More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1974 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_3585  M24 family metallopeptidase  54.92 
 
 
604 aa  642    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519065  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0671  peptidase, M24 family protein  54.76 
 
 
604 aa  636    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1938  peptidase, M24 family protein  54.76 
 
 
604 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.480402  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0507  peptidase, M24 family protein  54.76 
 
 
604 aa  636    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660051  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1974  metallopeptidase protein  100 
 
 
605 aa  1243    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0562373  normal  0.0522977 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3598  peptidase, M24 family protein  54.92 
 
 
604 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.979645  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3911  peptidase M24  55 
 
 
602 aa  657    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102431  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2334  peptidase M24  74.8 
 
 
607 aa  951    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.565369  normal  0.315472 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3609  M24 family metallopeptidase  54.92 
 
 
604 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.827614  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0444  peptidase M24  54.42 
 
 
604 aa  635    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.739665  normal  0.291512 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2927  peptidase, M24 family protein  55.09 
 
 
604 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2924  peptidase M24  54.94 
 
 
605 aa  641    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.579237  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2273  peptidase M24  91.4 
 
 
605 aa  1155    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000600713 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0967  peptidase, M24 family protein  54.76 
 
 
604 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.022418  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0418  peptidase M24  54.59 
 
 
604 aa  636    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2717  peptidase M24  55 
 
 
604 aa  637    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3502  peptidase M24  53.17 
 
 
602 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0384792  normal  0.580745 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2217  putative peptidase, M24 family protein  54.39 
 
 
605 aa  633  1e-180  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.50313  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3435  peptidase M24  53.15 
 
 
602 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00259513  normal  0.40455 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2238  peptidase M24  52.83 
 
 
633 aa  628  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3518  peptidase M24  54.23 
 
 
604 aa  629  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.517955  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3219  peptidase M24  53.77 
 
 
602 aa  630  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.538784  normal  0.627944 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0486  peptidase M24  53.76 
 
 
604 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0440  putative Xaa-Pro aminopeptidase  54.06 
 
 
604 aa  630  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2590  peptidase M24  53.59 
 
 
604 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0514  peptidase M24  53.59 
 
 
604 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232311  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3437  peptidase, M24 family protein  53.1 
 
 
602 aa  625  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193845  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2884  peptidase M24  53.92 
 
 
604 aa  622  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.185025 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3601  peptidase M24  54.09 
 
 
604 aa  624  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.735851  normal  0.937642 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2965  peptidase M24  53.64 
 
 
606 aa  621  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1861  peptidase M24  52.67 
 
 
602 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137789  normal  0.370091 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0681  M24 family peptidase  47.91 
 
 
596 aa  597  1e-169  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0961695  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0756  M24 family peptidase  47.41 
 
 
596 aa  590  1e-167  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1346  M24 family peptidase  47.08 
 
 
596 aa  588  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1210  M24 family peptidase  42.6 
 
 
595 aa  478  1e-133  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.472186 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4587  peptidase M24  41.81 
 
 
590 aa  473  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000648735  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0866  M24 family metallopeptidase  40.48 
 
 
591 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23062  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0854  M24 family metallopeptidase  39.37 
 
 
591 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.701483  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4014  Xaa-Pro aminopeptidase  40.57 
 
 
591 aa  460  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1045  peptidase M24  38.47 
 
 
589 aa  444  1e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.472357  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003662  Xaa-Pro aminopeptidase  39.17 
 
 
598 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1482  peptidase, M24 family protein  38.44 
 
 
585 aa  432  1e-119  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00151346  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1218  Xaa-Pro aminopeptidase  39.19 
 
 
589 aa  420  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41838  predicted protein  36.22 
 
 
626 aa  383  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0141589 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52141  predicted protein  36.53 
 
 
608 aa  378  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.70287  decreased coverage  0.00225388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3291  peptidase M24  37.89 
 
 
608 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2033  Xaa-Pro aminopeptidase  36.11 
 
 
607 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0161  M24 family peptidase  36.11 
 
 
597 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2010  peptidase M24  36.98 
 
 
609 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.623866  normal  0.492859 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11174  predicted protein  37.38 
 
 
627 aa  367  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0482679  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2159  peptidase M24  38.83 
 
 
612 aa  363  5.0000000000000005e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.489456  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2368  peptidase M24  37.89 
 
 
644 aa  363  7.0000000000000005e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.436268  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4994  peptidase M24  38.71 
 
 
610 aa  362  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.651828  normal  0.317885 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1994  peptidase M24  37.32 
 
 
608 aa  361  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3379  peptidase M24  37.81 
 
 
609 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379289  decreased coverage  0.00212976 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4033  peptidase M24  36.5 
 
 
609 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0371285  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4945  peptidase M24  38.65 
 
 
612 aa  356  7.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.988879 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6160  putative aminopeptidase P  36.59 
 
 
607 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0482402 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4480  peptidase M24  38.12 
 
 
612 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.831039  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3250  peptidase M24  39.36 
 
 
617 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.54286  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2747  peptidase M24  36.53 
 
 
630 aa  353  7e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0684  aminopeptidase P, putative  36.18 
 
 
599 aa  352  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2986  peptidase M24  35.97 
 
 
604 aa  350  5e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2807  peptidase M24  35.81 
 
 
605 aa  349  8e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.155072  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1024  peptidase M24  36.66 
 
 
595 aa  349  9e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0487462 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1975  aminopeptidase P  37.82 
 
 
598 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2994  peptidase M24  36.68 
 
 
608 aa  348  2e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.020362 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11005  aminopeptidase P, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08050)  35.77 
 
 
654 aa  347  3e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2890  peptidase M24  35.64 
 
 
605 aa  347  4e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2865  peptidase M24  36.27 
 
 
677 aa  346  8.999999999999999e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00360  Xaa-Pro aminopeptidase  35.32 
 
 
596 aa  345  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1388  aminopeptidase P, putative  35.97 
 
 
601 aa  345  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02680  cytoplasm protein, putative  33.89 
 
 
647 aa  344  2e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.980721  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3095  peptidase M24  35.42 
 
 
595 aa  343  5e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1198  peptidase M24  35.7 
 
 
595 aa  343  7e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3238  peptidase M24  35.47 
 
 
595 aa  343  8e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.470182  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1282  peptidase M24  35.26 
 
 
595 aa  342  9e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1096  peptidase M24  34.75 
 
 
595 aa  342  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.37425  normal  0.472019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4443  peptidase M24  39.32 
 
 
611 aa  342  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3085  peptidase M24  35.26 
 
 
595 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.055146  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1758  peptidase M24  36.23 
 
 
608 aa  341  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284065  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2055  peptidase M24  38.27 
 
 
611 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268676  normal  0.0972871 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2434  peptidase M24  36.57 
 
 
604 aa  340  4e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411421  normal  0.660909 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0438  peptidase M24  37.87 
 
 
601 aa  339  7e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0949825  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1086  peptidase M24  36.06 
 
 
601 aa  339  8e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.466224  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0683  peptidase M24  37.8 
 
 
598 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0936  M24 family peptidase  34.7 
 
 
607 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.217659  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3047  peptidase M24  36.23 
 
 
595 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2337  peptidase M24  37.94 
 
 
612 aa  337  5e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2447  aminopeptidase P  35.62 
 
 
597 aa  335  1e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0068  putative peptidase  34.43 
 
 
592 aa  335  2e-90  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0920  peptidase M24  34.54 
 
 
595 aa  334  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00313884  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2990  putative metallopeptidase  34.58 
 
 
597 aa  334  3e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1427  peptidase M24  36.29 
 
 
604 aa  333  5e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.85794 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2721  putative metallopeptidase  36.14 
 
 
618 aa  332  9e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0993196  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1418  aminopeptidase P  36.39 
 
 
608 aa  331  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.413075  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1374  aminopeptidase P  36.39 
 
 
608 aa  331  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.993767  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3072  peptidase M24  37.7 
 
 
598 aa  331  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.782089 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0887  peptidase M24  34.36 
 
 
604 aa  329  7e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2832  Xaa-Pro aminopeptidase  38.49 
 
 
628 aa  329  8e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.109252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>