More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2717 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2334  peptidase M24  52.33 
 
 
607 aa  636    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.565369  normal  0.315472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1861  peptidase M24  62.58 
 
 
602 aa  764    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137789  normal  0.370091 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2884  peptidase M24  77.15 
 
 
604 aa  958    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.185025 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2238  peptidase M24  62.09 
 
 
633 aa  771    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0967  peptidase, M24 family protein  77.81 
 
 
604 aa  961    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.022418  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3437  peptidase, M24 family protein  59.27 
 
 
602 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193845  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3585  M24 family metallopeptidase  77.98 
 
 
604 aa  964    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519065  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3502  peptidase M24  62.09 
 
 
602 aa  774    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0384792  normal  0.580745 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0486  peptidase M24  76.82 
 
 
604 aa  970    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3609  M24 family metallopeptidase  77.98 
 
 
604 aa  964    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.827614  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0507  peptidase, M24 family protein  77.81 
 
 
604 aa  961    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660051  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3219  peptidase M24  61.09 
 
 
602 aa  771    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.538784  normal  0.627944 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1974  metallopeptidase protein  55 
 
 
605 aa  647    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0562373  normal  0.0522977 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0444  peptidase M24  76.49 
 
 
604 aa  953    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.739665  normal  0.291512 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3598  peptidase, M24 family protein  77.98 
 
 
604 aa  964    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.979645  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3911  peptidase M24  61.26 
 
 
602 aa  776    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102431  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3601  peptidase M24  76.66 
 
 
604 aa  952    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.735851  normal  0.937642 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2717  peptidase M24  100 
 
 
604 aa  1230    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2927  peptidase, M24 family protein  78.48 
 
 
604 aa  971    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3518  peptidase M24  82.78 
 
 
604 aa  1021    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.517955  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0440  putative Xaa-Pro aminopeptidase  82.78 
 
 
604 aa  1018    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2924  peptidase M24  62.29 
 
 
605 aa  751    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.579237  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2273  peptidase M24  54.83 
 
 
605 aa  647    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000600713 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2965  peptidase M24  64.85 
 
 
606 aa  789    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3435  peptidase M24  62.9 
 
 
602 aa  789    Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00259513  normal  0.40455 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2590  peptidase M24  77.15 
 
 
604 aa  973    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0671  peptidase, M24 family protein  77.81 
 
 
604 aa  961    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2217  putative peptidase, M24 family protein  63.15 
 
 
605 aa  753    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.50313  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0418  peptidase M24  76.82 
 
 
604 aa  953    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1938  peptidase, M24 family protein  77.81 
 
 
604 aa  961    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.480402  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0514  peptidase M24  77.15 
 
 
604 aa  973    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232311  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0681  M24 family peptidase  46.82 
 
 
596 aa  569  1e-161  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0961695  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0756  M24 family peptidase  46.66 
 
 
596 aa  566  1e-160  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1346  M24 family peptidase  46.15 
 
 
596 aa  561  1e-158  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4014  Xaa-Pro aminopeptidase  43.24 
 
 
591 aa  528  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4587  peptidase M24  44.46 
 
 
590 aa  514  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000648735  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0854  M24 family metallopeptidase  41.25 
 
 
591 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.701483  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0866  M24 family metallopeptidase  42.11 
 
 
591 aa  492  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23062  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1210  M24 family peptidase  43.75 
 
 
595 aa  484  1e-135  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.472186 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1218  Xaa-Pro aminopeptidase  42.86 
 
 
589 aa  483  1e-135  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1482  peptidase, M24 family protein  39.97 
 
 
585 aa  451  1e-125  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00151346  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003662  Xaa-Pro aminopeptidase  38.77 
 
 
598 aa  444  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1045  peptidase M24  37.1 
 
 
589 aa  442  1e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.472357  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41838  predicted protein  41 
 
 
626 aa  417  9.999999999999999e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0141589 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52141  predicted protein  41.16 
 
 
608 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.70287  decreased coverage  0.00225388 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11005  aminopeptidase P, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08050)  38.74 
 
 
654 aa  393  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0438  peptidase M24  39.77 
 
 
601 aa  384  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0949825  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0161  M24 family peptidase  38.1 
 
 
597 aa  382  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2033  Xaa-Pro aminopeptidase  37.94 
 
 
607 aa  379  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4945  peptidase M24  40.95 
 
 
612 aa  371  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.988879 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1758  peptidase M24  37.98 
 
 
608 aa  372  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284065  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3250  peptidase M24  40.44 
 
 
617 aa  371  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.54286  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2055  peptidase M24  40 
 
 
611 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268676  normal  0.0972871 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4994  peptidase M24  41 
 
 
610 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.651828  normal  0.317885 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2337  peptidase M24  40.77 
 
 
612 aa  368  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2743  peptidase M24  38.67 
 
 
600 aa  366  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32611  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11174  predicted protein  38.47 
 
 
627 aa  369  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0482679  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4480  peptidase M24  41.05 
 
 
612 aa  366  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.831039  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2434  peptidase M24  39.31 
 
 
604 aa  368  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411421  normal  0.660909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2571  peptidase M24  38.93 
 
 
611 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4443  peptidase M24  40.78 
 
 
611 aa  363  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2990  putative metallopeptidase  37.06 
 
 
597 aa  363  6e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2832  Xaa-Pro aminopeptidase  38.77 
 
 
628 aa  362  9e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.109252 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2865  peptidase M24  40.31 
 
 
677 aa  361  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2721  putative metallopeptidase  38.97 
 
 
618 aa  362  2e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0993196  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2193  peptidase M24  37.73 
 
 
605 aa  359  9e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0068  putative peptidase  35.76 
 
 
592 aa  357  3.9999999999999996e-97  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3047  peptidase M24  35.29 
 
 
595 aa  356  7.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00360  Xaa-Pro aminopeptidase  36.8 
 
 
596 aa  354  2e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2063  peptidase M24  37.08 
 
 
612 aa  352  1e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.507411 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2994  peptidase M24  37.23 
 
 
608 aa  350  3e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.020362 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1374  aminopeptidase P  37.21 
 
 
608 aa  350  5e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.993767  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1418  aminopeptidase P  37.21 
 
 
608 aa  350  6e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.413075  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1086  peptidase M24  37.23 
 
 
601 aa  348  1e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.466224  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02680  cytoplasm protein, putative  34.51 
 
 
647 aa  348  2e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.980721  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2159  peptidase M24  39.07 
 
 
612 aa  348  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.489456  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1096  peptidase M24  34.99 
 
 
595 aa  347  3e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.37425  normal  0.472019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1975  aminopeptidase P  37.42 
 
 
598 aa  346  8e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1388  aminopeptidase P, putative  34.92 
 
 
601 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2545  peptidase M24  35.71 
 
 
599 aa  346  8.999999999999999e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3238  peptidase M24  34.78 
 
 
595 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.470182  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0920  peptidase M24  34.4 
 
 
595 aa  345  1e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00313884  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2447  aminopeptidase P  35.87 
 
 
597 aa  345  2e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3095  peptidase M24  34.44 
 
 
595 aa  345  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2807  peptidase M24  35.23 
 
 
605 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.155072  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1282  peptidase M24  34.44 
 
 
595 aa  343  4e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2986  peptidase M24  35.23 
 
 
604 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6160  putative aminopeptidase P  37.56 
 
 
607 aa  343  7e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0482402 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0952  peptidase M24  35.55 
 
 
595 aa  343  7e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1198  peptidase M24  35.4 
 
 
595 aa  342  9e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0641  peptidase M24  37.37 
 
 
594 aa  342  1e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0936  M24 family peptidase  34.96 
 
 
607 aa  342  1e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.217659  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3085  peptidase M24  34.56 
 
 
595 aa  342  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.055146  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2855  aminopeptidase P  35.93 
 
 
615 aa  341  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151191  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1994  peptidase M24  36.85 
 
 
608 aa  341  2.9999999999999998e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1024  peptidase M24  34.83 
 
 
595 aa  339  7e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0487462 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2890  peptidase M24  34.56 
 
 
605 aa  339  7e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3072  peptidase M24  37.63 
 
 
598 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.782089 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002078  Xaa-Pro aminopeptidase  35.91 
 
 
564 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0684  aminopeptidase P, putative  35.21 
 
 
599 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>