08 
 
 
599 aa  942    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0438  peptidase M24  48.07 
 
 
601 aa  555  1e-157  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0949825  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2063  peptidase M24  47.72 
 
 
612 aa  548  1e-154  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.507411 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2994  peptidase M24  48.47 
 
 
608 aa  543  1e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.020362 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2434  peptidase M24  48.47 
 
 
604 aa  539  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411421  normal  0.660909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1086  peptidase M24  48.72 
 
 
601 aa  541  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.466224  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2865  peptidase M24  46.15 
 
 
677 aa  525  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1994  peptidase M24  44.03 
 
 
608 aa  503  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1758  peptidase M24  46.11 
 
 
608 aa  501  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284065  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2368  peptidase M24  45.44 
 
 
644 aa  496  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.436268  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1427  peptidase M24  47.46 
 
 
604 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.85794 
 
 
-
 
NC_004310  BR1418  aminopeptidase P  45.45 
 
 
608 aa  487  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.413075  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1374  aminopeptidase P  45.29 
 
 
608 aa  486  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.993767  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2193  peptidase M24  43.9 
 
 
605 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4033  peptidase M24  44.67 
 
 
609 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0371285  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2010  peptidase M24  44.16 
 
 
609 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.623866  normal  0.492859 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1592  peptidase M24  45.96 
 
 
603 aa  479  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400079  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2747  peptidase M24  44.78 
 
 
630 aa  476  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2159  peptidase M24  44.63 
 
 
612 aa  475  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.489456  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6160  putative aminopeptidase P  44.16 
 
 
607 aa  475  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0482402 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2743  peptidase M24  43.92 
 
 
600 aa  473  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32611  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3379  peptidase M24  43.49 
 
 
609 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379289  decreased coverage  0.00212976 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2855  aminopeptidase P  42.81 
 
 
615 aa  469  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151191  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0215  peptidase M24  44.37 
 
 
589 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.260741  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2055  peptidase M24  42.98 
 
 
611 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268676  normal  0.0972871 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1975  aminopeptidase P  44.16 
 
 
598 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3291  peptidase M24  43.43 
 
 
608 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4994  peptidase M24  42.55 
 
 
610 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.651828  normal  0.317885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3250  peptidase M24  43.25 
 
 
617 aa  465  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.54286  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0936  M24 family peptidase  42.59 
 
 
607 aa  462  1e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.217659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0683  peptidase M24  44.29 
 
 
598 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2832  Xaa-Pro aminopeptidase  42.16 
 
 
628 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.109252 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4480  peptidase M24  42.03 
 
 
612 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.831039  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3072  peptidase M24  45.2 
 
 
598 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.782089 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0213  peptidase M24  44.05 
 
 
596 aa  458  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22897  normal  0.0833498 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2571  peptidase M24  42.35 
 
 
611 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4945  peptidase M24  41.86 
 
 
612 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.988879 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2721  putative metallopeptidase  42.54 
 
 
618 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0993196  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2337  peptidase M24  42.54 
 
 
612 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2301  peptidase M24  42.2 
 
 
633 aa  444  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.0238378 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4443  peptidase M24  42.74 
 
 
611 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2573  peptidase M24  41.18 
 
 
590 aa  432  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0932593 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0641  peptidase M24  42.11 
 
 
594 aa  426  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.117815 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11005  aminopeptidase P, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08050)  39.34 
 
 
654 aa  402  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2033  Xaa-Pro aminopeptidase  39.14 
 
 
607 aa  400  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0161  M24 family peptidase  39.14 
 
 
597 aa  401  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0866  M24 family metallopeptidase  36.99 
 
 
591 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23062  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1210  M24 family peptidase  37.36 
 
 
595 aa  386  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.472186 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41838  predicted protein  37.04 
 
 
626 aa  389  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0141589 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4587  peptidase M24  37.88 
 
 
590 aa  386  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000648735  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0854  M24 family metallopeptidase  36.23 
 
 
591 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.701483  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52141  predicted protein  36.84 
 
 
608 aa  379  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.70287  decreased coverage  0.00225388 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1218  Xaa-Pro aminopeptidase  38.28 
 
 
589 aa  378  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0547  peptidase M24  37.33 
 
 
574 aa  369  1e-101  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.621521  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1482  peptidase, M24 family protein  34.73 
 
 
585 aa  363  3e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00151346  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4014  Xaa-Pro aminopeptidase  36.09 
 
 
591 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0479  M24 family metallopeptidase  36.32 
 
 
574 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3911  peptidase M24  36.63 
 
 
602 aa  351  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102431  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75738  X-Pro aminopeptidase  35.39 
 
 
710 aa  351  2e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.511861 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2217  putative peptidase, M24 family protein  36.44 
 
 
605 aa  350  3e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.50313  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3219  peptidase M24  36.77 
 
 
602 aa  350  4e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.538784  normal  0.627944 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2273  peptidase M24  35.36 
 
 
605 aa  347  3e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000600713 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2334  peptidase M24  36.56 
 
 
607 aa  345  2e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.565369  normal  0.315472 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2924  peptidase M24  35.45 
 
 
605 aa  345  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.579237  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1045  peptidase M24  33.44 
 
 
589 aa  343  5e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.472357  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1974  metallopeptidase protein  35.47 
 
 
605 aa  343  7e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0562373  normal  0.0522977 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0471  M24 family metallopeptidase  37.83 
 
 
545 aa  340  4e-92  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1008  aminopeptidase P  36.35 
 
 
555 aa  338  9.999999999999999e-92  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003662  Xaa-Pro aminopeptidase  34.11 
 
 
598 aa  337  3.9999999999999995e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11174  predicted protein  36.16 
 
 
627 aa  335  2e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0482679  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3437  peptidase, M24 family protein  35.1 
 
 
602 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193845  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2717  peptidase M24  34.78 
 
 
604 aa  333  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2884  peptidase M24  34.06 
 
 
604 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.185025 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2590  peptidase M24  34.17 
 
 
604 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0514  peptidase M24  34.17 
 
 
604 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232311  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0486  peptidase M24  34.17 
 
 
604 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2927  peptidase, M24 family protein  33.89 
 
 
604 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0440  putative Xaa-Pro aminopeptidase  33.66 
 
 
604 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3435  peptidase M24  34.67 
 
 
602 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00259513  normal  0.40455 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0444  peptidase M24  33.89 
 
 
604 aa  327  5e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.739665  normal  0.291512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>