More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3379 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4994  peptidase M24  59.27 
 
 		 610 aa  699    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.651828  normal  0.317885 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4033  peptidase M24  87.17 
 
 		 609 aa  1084    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0371285  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1427  peptidase M24  56.84 
 
 		 604 aa  662    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.85794 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2434  peptidase M24  55.83 
 
 		 604 aa  664    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411421  normal  0.660909 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4480  peptidase M24  59.11 
 
 		 612 aa  687    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.831039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6160  putative aminopeptidase P  81.71 
 
 		 607 aa  994    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0482402 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2368  peptidase M24  81.88 
 
 		 644 aa  1007    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.436268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3250  peptidase M24  57.5 
 
 		 617 aa  674    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.54286  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2301  peptidase M24  56.77 
 
 		 633 aa  658    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.0238378 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2010  peptidase M24  88.18 
 
 		 609 aa  1105    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.623866  normal  0.492859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3291  peptidase M24  83.86 
 
 		 608 aa  1037    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3379  peptidase M24  100 
 
 		 609 aa  1226    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379289  decreased coverage  0.00212976 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2747  peptidase M24  80.23 
 
 		 630 aa  987    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4443  peptidase M24  57.33 
 
 		 611 aa  658    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2159  peptidase M24  56.68 
 
 		 612 aa  677    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4945  peptidase M24  59.8 
 
 		 612 aa  693    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.988879 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2337  peptidase M24  56.38 
 
 		 612 aa  632  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1994  peptidase M24  52.3 
 
 		 608 aa  615  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1374  aminopeptidase P  50.66 
 
 		 608 aa  593  1e-168  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.993767  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1418  aminopeptidase P  50.66 
 
 		 608 aa  592  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.413075  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1086  peptidase M24  52.63 
 
 		 601 aa  593  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.466224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1758  peptidase M24  50.33 
 
 		 608 aa  591  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284065  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2865  peptidase M24  51.25 
 
 		 677 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2994  peptidase M24  50.59 
 
 		 608 aa  569  1e-161  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.020362 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2855  aminopeptidase P  48.53 
 
 		 615 aa  561  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151191  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0438  peptidase M24  50 
 
 		 601 aa  559  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0949825  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2055  peptidase M24  49.51 
 
 		 611 aa  558  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268676  normal  0.0972871 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2063  peptidase M24  47.85 
 
 		 612 aa  556  1e-157  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.507411 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2832  Xaa-Pro aminopeptidase  49.11 
 
 		 628 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.109252 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0215  peptidase M24  52.02 
 
 		 589 aa  547  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.260741  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2571  peptidase M24  48.78 
 
 		 611 aa  547  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0936  M24 family peptidase  45.57 
 
 		 607 aa  546  1e-154  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.217659  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1975  aminopeptidase P  48.17 
 
 		 598 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0683  peptidase M24  48.43 
 
 		 598 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2743  peptidase M24  48.94 
 
 		 600 aa  515  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3072  peptidase M24  49.48 
 
 		 598 aa  512  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.782089 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2193  peptidase M24  47.52 
 
 		 605 aa  513  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2447  aminopeptidase P  46.4 
 
 		 597 aa  502  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2721  putative metallopeptidase  47.21 
 
 		 618 aa  503  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0993196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00360  Xaa-Pro aminopeptidase  44.5 
 
 		 596 aa  501  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1388  aminopeptidase P, putative  45.01 
 
 		 601 aa  486  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1592  peptidase M24  47.52 
 
 		 603 aa  486  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2807  peptidase M24  43.84 
 
 		 605 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.155072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2986  peptidase M24  44.01 
 
 		 604 aa  486  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0952  peptidase M24  46.09 
 
 		 595 aa  485  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2890  peptidase M24  43.51 
 
 		 605 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3238  peptidase M24  43.49 
 
 		 595 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.470182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1282  peptidase M24  43.32 
 
 		 595 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3095  peptidase M24  43.15 
 
 		 595 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0684  aminopeptidase P, putative  44.58 
 
 		 599 aa  481  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2990  putative metallopeptidase  42.23 
 
 		 597 aa  480  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0920  peptidase M24  43.19 
 
 		 595 aa  476  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00313884  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3085  peptidase M24  43.1 
 
 		 595 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.055146  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1198  peptidase M24  43.34 
 
 		 595 aa  474  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3047  peptidase M24  42.42 
 
 		 595 aa  473  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0213  peptidase M24  46.49 
 
 		 596 aa  475  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22897  normal  0.0833498 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1024  peptidase M24  43.27 
 
 		 595 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0487462 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002078  Xaa-Pro aminopeptidase  43.87 
 
 		 564 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0641  peptidase M24  44.9 
 
 		 594 aa  467  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0887  peptidase M24  42.62 
 
 		 604 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1096  peptidase M24  42.57 
 
 		 595 aa  457  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.37425  normal  0.472019 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0161  M24 family peptidase  41.5 
 
 		 597 aa  437  1e-121  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2033  Xaa-Pro aminopeptidase  41.5 
 
 		 607 aa  436  1e-121  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2545  peptidase M24  39.56 
 
 		 599 aa  431  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11005  aminopeptidase P, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08050)  39.15 
 
 		 654 aa  424  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2573  peptidase M24  39.86 
 
 		 590 aa  409  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0932593 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41838  predicted protein  39.03 
 
 		 626 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0141589 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52141  predicted protein  38.85 
 
 		 608 aa  397  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.70287  decreased coverage  0.00225388 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11174  predicted protein  38.66 
 
 		 627 aa  390  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0482679  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0547  peptidase M24  35.19 
 
 		 574 aa  382  1e-104  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.621521  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0479  M24 family metallopeptidase  35.41 
 
 		 574 aa  375  1e-103  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0854  M24 family metallopeptidase  35.29 
 
 		 591 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.701483  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1482  peptidase, M24 family protein  34.95 
 
 		 585 aa  369  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00151346  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4587  peptidase M24  36.73 
 
 		 590 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000648735  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2273  peptidase M24  38.7 
 
 		 605 aa  370  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600713 
 
 
-
 
NC_002950  PG1210  M24 family peptidase  37.1 
 
 		 595 aa  367  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.472186 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1974  metallopeptidase protein  38.47 
 
 		 605 aa  366  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0562373  normal  0.0522977 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0866  M24 family metallopeptidase  34.31 
 
 		 591 aa  365  1e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23062  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2924  peptidase M24  38.95 
 
 		 605 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.579237  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1008  aminopeptidase P  35.93 
 
 		 555 aa  356  6.999999999999999e-97  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02680  cytoplasm protein, putative  35.29 
 
 		 647 aa  355  2e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.980721  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2334  peptidase M24  35.21 
 
 		 607 aa  348  2e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.565369  normal  0.315472 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75738  X-Pro aminopeptidase  32.76 
 
 		 710 aa  346  7e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.511861 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0471  M24 family metallopeptidase  37.04 
 
 		 545 aa  346  7e-94  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003662  Xaa-Pro aminopeptidase  35 
 
 		 598 aa  345  1e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2590  peptidase M24  37.27 
 
 		 604 aa  340  5e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0514  peptidase M24  37.27 
 
 		 604 aa  340  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232311  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1218  Xaa-Pro aminopeptidase  35.53 
 
 		 589 aa  340  5.9999999999999996e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3219  peptidase M24  35.34 
 
 		 602 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.538784  normal  0.627944 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0486  peptidase M24  37.27 
 
 		 604 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0507  peptidase, M24 family protein  36.29 
 
 		 604 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660051  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3518  peptidase M24  36.06 
 
 		 604 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.517955  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0671  peptidase, M24 family protein  36.29 
 
 		 604 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1938  peptidase, M24 family protein  36.29 
 
 		 604 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.480402  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0967  peptidase, M24 family protein  36.29 
 
 		 604 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.022418  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3585  M24 family metallopeptidase  36.29 
 
 		 604 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519065  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3609  M24 family metallopeptidase  36.29 
 
 		 604 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.827614  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3598  peptidase, M24 family protein  36.29 
 
 		 604 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.979645  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1045  peptidase M24  31.71 
 
 		 589 aa  337  5e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.472357  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2717  peptidase M24  36.47 
 
 		 604 aa  334  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>