More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0887 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0952  peptidase M24  72.29 
 
 		 595 aa  883    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1096  peptidase M24  70.78 
 
 		 595 aa  885    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.37425  normal  0.472019 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3085  peptidase M24  75.29 
 
 		 595 aa  950    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.055146  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2545  peptidase M24  53.58 
 
 		 599 aa  657    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1024  peptidase M24  68.78 
 
 		 595 aa  867    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0487462 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1388  aminopeptidase P, putative  75.58 
 
 		 601 aa  958    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3095  peptidase M24  75.46 
 
 		 595 aa  952    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1198  peptidase M24  75.46 
 
 		 595 aa  951    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0887  peptidase M24  100 
 
 		 604 aa  1246    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3238  peptidase M24  75.96 
 
 		 595 aa  956    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.470182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2807  peptidase M24  76.34 
 
 		 605 aa  968    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.155072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2890  peptidase M24  76.17 
 
 		 605 aa  963    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3047  peptidase M24  76.21 
 
 		 595 aa  952    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0684  aminopeptidase P, putative  71.52 
 
 		 599 aa  890    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0920  peptidase M24  67.61 
 
 		 595 aa  855    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00313884  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2986  peptidase M24  77.01 
 
 		 604 aa  976    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1282  peptidase M24  75.46 
 
 		 595 aa  952    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00360  Xaa-Pro aminopeptidase  52.62 
 
 		 596 aa  624  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2447  aminopeptidase P  52.31 
 
 		 597 aa  618  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2990  putative metallopeptidase  51.68 
 
 		 597 aa  618  1e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002078  Xaa-Pro aminopeptidase  52.47 
 
 		 564 aa  599  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2063  peptidase M24  46.97 
 
 		 612 aa  531  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.507411 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2865  peptidase M24  47.95 
 
 		 677 aa  523  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2994  peptidase M24  47.16 
 
 		 608 aa  521  1e-146  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.020362 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2434  peptidase M24  46.28 
 
 		 604 aa  512  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411421  normal  0.660909 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0438  peptidase M24  47.06 
 
 		 601 aa  510  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0949825  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1086  peptidase M24  46.11 
 
 		 601 aa  503  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.466224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2368  peptidase M24  44.97 
 
 		 644 aa  481  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.436268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2747  peptidase M24  44.31 
 
 		 630 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1994  peptidase M24  42.43 
 
 		 608 aa  466  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4033  peptidase M24  43.05 
 
 		 609 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0371285  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2743  peptidase M24  45.33 
 
 		 600 aa  464  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1427  peptidase M24  45.71 
 
 		 604 aa  464  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.85794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4994  peptidase M24  43.26 
 
 		 610 aa  463  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.651828  normal  0.317885 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3291  peptidase M24  42.67 
 
 		 608 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1592  peptidase M24  44.41 
 
 		 603 aa  461  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1758  peptidase M24  42.76 
 
 		 608 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284065  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2010  peptidase M24  42.22 
 
 		 609 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.623866  normal  0.492859 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0215  peptidase M24  42.33 
 
 		 589 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.260741  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3379  peptidase M24  42.18 
 
 		 609 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379289  decreased coverage  0.00212976 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0936  M24 family peptidase  42.09 
 
 		 607 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.217659  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2193  peptidase M24  42.15 
 
 		 605 aa  452  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6160  putative aminopeptidase P  41.89 
 
 		 607 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0482402 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0213  peptidase M24  43.33 
 
 		 596 aa  449  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22897  normal  0.0833498 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1374  aminopeptidase P  42.69 
 
 		 608 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.993767  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1418  aminopeptidase P  42.69 
 
 		 608 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.413075  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4480  peptidase M24  42.06 
 
 		 612 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.831039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2159  peptidase M24  43.45 
 
 		 612 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2855  aminopeptidase P  40.72 
 
 		 615 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151191  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4945  peptidase M24  41.9 
 
 		 612 aa  444  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.988879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3250  peptidase M24  43.22 
 
 		 617 aa  438  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.54286  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1975  aminopeptidase P  42.74 
 
 		 598 aa  438  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2832  Xaa-Pro aminopeptidase  40.94 
 
 		 628 aa  438  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.109252 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2055  peptidase M24  42.09 
 
 		 611 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268676  normal  0.0972871 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2571  peptidase M24  40.53 
 
 		 611 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2721  putative metallopeptidase  42.11 
 
 		 618 aa  431  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0993196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0683  peptidase M24  43.6 
 
 		 598 aa  432  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2337  peptidase M24  42.27 
 
 		 612 aa  428  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2301  peptidase M24  41.85 
 
 		 633 aa  424  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.0238378 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3072  peptidase M24  44.31 
 
 		 598 aa  422  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.782089 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2573  peptidase M24  41.69 
 
 		 590 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0932593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4443  peptidase M24  42.41 
 
 		 611 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0641  peptidase M24  42.91 
 
 		 594 aa  412  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.117815 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11005  aminopeptidase P, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08050)  39.05 
 
 		 654 aa  402  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0161  M24 family peptidase  39.38 
 
 		 597 aa  397  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2033  Xaa-Pro aminopeptidase  39.57 
 
 		 607 aa  395  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0854  M24 family metallopeptidase  37.27 
 
 		 591 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.701483  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4014  Xaa-Pro aminopeptidase  38.14 
 
 		 591 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0866  M24 family metallopeptidase  37.37 
 
 		 591 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23062  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1210  M24 family peptidase  37.89 
 
 		 595 aa  379  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.472186 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4587  peptidase M24  37.56 
 
 		 590 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000648735  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0547  peptidase M24  36.74 
 
 		 574 aa  373  1e-102  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.621521  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3219  peptidase M24  38.36 
 
 		 602 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.538784  normal  0.627944 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41838  predicted protein  36.33 
 
 		 626 aa  362  8e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0141589 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1482  peptidase, M24 family protein  34.99 
 
 		 585 aa  360  5e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00151346  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0479  M24 family metallopeptidase  37.17 
 
 		 574 aa  359  9e-98  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3437  peptidase, M24 family protein  37.62 
 
 		 602 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193845  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1218  Xaa-Pro aminopeptidase  37.63 
 
 		 589 aa  357  5e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3911  peptidase M24  38.06 
 
 		 602 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52141  predicted protein  36.57 
 
 		 608 aa  354  2e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.70287  decreased coverage  0.00225388 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75738  X-Pro aminopeptidase  35.22 
 
 		 710 aa  353  4e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.511861 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0471  M24 family metallopeptidase  39.24 
 
 		 545 aa  347  4e-94  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2217  putative peptidase, M24 family protein  36.89 
 
 		 605 aa  347  4e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.50313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2924  peptidase M24  36.48 
 
 		 605 aa  346  7e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.579237  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1008  aminopeptidase P  37.12 
 
 		 555 aa  345  1e-93  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2334  peptidase M24  36.42 
 
 		 607 aa  345  2e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.565369  normal  0.315472 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0440  putative Xaa-Pro aminopeptidase  34.8 
 
 		 604 aa  342  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2273  peptidase M24  35.17 
 
 		 605 aa  341  2e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600713 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3518  peptidase M24  35.13 
 
 		 604 aa  340  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.517955  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02680  cytoplasm protein, putative  35.02 
 
 		 647 aa  334  2e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.980721  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2590  peptidase M24  35.23 
 
 		 604 aa  334  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0514  peptidase M24  35.23 
 
 		 604 aa  334  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232311  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0486  peptidase M24  35.23 
 
 		 604 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1045  peptidase M24  32.89 
 
 		 589 aa  332  1e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.472357  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003662  Xaa-Pro aminopeptidase  33.77 
 
 		 598 aa  332  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2238  peptidase M24  35.26 
 
 		 633 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3435  peptidase M24  36.12 
 
 		 602 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00259513  normal  0.40455 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1974  metallopeptidase protein  34.36 
 
 		 605 aa  329  7e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0562373  normal  0.0522977 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2884  peptidase M24  35.07 
 
 		 604 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.185025 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2717  peptidase M24  35.21 
 
 		 604 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>