More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2434 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6160  putative aminopeptidase P  54.5 
 
 		 607 aa  638    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0482402 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4480  peptidase M24  58.04 
 
 		 612 aa  655    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.831039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4994  peptidase M24  57.55 
 
 		 610 aa  659    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.651828  normal  0.317885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4945  peptidase M24  57.55 
 
 		 612 aa  652    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.988879 
 
 
-
 
NC_004310  BR1418  aminopeptidase P  57.52 
 
 		 608 aa  669    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.413075  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1374  aminopeptidase P  57.36 
 
 		 608 aa  668    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.993767  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4033  peptidase M24  56.67 
 
 		 609 aa  672    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0371285  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2368  peptidase M24  57 
 
 		 644 aa  662    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.436268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2159  peptidase M24  56.32 
 
 		 612 aa  660    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3250  peptidase M24  59.54 
 
 		 617 aa  679    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.54286  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1427  peptidase M24  57.38 
 
 		 604 aa  653    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.85794 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2010  peptidase M24  55.5 
 
 		 609 aa  660    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.623866  normal  0.492859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3291  peptidase M24  55.96 
 
 		 608 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3379  peptidase M24  55.83 
 
 		 609 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379289  decreased coverage  0.00212976 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2747  peptidase M24  55.67 
 
 		 630 aa  645    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1994  peptidase M24  54.52 
 
 		 608 aa  659    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2063  peptidase M24  55.22 
 
 		 612 aa  636    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.507411 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2434  peptidase M24  100 
 
 		 604 aa  1223    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411421  normal  0.660909 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2855  aminopeptidase P  52.06 
 
 		 615 aa  640    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151191  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4443  peptidase M24  59.37 
 
 		 611 aa  664    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1758  peptidase M24  58.18 
 
 		 608 aa  687    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284065  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2865  peptidase M24  55.88 
 
 		 677 aa  628  1e-178  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1086  peptidase M24  54.76 
 
 		 601 aa  619  1e-176  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.466224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2994  peptidase M24  54.56 
 
 		 608 aa  621  1e-176  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.020362 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2055  peptidase M24  52.46 
 
 		 611 aa  616  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268676  normal  0.0972871 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2337  peptidase M24  55.33 
 
 		 612 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2832  Xaa-Pro aminopeptidase  52.22 
 
 		 628 aa  611  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.109252 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2571  peptidase M24  51.89 
 
 		 611 aa  611  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2301  peptidase M24  53.24 
 
 		 633 aa  606  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.0238378 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0438  peptidase M24  55.35 
 
 		 601 aa  602  1.0000000000000001e-171  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0949825  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0936  M24 family peptidase  50.99 
 
 		 607 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.217659  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1975  aminopeptidase P  51.5 
 
 		 598 aa  590  1e-167  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0683  peptidase M24  51.83 
 
 		 598 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3072  peptidase M24  53.34 
 
 		 598 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.782089 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2743  peptidase M24  51.32 
 
 		 600 aa  575  1.0000000000000001e-163  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2721  putative metallopeptidase  50.16 
 
 		 618 aa  571  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0993196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1592  peptidase M24  53.5 
 
 		 603 aa  561  1.0000000000000001e-159  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2193  peptidase M24  49.09 
 
 		 605 aa  562  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0215  peptidase M24  52.99 
 
 		 589 aa  557  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.260741  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2447  aminopeptidase P  49.25 
 
 		 597 aa  552  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1388  aminopeptidase P, putative  48.9 
 
 		 601 aa  545  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2807  peptidase M24  48.22 
 
 		 605 aa  542  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.155072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1198  peptidase M24  48.56 
 
 		 595 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3238  peptidase M24  48.47 
 
 		 595 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.470182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2890  peptidase M24  47.72 
 
 		 605 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0920  peptidase M24  46.95 
 
 		 595 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00313884  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2986  peptidase M24  48.22 
 
 		 604 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3095  peptidase M24  48.14 
 
 		 595 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1282  peptidase M24  48.31 
 
 		 595 aa  538  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0684  aminopeptidase P, putative  48.74 
 
 		 599 aa  535  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3085  peptidase M24  48.14 
 
 		 595 aa  535  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.055146  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0952  peptidase M24  48.56 
 
 		 595 aa  533  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2990  putative metallopeptidase  47.48 
 
 		 597 aa  533  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1024  peptidase M24  47.29 
 
 		 595 aa  529  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0487462 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00360  Xaa-Pro aminopeptidase  48.32 
 
 		 596 aa  530  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3047  peptidase M24  46.78 
 
 		 595 aa  529  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0213  peptidase M24  49.08 
 
 		 596 aa  522  1e-147  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22897  normal  0.0833498 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0641  peptidase M24  48.4 
 
 		 594 aa  520  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1096  peptidase M24  46.27 
 
 		 595 aa  520  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.37425  normal  0.472019 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0887  peptidase M24  46.28 
 
 		 604 aa  512  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2545  peptidase M24  45.52 
 
 		 599 aa  513  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002078  Xaa-Pro aminopeptidase  48.06 
 
 		 564 aa  507  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2573  peptidase M24  41.55 
 
 		 590 aa  463  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0932593 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0161  M24 family peptidase  42.31 
 
 		 597 aa  437  1e-121  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2033  Xaa-Pro aminopeptidase  42.31 
 
 		 607 aa  436  1e-121  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11005  aminopeptidase P, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08050)  40.26 
 
 		 654 aa  419  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0547  peptidase M24  38.47 
 
 		 574 aa  416  9.999999999999999e-116  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.621521  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0854  M24 family metallopeptidase  38.53 
 
 		 591 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.701483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4587  peptidase M24  39.12 
 
 		 590 aa  402  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000648735  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1210  M24 family peptidase  39.7 
 
 		 595 aa  400  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.472186 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0866  M24 family metallopeptidase  38.42 
 
 		 591 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23062  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41838  predicted protein  37.72 
 
 		 626 aa  398  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0141589 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52141  predicted protein  37.73 
 
 		 608 aa  393  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.70287  decreased coverage  0.00225388 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0479  M24 family metallopeptidase  38.55 
 
 		 574 aa  390  1e-107  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1008  aminopeptidase P  38.46 
 
 		 555 aa  389  1e-106  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3911  peptidase M24  39.34 
 
 		 602 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4014  Xaa-Pro aminopeptidase  38.13 
 
 		 591 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1482  peptidase, M24 family protein  36.91 
 
 		 585 aa  378  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00151346  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1045  peptidase M24  35.52 
 
 		 589 aa  369  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.472357  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1218  Xaa-Pro aminopeptidase  37.9 
 
 		 589 aa  368  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3502  peptidase M24  38.33 
 
 		 602 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0384792  normal  0.580745 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02680  cytoplasm protein, putative  37.09 
 
 		 647 aa  367  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.980721  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3518  peptidase M24  38.83 
 
 		 604 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.517955  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0440  putative Xaa-Pro aminopeptidase  38.52 
 
 		 604 aa  369  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2217  putative peptidase, M24 family protein  38.59 
 
 		 605 aa  364  2e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.50313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2717  peptidase M24  38.77 
 
 		 604 aa  363  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75738  X-Pro aminopeptidase  35.43 
 
 		 710 aa  361  2e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.511861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3437  peptidase, M24 family protein  37.83 
 
 		 602 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193845  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0471  M24 family metallopeptidase  38.62 
 
 		 545 aa  360  6e-98  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3219  peptidase M24  38.29 
 
 		 602 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.538784  normal  0.627944 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2273  peptidase M24  37.73 
 
 		 605 aa  356  7.999999999999999e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1861  peptidase M24  37.54 
 
 		 602 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137789  normal  0.370091 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003662  Xaa-Pro aminopeptidase  34.62 
 
 		 598 aa  355  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3435  peptidase M24  37.48 
 
 		 602 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00259513  normal  0.40455 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11174  predicted protein  37.18 
 
 		 627 aa  355  2e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0482679  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2924  peptidase M24  37.87 
 
 		 605 aa  353  4e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.579237  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2965  peptidase M24  38.45 
 
 		 606 aa  352  1e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2238  peptidase M24  36.82 
 
 		 633 aa  352  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1938  peptidase, M24 family protein  36.92 
 
 		 604 aa  350  6e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.480402  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0967  peptidase, M24 family protein  36.92 
 
 		 604 aa  350  6e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.022418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>