More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2600 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2600  CoA-binding domain protein  100 
 
 
130 aa  270  5.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00073882  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0652  CoA-binding domain protein  46.46 
 
 
131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000133994  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1445  CoA-binding domain-containing protein  42.86 
 
 
136 aa  129  9e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1777  CoA-binding domain protein  43.9 
 
 
124 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2077  CoA-binding protein  38.66 
 
 
126 aa  110  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4017  CoA-binding domain-containing protein  42.4 
 
 
132 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00796943  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1655  CoA-binding protein  40.68 
 
 
134 aa  100  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000297514  normal  0.67582 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1614  CoA-binding protein  39.67 
 
 
134 aa  97.4  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0624  CoA-binding domain protein  37.6 
 
 
132 aa  97.8  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1015  CoA-binding domain protein  40.17 
 
 
131 aa  97.1  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1284  CoA-binding domain-containing protein  34.75 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0669  hypothetical protein  37.19 
 
 
133 aa  90.9  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0653  hypothetical protein  36.8 
 
 
133 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0658  CoA-binding domain-containing protein  34.21 
 
 
125 aa  86.3  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00210865  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1479  CoA-binding domain protein  33.33 
 
 
134 aa  85.1  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0217  CoA-binding protein  35.2 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0985  CoA-binding domain protein  33.06 
 
 
152 aa  84  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3341  CoA-binding domain-containing protein  36.51 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0651  CoA-binding domain-containing protein  39.56 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1359  CoA-binding domain-containing protein  32.77 
 
 
131 aa  80.5  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00343617  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1327  CoA-binding domain-containing protein  32.48 
 
 
131 aa  80.5  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000352253  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0560  CoA-binding domain protein  38.32 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.89222  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1828  hypothetical protein  35.48 
 
 
122 aa  77.4  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  34.78 
 
 
133 aa  77  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.137279 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2085  CoA-binding domain protein  35.34 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1548  hypothetical protein  34.68 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16153  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0742  CoA-binding domain-containing protein  30.97 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000457668  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  30.89 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  33.03 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3494  CoA-binding domain-containing protein  31.67 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.965482  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1630  CoA-binding domain protein  33.61 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1891  CoA-binding domain protein  32.76 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.272605 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  31.75 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  32.74 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  30.08 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3507  CoA-binding domain-containing protein  31.2 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684153  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0989  CoA-binding domain protein  35.83 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0728  CoA-binding domain-containing protein  32 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.298785 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1388  CoA-binding domain-containing protein  30.58 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.555595  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  30.4 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1144  CoA-binding  31.78 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1562  CoA-binding domain-containing protein  32.76 
 
 
139 aa  70.1  0.000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.477139  normal  0.0705808 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  29.92 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0150  CoA-binding domain-containing protein  32.14 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.100452 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0758  CoA-binding domain-containing protein  28.32 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19320  predicted CoA-binding protein  30.36 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0866422  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  32.14 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1056  CoA-binding domain protein  32 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0863  hypothetical protein  38.1 
 
 
707 aa  68.6  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0968097 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3063  CoA-binding  29.41 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1379  CoA-binding domain protein  30.36 
 
 
161 aa  68.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0160  CoA-binding protein  31.25 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0169  CoA-binding domain-containing protein  31.25 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  34.62 
 
 
715 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0995  CoA-binding protein  36.27 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  32.8 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1854  CoA-binding domain-containing protein  28.07 
 
 
138 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0446458  normal  0.0146672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  32.22 
 
 
697 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1885  CoA-binding domain-containing protein  35.34 
 
 
708 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  31.54 
 
 
697 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  28.69 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0429  CoA-binding domain protein  28.81 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2525  hypothetical protein  28.45 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.550629  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3436  CoA-binding domain protein  30.36 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3421  CoA-binding domain protein  36.11 
 
 
690 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.678339  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0725  CoA-binding domain-containing protein  37.78 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000455945 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  35.34 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0607  CoA-binding protein  36.17 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1052  CoA-binding domain protein  31.52 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256788  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4587  CoA-binding domain protein  29.46 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  33.33 
 
 
750 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  32.38 
 
 
698 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3313  hypothetical protein  30.08 
 
 
153 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2340  CoA-binding domain protein  30.63 
 
 
179 aa  63.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1762  CoA-binding domain protein  29.01 
 
 
140 aa  62.8  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.823906  normal  0.0190292 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1421  CoA-binding domain-containing protein  27.03 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000954781  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5544  CoA-binding domain protein  26.27 
 
 
154 aa  62  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2004  CoA-binding domain protein  28.69 
 
 
135 aa  61.2  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3363  CoA-binding domain protein  28.57 
 
 
199 aa  61.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0719099  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  28.83 
 
 
176 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  31.36 
 
 
711 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02340  predicted CoA-binding protein  29.31 
 
 
171 aa  60.8  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  28.8 
 
 
140 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0530  CoA-binding domain-containing protein  28.57 
 
 
164 aa  60.5  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2880  hypothetical protein  32.48 
 
 
121 aa  60.5  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.476591  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1969  CoA-binding domain protein  34.12 
 
 
680 aa  60.5  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  32.76 
 
 
702 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2396  CoA-binding  26.32 
 
 
138 aa  60.1  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.972486  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.5 
 
 
711 aa  60.1  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  29.46 
 
 
697 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1097  CoA-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
702 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  28.81 
 
 
669 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  27.52 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.18 
 
 
892 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1976  CoA-binding domain-containing protein  30.77 
 
 
169 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485695  normal  0.647487 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  29.91 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0554  CoA-binding domain-containing protein  28.87 
 
 
689 aa  58.2  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.794682  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3508  CoA-binding domain protein  27.82 
 
 
154 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0120178 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  25 
 
 
692 aa  57.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0982  CoA-binding domain-containing protein  28.1 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.419448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>