More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2055 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1418  aminopeptidase P  58.18 
 
 		 608 aa  701    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.413075  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2571  peptidase M24  70.98 
 
 		 611 aa  916    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2055  peptidase M24  100 
 
 		 611 aa  1240    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268676  normal  0.0972871 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1758  peptidase M24  57.69 
 
 		 608 aa  701    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284065  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1374  aminopeptidase P  58.35 
 
 		 608 aa  703    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.993767  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2855  aminopeptidase P  68.09 
 
 		 615 aa  871    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151191  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2832  Xaa-Pro aminopeptidase  72.46 
 
 		 628 aa  930    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.109252 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2434  peptidase M24  52.46 
 
 		 604 aa  627  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411421  normal  0.660909 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0936  M24 family peptidase  50.33 
 
 		 607 aa  628  1e-178  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.217659  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1994  peptidase M24  52.22 
 
 		 608 aa  624  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2010  peptidase M24  50.25 
 
 		 609 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.623866  normal  0.492859 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2159  peptidase M24  48.95 
 
 		 612 aa  564  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2368  peptidase M24  50.33 
 
 		 644 aa  559  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.436268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4033  peptidase M24  49.18 
 
 		 609 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0371285  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3379  peptidase M24  49.51 
 
 		 609 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379289  decreased coverage  0.00212976 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2721  putative metallopeptidase  50.25 
 
 		 618 aa  553  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0993196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4994  peptidase M24  50.49 
 
 		 610 aa  550  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.651828  normal  0.317885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4945  peptidase M24  50.49 
 
 		 612 aa  551  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.988879 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3291  peptidase M24  49.02 
 
 		 608 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4480  peptidase M24  50.33 
 
 		 612 aa  546  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.831039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6160  putative aminopeptidase P  49.5 
 
 		 607 aa  541  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0482402 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1427  peptidase M24  48.93 
 
 		 604 aa  537  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.85794 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1975  aminopeptidase P  50.34 
 
 		 598 aa  535  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2747  peptidase M24  49.02 
 
 		 630 aa  536  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3250  peptidase M24  51.07 
 
 		 617 aa  531  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.54286  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2063  peptidase M24  45.81 
 
 		 612 aa  528  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.507411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4443  peptidase M24  52.23 
 
 		 611 aa  525  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2193  peptidase M24  48.12 
 
 		 605 aa  527  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3072  peptidase M24  51.02 
 
 		 598 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.782089 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0683  peptidase M24  49.84 
 
 		 598 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2994  peptidase M24  49.01 
 
 		 608 aa  521  1e-146  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.020362 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2743  peptidase M24  48.45 
 
 		 600 aa  513  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2337  peptidase M24  48.85 
 
 		 612 aa  509  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2865  peptidase M24  46.66 
 
 		 677 aa  498  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0438  peptidase M24  47.25 
 
 		 601 aa  496  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0949825  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0641  peptidase M24  48.4 
 
 		 594 aa  498  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2301  peptidase M24  46.95 
 
 		 633 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.0238378 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1086  peptidase M24  46.41 
 
 		 601 aa  490  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.466224  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1388  aminopeptidase P, putative  43.41 
 
 		 601 aa  479  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2807  peptidase M24  43.05 
 
 		 605 aa  480  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.155072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2986  peptidase M24  43.07 
 
 		 604 aa  481  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3095  peptidase M24  42.81 
 
 		 595 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2447  aminopeptidase P  44.07 
 
 		 597 aa  477  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3238  peptidase M24  42.98 
 
 		 595 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.470182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2890  peptidase M24  42.74 
 
 		 605 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1282  peptidase M24  42.81 
 
 		 595 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3085  peptidase M24  42.81 
 
 		 595 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.055146  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2990  putative metallopeptidase  42.55 
 
 		 597 aa  466  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1198  peptidase M24  43.31 
 
 		 595 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0952  peptidase M24  43.41 
 
 		 595 aa  462  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3047  peptidase M24  43.19 
 
 		 595 aa  463  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0684  aminopeptidase P, putative  42.24 
 
 		 599 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00360  Xaa-Pro aminopeptidase  43.57 
 
 		 596 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1592  peptidase M24  44.81 
 
 		 603 aa  456  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1024  peptidase M24  43.24 
 
 		 595 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0487462 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0920  peptidase M24  40.97 
 
 		 595 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00313884  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0215  peptidase M24  45.67 
 
 		 589 aa  451  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.260741  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1096  peptidase M24  42.45 
 
 		 595 aa  451  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.37425  normal  0.472019 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002078  Xaa-Pro aminopeptidase  43.96 
 
 		 564 aa  444  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0887  peptidase M24  42.09 
 
 		 604 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0213  peptidase M24  44.7 
 
 		 596 aa  435  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22897  normal  0.0833498 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2033  Xaa-Pro aminopeptidase  40.13 
 
 		 607 aa  429  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0161  M24 family peptidase  40.13 
 
 		 597 aa  431  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2545  peptidase M24  37.58 
 
 		 599 aa  404  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11005  aminopeptidase P, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08050)  37.93 
 
 		 654 aa  399  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2573  peptidase M24  39.39 
 
 		 590 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0932593 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41838  predicted protein  37.21 
 
 		 626 aa  382  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0141589 
 
 
-
 
NC_002978  WD1008  aminopeptidase P  38.11 
 
 		 555 aa  379  1e-103  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4587  peptidase M24  37.75 
 
 		 590 aa  375  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000648735  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52141  predicted protein  37.48 
 
 		 608 aa  374  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.70287  decreased coverage  0.00225388 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0440  putative Xaa-Pro aminopeptidase  39.94 
 
 		 604 aa  372  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2717  peptidase M24  39.25 
 
 		 604 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3518  peptidase M24  39.29 
 
 		 604 aa  362  8e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.517955  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0854  M24 family metallopeptidase  35.49 
 
 		 591 aa  360  4e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.701483  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0671  peptidase, M24 family protein  39.14 
 
 		 604 aa  360  5e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1938  peptidase, M24 family protein  39.14 
 
 		 604 aa  360  5e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.480402  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0507  peptidase, M24 family protein  39.14 
 
 		 604 aa  360  5e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660051  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3598  peptidase, M24 family protein  39.14 
 
 		 604 aa  360  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.979645  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3585  M24 family metallopeptidase  39.14 
 
 		 604 aa  360  5e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519065  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0967  peptidase, M24 family protein  39.14 
 
 		 604 aa  360  5e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.022418  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3609  M24 family metallopeptidase  39.14 
 
 		 604 aa  360  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.827614  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0866  M24 family metallopeptidase  35.95 
 
 		 591 aa  359  8e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23062  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0547  peptidase M24  33.89 
 
 		 574 aa  358  9.999999999999999e-98  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.621521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2927  peptidase, M24 family protein  38.97 
 
 		 604 aa  355  1e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2273  peptidase M24  37.44 
 
 		 605 aa  352  1e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600713 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0486  peptidase M24  39.16 
 
 		 604 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11174  predicted protein  36.79 
 
 		 627 aa  351  3e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0482679  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1974  metallopeptidase protein  38.27 
 
 		 605 aa  350  4e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0562373  normal  0.0522977 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2590  peptidase M24  39 
 
 		 604 aa  350  5e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0514  peptidase M24  39 
 
 		 604 aa  350  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232311  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3502  peptidase M24  38.3 
 
 		 602 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0384792  normal  0.580745 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3601  peptidase M24  38.96 
 
 		 604 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.735851  normal  0.937642 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2924  peptidase M24  38.36 
 
 		 605 aa  348  1e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.579237  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1218  Xaa-Pro aminopeptidase  38.44 
 
 		 589 aa  348  2e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0479  M24 family metallopeptidase  34.72 
 
 		 574 aa  347  3e-94  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2334  peptidase M24  36.93 
 
 		 607 aa  343  4e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.565369  normal  0.315472 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1482  peptidase, M24 family protein  34.67 
 
 		 585 aa  343  5.999999999999999e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00151346  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2238  peptidase M24  37.93 
 
 		 633 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3911  peptidase M24  38.78 
 
 		 602 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102431  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1210  M24 family peptidase  38.1 
 
 		 595 aa  340  4e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.472186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>