More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2571 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1758  peptidase M24  57.57 
 
 
608 aa  693    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284065  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1418  aminopeptidase P  56.74 
 
 
608 aa  678    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.413075  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2855  aminopeptidase P  67 
 
 
615 aa  869    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151191  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2832  Xaa-Pro aminopeptidase  94.93 
 
 
628 aa  1199    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.109252 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2571  peptidase M24  100 
 
 
611 aa  1246    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1374  aminopeptidase P  56.58 
 
 
608 aa  677    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.993767  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2055  peptidase M24  70.98 
 
 
611 aa  897    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268676  normal  0.0972871 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0936  M24 family peptidase  50.41 
 
 
607 aa  629  1e-179  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.217659  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1994  peptidase M24  51.56 
 
 
608 aa  619  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2434  peptidase M24  51.89 
 
 
604 aa  611  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411421  normal  0.660909 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2368  peptidase M24  49.35 
 
 
644 aa  551  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.436268  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2010  peptidase M24  47.7 
 
 
609 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.623866  normal  0.492859 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2159  peptidase M24  48.21 
 
 
612 aa  545  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.489456  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4994  peptidase M24  49.84 
 
 
610 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.651828  normal  0.317885 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4033  peptidase M24  47.54 
 
 
609 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0371285  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4945  peptidase M24  49.51 
 
 
612 aa  535  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.988879 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3379  peptidase M24  48.78 
 
 
609 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379289  decreased coverage  0.00212976 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4480  peptidase M24  49.84 
 
 
612 aa  538  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.831039  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4443  peptidase M24  51.89 
 
 
611 aa  530  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3291  peptidase M24  47.95 
 
 
608 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2747  peptidase M24  48.37 
 
 
630 aa  531  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3250  peptidase M24  50.17 
 
 
617 aa  523  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.54286  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1427  peptidase M24  47.95 
 
 
604 aa  520  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.85794 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2994  peptidase M24  48.84 
 
 
608 aa  519  1e-146  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.020362 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2337  peptidase M24  49.34 
 
 
612 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2063  peptidase M24  45.01 
 
 
612 aa  516  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.507411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6160  putative aminopeptidase P  46.63 
 
 
607 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0482402 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1975  aminopeptidase P  47.88 
 
 
598 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2865  peptidase M24  46.83 
 
 
677 aa  504  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2301  peptidase M24  47.21 
 
 
633 aa  498  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.0238378 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3072  peptidase M24  49.32 
 
 
598 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.782089 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2193  peptidase M24  46.33 
 
 
605 aa  492  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0683  peptidase M24  47.7 
 
 
598 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2721  putative metallopeptidase  45.59 
 
 
618 aa  491  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0993196  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0438  peptidase M24  45.85 
 
 
601 aa  490  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0949825  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2743  peptidase M24  46.66 
 
 
600 aa  491  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32611  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2447  aminopeptidase P  44.19 
 
 
597 aa  479  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1086  peptidase M24  45.09 
 
 
601 aa  476  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.466224  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0952  peptidase M24  43.1 
 
 
595 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00360  Xaa-Pro aminopeptidase  43.71 
 
 
596 aa  462  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0213  peptidase M24  46.09 
 
 
596 aa  460  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22897  normal  0.0833498 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0641  peptidase M24  45.55 
 
 
594 aa  461  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2807  peptidase M24  42.11 
 
 
605 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.155072  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2986  peptidase M24  41.97 
 
 
604 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2990  putative metallopeptidase  42.43 
 
 
597 aa  457  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3095  peptidase M24  42.35 
 
 
595 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2890  peptidase M24  41.61 
 
 
605 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1282  peptidase M24  42.18 
 
 
595 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3238  peptidase M24  42.35 
 
 
595 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.470182  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3085  peptidase M24  42.35 
 
 
595 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.055146  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1388  aminopeptidase P, putative  41.78 
 
 
601 aa  451  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1592  peptidase M24  44.08 
 
 
603 aa  450  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400079  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0684  aminopeptidase P, putative  42.18 
 
 
599 aa  449  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1096  peptidase M24  42.71 
 
 
595 aa  450  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.37425  normal  0.472019 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0215  peptidase M24  44.59 
 
 
589 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.260741  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002078  Xaa-Pro aminopeptidase  43.4 
 
 
564 aa  445  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1024  peptidase M24  40.74 
 
 
595 aa  443  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0487462 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1198  peptidase M24  41.65 
 
 
595 aa  444  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0920  peptidase M24  40.98 
 
 
595 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00313884  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3047  peptidase M24  41.21 
 
 
595 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0887  peptidase M24  40.53 
 
 
604 aa  433  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0161  M24 family peptidase  40.03 
 
 
597 aa  421  1e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2033  Xaa-Pro aminopeptidase  40.2 
 
 
607 aa  421  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2545  peptidase M24  38 
 
 
599 aa  403  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11005  aminopeptidase P, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08050)  37.03 
 
 
654 aa  385  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1008  aminopeptidase P  38.49 
 
 
555 aa  378  1e-103  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2573  peptidase M24  37.79 
 
 
590 aa  363  3e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0932593 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2717  peptidase M24  38.93 
 
 
604 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4587  peptidase M24  36.47 
 
 
590 aa  360  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000648735  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41838  predicted protein  35.56 
 
 
626 aa  359  8e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0141589 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0854  M24 family metallopeptidase  35.95 
 
 
591 aa  355  1e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.701483  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3518  peptidase M24  38.7 
 
 
604 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.517955  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0440  putative Xaa-Pro aminopeptidase  38.54 
 
 
604 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52141  predicted protein  36.18 
 
 
608 aa  353  4e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.70287  decreased coverage  0.00225388 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3601  peptidase M24  38.37 
 
 
604 aa  352  8e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.735851  normal  0.937642 
 
 
-
 
NC_002950  PG1210  M24 family peptidase  37.91 
 
 
595 aa  352  8.999999999999999e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.472186 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1938  peptidase, M24 family protein  38.04 
 
 
604 aa  352  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.480402  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0507  peptidase, M24 family protein  38.04 
 
 
604 aa  352  1e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660051  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0671  peptidase, M24 family protein  38.04 
 
 
604 aa  352  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0967  peptidase, M24 family protein  38.04 
 
 
604 aa  352  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.022418  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2927  peptidase, M24 family protein  38.51 
 
 
604 aa  351  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3585  M24 family metallopeptidase  38.04 
 
 
604 aa  351  3e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519065  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3598  peptidase, M24 family protein  38.04 
 
 
604 aa  351  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.979645  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3609  M24 family metallopeptidase  38.04 
 
 
604 aa  351  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.827614  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0486  peptidase M24  38.7 
 
 
604 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0866  M24 family metallopeptidase  36.13 
 
 
591 aa  350  4e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23062  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2590  peptidase M24  38.54 
 
 
604 aa  349  8e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0514  peptidase M24  38.54 
 
 
604 aa  349  8e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232311  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0547  peptidase M24  34.53 
 
 
574 aa  345  1e-93  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.621521  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3502  peptidase M24  37.36 
 
 
602 aa  342  9e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0384792  normal  0.580745 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2924  peptidase M24  37.32 
 
 
605 aa  342  9e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.579237  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0479  M24 family metallopeptidase  35 
 
 
574 aa  342  2e-92  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1482  peptidase, M24 family protein  34 
 
 
585 aa  340  2.9999999999999998e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00151346  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11174  predicted protein  34.6 
 
 
627 aa  339  8e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0482679  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2884  peptidase M24  37.07 
 
 
604 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.185025 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0418  peptidase M24  37.5 
 
 
604 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1218  Xaa-Pro aminopeptidase  37.04 
 
 
589 aa  336  7e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0444  peptidase M24  37.34 
 
 
604 aa  334  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.739665  normal  0.291512 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4014  Xaa-Pro aminopeptidase  35.34 
 
 
591 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2238  peptidase M24  36.38 
 
 
633 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>