More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3502 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2334  peptidase M24  52.88 
 
 		 607 aa  644    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.565369  normal  0.315472 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0444  peptidase M24  60.93 
 
 		 604 aa  742    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.739665  normal  0.291512 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2238  peptidase M24  96.18 
 
 		 633 aa  1181    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3437  peptidase, M24 family protein  66.45 
 
 		 602 aa  837    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193845  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0671  peptidase, M24 family protein  61.75 
 
 		 604 aa  749    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0507  peptidase, M24 family protein  61.75 
 
 		 604 aa  749    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660051  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3219  peptidase M24  68.11 
 
 		 602 aa  860    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.538784  normal  0.627944 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2717  peptidase M24  62.09 
 
 		 604 aa  765    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3598  peptidase, M24 family protein  61.92 
 
 		 604 aa  753    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.979645  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3911  peptidase M24  73.42 
 
 		 602 aa  914    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3601  peptidase M24  61.26 
 
 		 604 aa  744    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.735851  normal  0.937642 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0967  peptidase, M24 family protein  61.75 
 
 		 604 aa  749    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.022418  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2927  peptidase, M24 family protein  61.59 
 
 		 604 aa  751    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3518  peptidase M24  62.42 
 
 		 604 aa  771    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.517955  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0440  putative Xaa-Pro aminopeptidase  62.91 
 
 		 604 aa  772    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2924  peptidase M24  61.49 
 
 		 605 aa  717    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.579237  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2273  peptidase M24  53 
 
 		 605 aa  637    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1861  peptidase M24  92.36 
 
 		 602 aa  1113    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137789  normal  0.370091 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2884  peptidase M24  62.42 
 
 		 604 aa  751    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.185025 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3502  peptidase M24  100 
 
 		 602 aa  1227    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0384792  normal  0.580745 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3435  peptidase M24  82.89 
 
 		 602 aa  1035    Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00259513  normal  0.40455 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2590  peptidase M24  61.09 
 
 		 604 aa  758    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2217  putative peptidase, M24 family protein  60.23 
 
 		 605 aa  726    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.50313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3585  M24 family metallopeptidase  61.92 
 
 		 604 aa  753    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519065  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0418  peptidase M24  60.6 
 
 		 604 aa  742    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2965  peptidase M24  59.83 
 
 		 606 aa  709    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1938  peptidase, M24 family protein  61.75 
 
 		 604 aa  749    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.480402  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0486  peptidase M24  61.09 
 
 		 604 aa  758    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3609  M24 family metallopeptidase  61.92 
 
 		 604 aa  753    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.827614  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0514  peptidase M24  61.09 
 
 		 604 aa  758    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232311  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1974  metallopeptidase protein  53.17 
 
 		 605 aa  632  1e-180  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0562373  normal  0.0522977 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0681  M24 family peptidase  46.23 
 
 		 596 aa  565  1.0000000000000001e-159  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0961695  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0756  M24 family peptidase  46.06 
 
 		 596 aa  561  1e-158  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1346  M24 family peptidase  45.56 
 
 		 596 aa  555  1e-157  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4014  Xaa-Pro aminopeptidase  42.98 
 
 		 591 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0866  M24 family metallopeptidase  40.62 
 
 		 591 aa  473  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23062  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0854  M24 family metallopeptidase  39.77 
 
 		 591 aa  472  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.701483  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1210  M24 family peptidase  40.27 
 
 		 595 aa  462  1e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.472186 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1482  peptidase, M24 family protein  39.63 
 
 		 585 aa  453  1.0000000000000001e-126  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00151346  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4587  peptidase M24  41.02 
 
 		 590 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000648735  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1218  Xaa-Pro aminopeptidase  41.75 
 
 		 589 aa  449  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1045  peptidase M24  37.93 
 
 		 589 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.472357  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003662  Xaa-Pro aminopeptidase  37.84 
 
 		 598 aa  433  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0161  M24 family peptidase  38.77 
 
 		 597 aa  389  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2033  Xaa-Pro aminopeptidase  38.6 
 
 		 607 aa  385  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41838  predicted protein  36.64 
 
 		 626 aa  385  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0141589 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11005  aminopeptidase P, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08050)  36.78 
 
 		 654 aa  378  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0438  peptidase M24  40.13 
 
 		 601 aa  378  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0949825  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52141  predicted protein  36.35 
 
 		 608 aa  372  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.70287  decreased coverage  0.00225388 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2994  peptidase M24  39.26 
 
 		 608 aa  372  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.020362 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2434  peptidase M24  38.33 
 
 		 604 aa  369  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411421  normal  0.660909 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02680  cytoplasm protein, putative  36.08 
 
 		 647 aa  364  3e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.980721  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4945  peptidase M24  38.86 
 
 		 612 aa  363  6e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.988879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1086  peptidase M24  37.65 
 
 		 601 aa  362  9e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.466224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2193  peptidase M24  37.4 
 
 		 605 aa  361  3e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1758  peptidase M24  37.33 
 
 		 608 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284065  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0068  putative peptidase  34.66 
 
 		 592 aa  357  3.9999999999999996e-97  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4480  peptidase M24  38.53 
 
 		 612 aa  356  6.999999999999999e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.831039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3250  peptidase M24  39.46 
 
 		 617 aa  354  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.54286  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4994  peptidase M24  38.86 
 
 		 610 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.651828  normal  0.317885 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2865  peptidase M24  39.21 
 
 		 677 aa  353  5e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1994  peptidase M24  37.64 
 
 		 608 aa  353  5e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1024  peptidase M24  36.58 
 
 		 595 aa  348  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0487462 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1427  peptidase M24  37.73 
 
 		 604 aa  348  1e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.85794 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2337  peptidase M24  37.77 
 
 		 612 aa  348  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2721  putative metallopeptidase  37.09 
 
 		 618 aa  347  3e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0993196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2063  peptidase M24  36.74 
 
 		 612 aa  347  4e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.507411 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2368  peptidase M24  37.04 
 
 		 644 aa  345  1e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.436268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00360  Xaa-Pro aminopeptidase  36.57 
 
 		 596 aa  345  2e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2545  peptidase M24  36.2 
 
 		 599 aa  343  5e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1096  peptidase M24  34.83 
 
 		 595 aa  342  8e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.37425  normal  0.472019 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2832  Xaa-Pro aminopeptidase  37.85 
 
 		 628 aa  343  8e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.109252 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2571  peptidase M24  37.36 
 
 		 611 aa  342  9e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1975  aminopeptidase P  37.31 
 
 		 598 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2055  peptidase M24  38.3 
 
 		 611 aa  341  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268676  normal  0.0972871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4443  peptidase M24  40.24 
 
 		 611 aa  340  4e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1374  aminopeptidase P  36.04 
 
 		 608 aa  339  8e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.993767  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1418  aminopeptidase P  36.04 
 
 		 608 aa  339  8e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.413075  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0920  peptidase M24  34.33 
 
 		 595 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00313884  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0936  M24 family peptidase  34.94 
 
 		 607 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.217659  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0684  aminopeptidase P, putative  37.29 
 
 		 599 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2855  aminopeptidase P  36.72 
 
 		 615 aa  336  5.999999999999999e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151191  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2743  peptidase M24  36.88 
 
 		 600 aa  335  1e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3291  peptidase M24  36.7 
 
 		 608 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0641  peptidase M24  38.25 
 
 		 594 aa  334  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2159  peptidase M24  36.56 
 
 		 612 aa  333  5e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2990  putative metallopeptidase  35.23 
 
 		 597 aa  333  6e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6160  putative aminopeptidase P  36.3 
 
 		 607 aa  332  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0482402 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0683  peptidase M24  37.18 
 
 		 598 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002078  Xaa-Pro aminopeptidase  36.06 
 
 		 564 aa  332  2e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75738  X-Pro aminopeptidase  33.54 
 
 		 710 aa  328  1.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.511861 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2447  aminopeptidase P  35.04 
 
 		 597 aa  329  1.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0887  peptidase M24  35.32 
 
 		 604 aa  326  6e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11174  predicted protein  34.56 
 
 		 627 aa  326  8.000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0482679  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2890  peptidase M24  33.11 
 
 		 605 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3379  peptidase M24  35.02 
 
 		 609 aa  324  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379289  decreased coverage  0.00212976 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3072  peptidase M24  36.89 
 
 		 598 aa  323  8e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.782089 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2807  peptidase M24  33.11 
 
 		 605 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.155072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3047  peptidase M24  34.22 
 
 		 595 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4033  peptidase M24  35.29 
 
 		 609 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0371285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>