More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2965 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3435  peptidase M24  58.8 
 
 		 602 aa  696    Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00259513  normal  0.40455 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2238  peptidase M24  58.84 
 
 		 633 aa  694    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1938  peptidase, M24 family protein  64.55 
 
 		 604 aa  745    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.480402  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0967  peptidase, M24 family protein  64.55 
 
 		 604 aa  745    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.022418  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3437  peptidase, M24 family protein  58.21 
 
 		 602 aa  694    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193845  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0671  peptidase, M24 family protein  64.55 
 
 		 604 aa  745    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0507  peptidase, M24 family protein  64.55 
 
 		 604 aa  745    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660051  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3518  peptidase M24  65.23 
 
 		 604 aa  780    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.517955  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3219  peptidase M24  58.37 
 
 		 602 aa  701    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.538784  normal  0.627944 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2965  peptidase M24  100 
 
 		 606 aa  1223    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3598  peptidase, M24 family protein  64.72 
 
 		 604 aa  750    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.979645  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3911  peptidase M24  59.51 
 
 		 602 aa  728    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3601  peptidase M24  63.55 
 
 		 604 aa  736    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.735851  normal  0.937642 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0444  peptidase M24  63.71 
 
 		 604 aa  739    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.739665  normal  0.291512 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2717  peptidase M24  64.85 
 
 		 604 aa  782    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2927  peptidase, M24 family protein  64.72 
 
 		 604 aa  755    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0440  putative Xaa-Pro aminopeptidase  65.73 
 
 		 604 aa  786    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2924  peptidase M24  60.1 
 
 		 605 aa  697    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.579237  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2884  peptidase M24  64.21 
 
 		 604 aa  742    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.185025 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2590  peptidase M24  63.71 
 
 		 604 aa  756    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3502  peptidase M24  59.83 
 
 		 602 aa  709    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0384792  normal  0.580745 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2217  putative peptidase, M24 family protein  72.28 
 
 		 605 aa  878    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.50313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0418  peptidase M24  63.88 
 
 		 604 aa  743    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1861  peptidase M24  59.01 
 
 		 602 aa  692    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137789  normal  0.370091 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0514  peptidase M24  63.71 
 
 		 604 aa  756    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232311  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0486  peptidase M24  63.55 
 
 		 604 aa  752    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3609  M24 family metallopeptidase  64.72 
 
 		 604 aa  750    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.827614  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3585  M24 family metallopeptidase  64.72 
 
 		 604 aa  750    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519065  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1974  metallopeptidase protein  53.64 
 
 		 605 aa  621  1e-177  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0562373  normal  0.0522977 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2334  peptidase M24  52.22 
 
 		 607 aa  619  1e-176  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.565369  normal  0.315472 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2273  peptidase M24  52.81 
 
 		 605 aa  610  1e-173  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600713 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0681  M24 family peptidase  46.85 
 
 		 596 aa  551  1e-155  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0961695  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0756  M24 family peptidase  46.69 
 
 		 596 aa  548  1e-154  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1346  M24 family peptidase  46.19 
 
 		 596 aa  541  1e-153  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4014  Xaa-Pro aminopeptidase  41.97 
 
 		 591 aa  494  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0854  M24 family metallopeptidase  39.17 
 
 		 591 aa  473  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.701483  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0866  M24 family metallopeptidase  40.14 
 
 		 591 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23062  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1210  M24 family peptidase  42.34 
 
 		 595 aa  460  9.999999999999999e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.472186 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4587  peptidase M24  40.81 
 
 		 590 aa  456  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000648735  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003662  Xaa-Pro aminopeptidase  40.23 
 
 		 598 aa  449  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1218  Xaa-Pro aminopeptidase  40.87 
 
 		 589 aa  434  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1482  peptidase, M24 family protein  38 
 
 		 585 aa  411  1e-113  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00151346  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1045  peptidase M24  35.67 
 
 		 589 aa  403  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.472357  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41838  predicted protein  38.79 
 
 		 626 aa  395  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0141589 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52141  predicted protein  38.79 
 
 		 608 aa  385  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.70287  decreased coverage  0.00225388 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0438  peptidase M24  39.74 
 
 		 601 aa  360  3e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0949825  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3250  peptidase M24  40.84 
 
 		 617 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.54286  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0161  M24 family peptidase  36.38 
 
 		 597 aa  354  2e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2033  Xaa-Pro aminopeptidase  36.38 
 
 		 607 aa  353  4e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2434  peptidase M24  38.45 
 
 		 604 aa  352  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411421  normal  0.660909 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11005  aminopeptidase P, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08050)  34.46 
 
 		 654 aa  352  2e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0068  putative peptidase  35.12 
 
 		 592 aa  350  3e-95  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11174  predicted protein  36.26 
 
 		 627 aa  350  4e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0482679  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4994  peptidase M24  40.23 
 
 		 610 aa  345  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.651828  normal  0.317885 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2743  peptidase M24  37.97 
 
 		 600 aa  342  1e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2337  peptidase M24  39.6 
 
 		 612 aa  342  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4945  peptidase M24  39.8 
 
 		 612 aa  341  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.988879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1086  peptidase M24  38.27 
 
 		 601 aa  340  5.9999999999999996e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.466224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2159  peptidase M24  38.24 
 
 		 612 aa  339  9e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4480  peptidase M24  39.64 
 
 		 612 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.831039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2865  peptidase M24  38.19 
 
 		 677 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2545  peptidase M24  35.36 
 
 		 599 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1975  aminopeptidase P  39.9 
 
 		 598 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00360  Xaa-Pro aminopeptidase  35.97 
 
 		 596 aa  337  5e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1994  peptidase M24  37.48 
 
 		 608 aa  335  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2063  peptidase M24  37.25 
 
 		 612 aa  334  3e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.507411 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1758  peptidase M24  37.11 
 
 		 608 aa  333  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284065  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1427  peptidase M24  38.23 
 
 		 604 aa  333  6e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.85794 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2990  putative metallopeptidase  35.22 
 
 		 597 aa  332  9e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02680  cytoplasm protein, putative  34.15 
 
 		 647 aa  331  2e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.980721  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0683  peptidase M24  39.59 
 
 		 598 aa  331  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2447  aminopeptidase P  36.75 
 
 		 597 aa  330  6e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1096  peptidase M24  35.47 
 
 		 595 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.37425  normal  0.472019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4443  peptidase M24  40.84 
 
 		 611 aa  327  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1388  aminopeptidase P, putative  35.7 
 
 		 601 aa  326  9e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3291  peptidase M24  37.83 
 
 		 608 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2368  peptidase M24  36.56 
 
 		 644 aa  324  3e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.436268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2994  peptidase M24  36.65 
 
 		 608 aa  324  3e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.020362 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2721  putative metallopeptidase  37.6 
 
 		 618 aa  323  5e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0993196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0887  peptidase M24  35.95 
 
 		 604 aa  323  6e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2193  peptidase M24  36.82 
 
 		 605 aa  323  7e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1024  peptidase M24  36.24 
 
 		 595 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0487462 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002078  Xaa-Pro aminopeptidase  36.1 
 
 		 564 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2890  peptidase M24  35.31 
 
 		 605 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2986  peptidase M24  35.31 
 
 		 604 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0213  peptidase M24  37.77 
 
 		 596 aa  321  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22897  normal  0.0833498 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1374  aminopeptidase P  36.35 
 
 		 608 aa  320  5e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.993767  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1418  aminopeptidase P  36.35 
 
 		 608 aa  320  6e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.413075  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1198  peptidase M24  35.97 
 
 		 595 aa  320  7e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2055  peptidase M24  37.96 
 
 		 611 aa  319  9e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268676  normal  0.0972871 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2807  peptidase M24  35.15 
 
 		 605 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.155072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3047  peptidase M24  35.84 
 
 		 595 aa  319  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3238  peptidase M24  35.03 
 
 		 595 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.470182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0920  peptidase M24  34.43 
 
 		 595 aa  318  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00313884  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0641  peptidase M24  37.46 
 
 		 594 aa  317  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4033  peptidase M24  35.97 
 
 		 609 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0371285  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0215  peptidase M24  38.31 
 
 		 589 aa  317  5e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.260741  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2301  peptidase M24  38.1 
 
 		 633 aa  317  5e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.0238378 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0684  aminopeptidase P, putative  36.5 
 
 		 599 aa  316  8e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3095  peptidase M24  34.65 
 
 		 595 aa  316  9e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>