More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1592 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2063  peptidase M24  55.46 
 
 
612 aa  676    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.507411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1592  peptidase M24  100 
 
 
603 aa  1213    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400079  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2434  peptidase M24  54.33 
 
 
604 aa  594  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411421  normal  0.660909 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2865  peptidase M24  52.09 
 
 
677 aa  566  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1994  peptidase M24  50.98 
 
 
608 aa  559  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0438  peptidase M24  51.78 
 
 
601 aa  545  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0949825  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2994  peptidase M24  50.93 
 
 
608 aa  541  1e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.020362 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00360  Xaa-Pro aminopeptidase  49.41 
 
 
596 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4033  peptidase M24  49.32 
 
 
609 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0371285  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1086  peptidase M24  51.62 
 
 
601 aa  529  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.466224  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2159  peptidase M24  47.95 
 
 
612 aa  526  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.489456  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3291  peptidase M24  48.02 
 
 
608 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1427  peptidase M24  49.83 
 
 
604 aa  526  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.85794 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1758  peptidase M24  47.78 
 
 
608 aa  521  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284065  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4994  peptidase M24  49.75 
 
 
610 aa  519  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.651828  normal  0.317885 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0684  aminopeptidase P, putative  48.62 
 
 
599 aa  521  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2010  peptidase M24  47.68 
 
 
609 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.623866  normal  0.492859 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2447  aminopeptidase P  47.13 
 
 
597 aa  514  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1374  aminopeptidase P  47.53 
 
 
608 aa  512  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.993767  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1418  aminopeptidase P  47.7 
 
 
608 aa  513  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.413075  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2368  peptidase M24  47.95 
 
 
644 aa  512  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.436268  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3379  peptidase M24  47.52 
 
 
609 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379289  decreased coverage  0.00212976 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4480  peptidase M24  49.75 
 
 
612 aa  513  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.831039  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4443  peptidase M24  51.72 
 
 
611 aa  511  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0920  peptidase M24  45.81 
 
 
595 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00313884  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3250  peptidase M24  49.5 
 
 
617 aa  511  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.54286  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002078  Xaa-Pro aminopeptidase  48.67 
 
 
564 aa  509  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1198  peptidase M24  46.32 
 
 
595 aa  511  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2990  putative metallopeptidase  44.86 
 
 
597 aa  510  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2986  peptidase M24  45.62 
 
 
604 aa  509  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4945  peptidase M24  49.59 
 
 
612 aa  509  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.988879 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1388  aminopeptidase P, putative  46.38 
 
 
601 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3238  peptidase M24  45.96 
 
 
595 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.470182  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1282  peptidase M24  45.78 
 
 
595 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2890  peptidase M24  45.86 
 
 
605 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3085  peptidase M24  45.47 
 
 
595 aa  505  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.055146  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6160  putative aminopeptidase P  47.78 
 
 
607 aa  504  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0482402 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3095  peptidase M24  45.27 
 
 
595 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2807  peptidase M24  45.86 
 
 
605 aa  504  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.155072  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1096  peptidase M24  46.03 
 
 
595 aa  499  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.37425  normal  0.472019 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0952  peptidase M24  47.75 
 
 
595 aa  500  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2747  peptidase M24  46.59 
 
 
630 aa  499  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2337  peptidase M24  48.93 
 
 
612 aa  499  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0215  peptidase M24  47.86 
 
 
589 aa  495  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.260741  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2301  peptidase M24  46.43 
 
 
633 aa  489  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.0238378 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0213  peptidase M24  47.81 
 
 
596 aa  491  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22897  normal  0.0833498 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1024  peptidase M24  46.37 
 
 
595 aa  488  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0487462 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2743  peptidase M24  47.7 
 
 
600 aa  487  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32611  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0887  peptidase M24  44.63 
 
 
604 aa  488  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2721  putative metallopeptidase  46.79 
 
 
618 aa  488  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0993196  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3047  peptidase M24  44.1 
 
 
595 aa  484  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2193  peptidase M24  46.38 
 
 
605 aa  484  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0936  M24 family peptidase  43.86 
 
 
607 aa  479  1e-134  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.217659  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1975  aminopeptidase P  46.1 
 
 
598 aa  475  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2055  peptidase M24  45.47 
 
 
611 aa  473  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268676  normal  0.0972871 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2832  Xaa-Pro aminopeptidase  44.97 
 
 
628 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.109252 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0683  peptidase M24  46.85 
 
 
598 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2571  peptidase M24  44.48 
 
 
611 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2855  aminopeptidase P  43.74 
 
 
615 aa  468  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151191  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3072  peptidase M24  46.44 
 
 
598 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.782089 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2545  peptidase M24  43.22 
 
 
599 aa  455  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0641  peptidase M24  43.88 
 
 
594 aa  427  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0161  M24 family peptidase  41.96 
 
 
597 aa  418  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2033  Xaa-Pro aminopeptidase  41.79 
 
 
607 aa  416  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0547  peptidase M24  37.31 
 
 
574 aa  389  1e-106  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.621521  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0479  M24 family metallopeptidase  38.67 
 
 
574 aa  388  1e-106  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0854  M24 family metallopeptidase  36.6 
 
 
591 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.701483  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0866  M24 family metallopeptidase  36.76 
 
 
591 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23062  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2573  peptidase M24  39.63 
 
 
590 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0932593 
 
 
-
 
NC_002950  PG1210  M24 family peptidase  39.12 
 
 
595 aa  372  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.472186 
 
 
-
 
NC_002978  WD1008  aminopeptidase P  38.63 
 
 
555 aa  375  1e-102  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41838  predicted protein  38.11 
 
 
626 aa  369  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0141589 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11005  aminopeptidase P, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08050)  37.95 
 
 
654 aa  366  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0471  M24 family metallopeptidase  39 
 
 
545 aa  367  1e-100  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52141  predicted protein  38.03 
 
 
608 aa  365  2e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.70287  decreased coverage  0.00225388 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4587  peptidase M24  36.67 
 
 
590 aa  361  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000648735  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4014  Xaa-Pro aminopeptidase  37.2 
 
 
591 aa  353  4e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1482  peptidase, M24 family protein  35.78 
 
 
585 aa  352  1e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00151346  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2217  putative peptidase, M24 family protein  39.74 
 
 
605 aa  348  2e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.50313  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3219  peptidase M24  37.97 
 
 
602 aa  343  7e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.538784  normal  0.627944 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02680  cytoplasm protein, putative  36.34 
 
 
647 aa  341  2e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.980721  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3911  peptidase M24  37.81 
 
 
602 aa  341  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102431  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2924  peptidase M24  39.8 
 
 
605 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.579237  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3502  peptidase M24  38.54 
 
 
602 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0384792  normal  0.580745 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75738  X-Pro aminopeptidase  34.24 
 
 
710 aa  332  1e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.511861 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0486  peptidase M24  38.1 
 
 
604 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1218  Xaa-Pro aminopeptidase  35.68 
 
 
589 aa  332  2e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2590  peptidase M24  37.94 
 
 
604 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2965  peptidase M24  37.58 
 
 
606 aa  330  4e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0514  peptidase M24  37.94 
 
 
604 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232311  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3518  peptidase M24  37.6 
 
 
604 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.517955  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3437  peptidase, M24 family protein  36.82 
 
 
602 aa  329  7e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193845  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2884  peptidase M24  38.94 
 
 
604 aa  329  8e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.185025 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0440  putative Xaa-Pro aminopeptidase  37.07 
 
 
604 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003662  Xaa-Pro aminopeptidase  34.72 
 
 
598 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2238  peptidase M24  37.52 
 
 
633 aa  327  5e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0418  peptidase M24  37.87 
 
 
604 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0444  peptidase M24  37.77 
 
 
604 aa  320  6e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.739665  normal  0.291512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1861  peptidase M24  37.85 
 
 
602 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137789  normal  0.370091 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3601  peptidase M24  36.62 
 
 
604 aa  317  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.735851  normal  0.937642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>