261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3783 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 
142 aa  285  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1976  CoA-binding domain-containing protein  89.29 
 
 
169 aa  238  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485695  normal  0.647487 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  53.33 
 
 
139 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4825  CoA-binding domain-containing protein  63.28 
 
 
130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  49.63 
 
 
140 aa  147  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  55.88 
 
 
140 aa  146  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  49.63 
 
 
133 aa  143  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  52.24 
 
 
149 aa  142  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  49.62 
 
 
137 aa  142  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  50.38 
 
 
137 aa  140  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  50.38 
 
 
137 aa  140  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  49.25 
 
 
137 aa  140  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  50.38 
 
 
137 aa  140  8e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  50.38 
 
 
137 aa  139  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  48.51 
 
 
137 aa  139  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1762  CoA-binding domain-containing protein  48.87 
 
 
137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0753564  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  49.62 
 
 
137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  49.62 
 
 
137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  49.62 
 
 
137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  49.62 
 
 
137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  49.62 
 
 
137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  52.24 
 
 
151 aa  137  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  48.87 
 
 
137 aa  136  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  53.12 
 
 
134 aa  136  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  54.96 
 
 
139 aa  135  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  45.11 
 
 
176 aa  135  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  51.52 
 
 
134 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2690  CoA-binding domain protein  47.37 
 
 
198 aa  134  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1049  CoA-binding domain protein  46.38 
 
 
138 aa  130  3.9999999999999996e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1672  CoA-binding protein  54.14 
 
 
143 aa  130  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996781  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5544  CoA-binding domain protein  49.23 
 
 
154 aa  130  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2622  CoA-binding domain-containing protein  46.62 
 
 
138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3207  CoA-binding domain-containing protein  46.62 
 
 
138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0196992  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2533  CoA-binding domain-containing protein  46.62 
 
 
138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0861335  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0162  hypothetical protein  50.79 
 
 
145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1479  CoA-binding domain protein  46.67 
 
 
134 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  45.71 
 
 
139 aa  127  7.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2340  CoA-binding domain protein  47.29 
 
 
179 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1388  CoA-binding domain-containing protein  44.27 
 
 
136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.555595  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  48.82 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0747  CoA-binding  48.53 
 
 
140 aa  124  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0309601  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2248  CoA-binding domain-containing protein  45.04 
 
 
137 aa  124  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000439003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1608  CoA binding domain family protein  45.04 
 
 
137 aa  124  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000441527  hitchhiker  0.00000000000716402 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1048  CoA-binding domain-containing protein  46.27 
 
 
139 aa  124  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.417839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3394  CoA-binding domain-containing protein  44.27 
 
 
137 aa  123  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0763288  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3306  CoA-binding domain-containing protein  44.27 
 
 
137 aa  123  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.007751  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3659  CoA-binding domain-containing protein  44.27 
 
 
137 aa  123  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000120048  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3618  CoA-binding domain-containing protein  44.27 
 
 
137 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000227272  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_50959  predicted protein  50.36 
 
 
146 aa  123  8.000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3625  CoA binding domain family protein  44.27 
 
 
137 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000648968  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  40 
 
 
144 aa  123  9e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3356  CoA-binding domain-containing protein  43.51 
 
 
137 aa  122  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000642937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3610  CoA binding domain family protein  43.51 
 
 
137 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5882599999999998e-27 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3707  CoA binding domain family protein  43.51 
 
 
137 aa  122  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000701886  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3341  CoA-binding domain-containing protein  45.65 
 
 
140 aa  122  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125699  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3286  CoA-binding domain-containing protein  43.51 
 
 
137 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120452  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0985  CoA-binding domain protein  46.97 
 
 
152 aa  122  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2358  CoA-binding domain-containing protein  52.94 
 
 
138 aa  121  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3183  CoA-binding domain protein  49.64 
 
 
153 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0375  CoA-binding domain-containing protein  51.8 
 
 
154 aa  121  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  0.413983 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1144  CoA-binding  42.65 
 
 
142 aa  121  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3508  CoA-binding domain protein  49.62 
 
 
154 aa  120  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0120178 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  44.44 
 
 
135 aa  120  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2493  CoA-binding domain-containing protein  44.53 
 
 
152 aa  120  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.244493  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0530  CoA-binding domain-containing protein  46.51 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3313  hypothetical protein  47.86 
 
 
153 aa  118  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2396  CoA-binding  41.48 
 
 
138 aa  118  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.972486  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3857  CoA-binding domain-containing protein  47.18 
 
 
171 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.942746  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3130  CoA-binding domain-containing protein  46.48 
 
 
171 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1854  CoA-binding domain-containing protein  44.85 
 
 
138 aa  117  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0446458  normal  0.0146672 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0390  CoA-binding domain-containing protein  43.7 
 
 
146 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2421  CoA-binding  50.39 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000330878  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1166  CoA-binding  45.93 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365479  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02340  predicted CoA-binding protein  46.88 
 
 
171 aa  116  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3344  CoA-binding  48.53 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1875  CoA-binding domain protein  44.12 
 
 
147 aa  114  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0584  CoA-binding domain-containing protein  40.85 
 
 
175 aa  114  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4258  CoA-binding  47.01 
 
 
143 aa  114  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1630  CoA-binding domain protein  43.7 
 
 
137 aa  114  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2254  CoA-binding domain-containing protein  50.36 
 
 
138 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0324206  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2525  hypothetical protein  45.11 
 
 
139 aa  113  8.999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.550629  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1762  CoA-binding domain protein  47.89 
 
 
140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.823906  normal  0.0190292 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2052  CoA-binding  45.32 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1616  CoA-binding domain protein  42.64 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000180037  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2693  CoA-binding  48.53 
 
 
180 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149948  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  34.78 
 
 
140 aa  110  6e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2075  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  45.99 
 
 
612 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.313252  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4331  CoA-binding domain-containing protein  51.11 
 
 
182 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.282355 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4587  CoA-binding domain protein  40.44 
 
 
142 aa  108  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2004  CoA-binding domain protein  43.07 
 
 
135 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2827  hypothetical protein  39.85 
 
 
133 aa  107  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0856697 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0429  CoA-binding domain protein  41.18 
 
 
140 aa  107  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2704  CoA-binding  48.15 
 
 
194 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0687  CoA-binding domain-containing protein  39.86 
 
 
138 aa  107  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.44778  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3063  CoA-binding  47.37 
 
 
162 aa  106  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1379  CoA-binding domain protein  44.19 
 
 
161 aa  107  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2668  CoA-binding  47.41 
 
 
194 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0742  CoA-binding domain-containing protein  34.07 
 
 
159 aa  106  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000457668  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1948  CoA-binding domain-containing protein  37.59 
 
 
151 aa  105  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0728  CoA-binding domain-containing protein  44 
 
 
135 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.298785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>