291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2340 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2340  CoA-binding domain protein  100 
 
 
179 aa  369  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  58.55 
 
 
176 aa  188  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1379  CoA-binding domain protein  46.1 
 
 
161 aa  137  7.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0530  CoA-binding domain-containing protein  46.15 
 
 
164 aa  137  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4587  CoA-binding domain protein  53.17 
 
 
142 aa  131  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3436  CoA-binding domain protein  47.55 
 
 
180 aa  131  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02340  predicted CoA-binding protein  46.58 
 
 
171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  52.03 
 
 
134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  46.62 
 
 
140 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  51.2 
 
 
134 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0429  CoA-binding domain protein  53.17 
 
 
140 aa  128  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19320  predicted CoA-binding protein  44.06 
 
 
165 aa  127  8.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0866422  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  52 
 
 
139 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  47.2 
 
 
151 aa  125  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3130  CoA-binding domain-containing protein  41.88 
 
 
171 aa  124  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3857  CoA-binding domain-containing protein  41.88 
 
 
171 aa  124  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.942746  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  49.6 
 
 
133 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2075  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  42.86 
 
 
612 aa  123  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.313252  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0728  CoA-binding domain-containing protein  50.41 
 
 
135 aa  122  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.298785 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4825  CoA-binding domain-containing protein  51.61 
 
 
130 aa  122  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  45.6 
 
 
149 aa  122  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2004  CoA-binding domain protein  51.59 
 
 
135 aa  120  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  46.97 
 
 
140 aa  119  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  47.29 
 
 
142 aa  117  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0985  CoA-binding domain protein  45.86 
 
 
152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1762  CoA-binding domain protein  48.06 
 
 
140 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.823906  normal  0.0190292 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  48.03 
 
 
137 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  46.21 
 
 
144 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3286  CoA-binding domain-containing protein  44.62 
 
 
137 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120452  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2421  CoA-binding  50.78 
 
 
130 aa  115  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000330878  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3341  CoA-binding domain-containing protein  46.4 
 
 
140 aa  114  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125699  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3618  CoA-binding domain-containing protein  44.27 
 
 
137 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000227272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3625  CoA binding domain family protein  44.27 
 
 
137 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000648968  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4331  CoA-binding domain-containing protein  40.49 
 
 
182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.282355 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3356  CoA-binding domain-containing protein  43.51 
 
 
137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000642937  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1672  CoA-binding protein  51.56 
 
 
143 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3707  CoA binding domain family protein  43.51 
 
 
137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000701886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3610  CoA binding domain family protein  43.51 
 
 
137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5882599999999998e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3394  CoA-binding domain-containing protein  43.51 
 
 
137 aa  112  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0763288  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3306  CoA-binding domain-containing protein  43.51 
 
 
137 aa  112  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.007751  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1608  CoA binding domain family protein  43.51 
 
 
137 aa  112  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000441527  hitchhiker  0.00000000000716402 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3659  CoA-binding domain-containing protein  43.51 
 
 
137 aa  112  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000120048  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2248  CoA-binding domain-containing protein  43.51 
 
 
137 aa  111  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000439003  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  43.51 
 
 
137 aa  111  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1616  CoA-binding domain protein  45.97 
 
 
139 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000180037  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  40.94 
 
 
135 aa  110  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.122107 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2085  CoA-binding domain protein  41.22 
 
 
154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2690  CoA-binding domain protein  44.09 
 
 
198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  44.27 
 
 
137 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3363  CoA-binding domain protein  38.41 
 
 
199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0719099  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1144  CoA-binding  42.97 
 
 
142 aa  108  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1388  CoA-binding domain-containing protein  42.64 
 
 
136 aa  108  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.555595  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  40.48 
 
 
140 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0725  CoA-binding domain-containing protein  41.79 
 
 
139 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000455945 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1048  CoA-binding domain-containing protein  42.31 
 
 
139 aa  108  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.417839  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1976  CoA-binding domain-containing protein  46.51 
 
 
169 aa  107  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485695  normal  0.647487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5544  CoA-binding domain protein  44.72 
 
 
154 aa  107  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1479  CoA-binding domain protein  43.18 
 
 
134 aa  107  7.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0162  hypothetical protein  40.71 
 
 
145 aa  107  9.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0390  CoA-binding domain-containing protein  39.85 
 
 
146 aa  107  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  45.38 
 
 
139 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0375  CoA-binding domain-containing protein  51.64 
 
 
154 aa  107  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  0.413983 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1762  CoA-binding domain-containing protein  43.31 
 
 
137 aa  106  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0753564  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2574  hypothetical protein  38.1 
 
 
161 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624453  hitchhiker  0.000000425683 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  42.34 
 
 
144 aa  105  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2525  hypothetical protein  41.79 
 
 
139 aa  105  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.550629  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  41.54 
 
 
139 aa  105  5e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2559  CoA-binding domain protein  44.35 
 
 
139 aa  104  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4258  CoA-binding  45.6 
 
 
143 aa  105  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  44.44 
 
 
137 aa  104  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  42.74 
 
 
137 aa  104  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  42.74 
 
 
137 aa  104  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  42.74 
 
 
137 aa  103  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  42.74 
 
 
137 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2622  CoA-binding domain-containing protein  43.31 
 
 
138 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3207  CoA-binding domain-containing protein  43.31 
 
 
138 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0196992  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  42.74 
 
 
137 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  42.74 
 
 
137 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2533  CoA-binding domain-containing protein  43.31 
 
 
138 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0861335  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  42.74 
 
 
137 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  42.74 
 
 
137 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  42.74 
 
 
137 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0079  CoA-binding domain protein  50.85 
 
 
145 aa  102  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0584  CoA-binding domain-containing protein  42.65 
 
 
175 aa  102  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0747  CoA-binding  47.69 
 
 
140 aa  102  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0309601  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0150  CoA-binding domain-containing protein  42.06 
 
 
139 aa  101  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.100452 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2396  CoA-binding  39.1 
 
 
138 aa  101  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.972486  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  36.24 
 
 
537 aa  101  6e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0966  CoA-binding domain protein  40.83 
 
 
129 aa  100  8e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1164  CoA-binding domain protein  43.08 
 
 
140 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2052  CoA-binding  39.6 
 
 
154 aa  100  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0160  CoA-binding protein  41.27 
 
 
139 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0169  CoA-binding domain-containing protein  41.27 
 
 
139 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1630  CoA-binding domain protein  38.93 
 
 
137 aa  99  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1421  CoA-binding domain-containing protein  40 
 
 
134 aa  99  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000954781  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4799  CoA-binding domain protein  47.66 
 
 
137 aa  97.8  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1049  CoA-binding domain protein  37.8 
 
 
138 aa  97.4  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2240  hypothetical protein  44.88 
 
 
148 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394786  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1304  coenzyme A binding protein  40.16 
 
 
136 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3103  hypothetical protein  38.26 
 
 
194 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.210422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>