200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0217 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0217  CoA-binding protein  100 
 
 
134 aa  275  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0624  CoA-binding domain protein  62.6 
 
 
132 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4017  CoA-binding domain-containing protein  61.83 
 
 
132 aa  179  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00796943  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3507  CoA-binding domain-containing protein  62.41 
 
 
134 aa  179  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684153  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1614  CoA-binding protein  59.4 
 
 
134 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1655  CoA-binding protein  57.14 
 
 
134 aa  167  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000297514  normal  0.67582 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0653  hypothetical protein  56.82 
 
 
133 aa  164  4e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0669  hypothetical protein  55.3 
 
 
133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2600  CoA-binding domain protein  35.2 
 
 
130 aa  84.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00073882  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0652  CoA-binding domain protein  35.59 
 
 
131 aa  81.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000133994  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2077  CoA-binding protein  31.97 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0758  CoA-binding domain-containing protein  32.43 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0658  CoA-binding domain-containing protein  31.53 
 
 
125 aa  78.2  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00210865  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0560  CoA-binding domain protein  29.82 
 
 
129 aa  77  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.89222  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1777  CoA-binding domain protein  32.79 
 
 
124 aa  77  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06185  conserved hypothetical protein  38.24 
 
 
493 aa  75.1  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0429141 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1327  CoA-binding domain-containing protein  37.5 
 
 
131 aa  75.1  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000352253  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0651  CoA-binding domain-containing protein  38.2 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1359  CoA-binding domain-containing protein  36.36 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00343617  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3494  CoA-binding domain-containing protein  31.54 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.965482  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1015  CoA-binding domain protein  31.54 
 
 
131 aa  73.6  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1445  CoA-binding domain-containing protein  28.69 
 
 
136 aa  72  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55314  predicted protein  28.48 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0429  CoA-binding domain protein  33.61 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0995  CoA-binding protein  30.77 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1056  CoA-binding domain protein  30 
 
 
159 aa  67  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0985  CoA-binding domain protein  31.67 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4587  CoA-binding domain protein  32.26 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2085  CoA-binding domain protein  30.89 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  31.45 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0886  CoA-binding domain protein  30.83 
 
 
637 aa  63.9  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.330543  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  29.37 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1284  CoA-binding domain-containing protein  25.62 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  28.57 
 
 
134 aa  61.6  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1164  CoA-binding domain protein  33.61 
 
 
140 aa  61.6  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1052  CoA-binding domain protein  30.77 
 
 
159 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256788  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0728  CoA-binding domain-containing protein  33.06 
 
 
135 aa  60.5  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.298785 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0725  CoA-binding domain-containing protein  27.12 
 
 
139 aa  60.1  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000455945 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  31.4 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  27.64 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1479  CoA-binding domain protein  30.16 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5544  CoA-binding domain protein  28.3 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  31.82 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  28.95 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0554  CoA-binding domain-containing protein  31.58 
 
 
689 aa  57.8  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.794682  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  30.95 
 
 
140 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  26.83 
 
 
137 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3341  CoA-binding domain-containing protein  31.45 
 
 
155 aa  57.4  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  26.83 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  26.83 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  26.83 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  26.83 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  26.83 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  26.83 
 
 
137 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  26.83 
 
 
137 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  26.67 
 
 
135 aa  57  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.122107 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.77 
 
 
660 aa  55.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2004  CoA-binding domain protein  29.37 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0989  CoA-binding domain protein  25.56 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1388  CoA-binding domain-containing protein  28.3 
 
 
136 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.555595  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  28.7 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3193  CoA-binding domain protein  30.16 
 
 
181 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0698  hypothetical protein  27.35 
 
 
128 aa  55.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000671001  normal  0.0854698 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  26.02 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0982  CoA-binding domain-containing protein  31.2 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.419448 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  28.33 
 
 
139 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1762  CoA-binding domain protein  30.6 
 
 
140 aa  53.9  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.823906  normal  0.0190292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1854  CoA-binding domain-containing protein  24.41 
 
 
138 aa  53.5  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0446458  normal  0.0146672 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2340  CoA-binding domain protein  28.18 
 
 
179 aa  52.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1166  CoA-binding  28.95 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365479  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0530  CoA-binding domain-containing protein  27.73 
 
 
164 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3341  CoA-binding domain-containing protein  26.83 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125699  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2948  CoA-binding domain-containing protein  32.58 
 
 
899 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.574552  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  30.43 
 
 
697 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1891  CoA-binding domain protein  33.61 
 
 
139 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.272605 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0966  CoA-binding domain protein  25.23 
 
 
129 aa  52  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  25.74 
 
 
712 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3787  GCN5-related N-acetyltransferase  33 
 
 
893 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.152255  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2493  CoA-binding domain-containing protein  29.51 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.244493  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1471  CoA-binding  27.27 
 
 
687 aa  51.2  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0742  CoA-binding domain-containing protein  24.14 
 
 
159 aa  50.8  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000457668  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1562  CoA-binding domain-containing protein  25.44 
 
 
139 aa  50.8  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.477139  normal  0.0705808 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  21.24 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1421  CoA-binding domain-containing protein  21.82 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000954781  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0607  CoA-binding protein  28.57 
 
 
136 aa  50.4  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1328  CoA ligase family protein  35.71 
 
 
685 aa  50.4  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2690  CoA-binding domain protein  27.64 
 
 
198 aa  50.4  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0019  hypothetical protein  25.64 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.816073  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2075  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  31.46 
 
 
612 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.313252  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  29.37 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1399  CoA-binding domain-containing protein  36.71 
 
 
660 aa  49.7  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.578078  hitchhiker  0.000299945 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2622  CoA-binding domain-containing protein  26.02 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  26.61 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.43 
 
 
696 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3207  CoA-binding domain-containing protein  26.02 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0196992  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0687  CoA-binding domain-containing protein  28.21 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.44778  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  26.32 
 
 
697 aa  48.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2533  CoA-binding domain-containing protein  26.02 
 
 
138 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0861335  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  20.83 
 
 
537 aa  48.5  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  32 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>