210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1854 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1854  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 138 aa  275  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0446458  normal  0.0146672 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3063  CoA-binding  73.19 
 
 		 162 aa  184  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5544  CoA-binding domain protein  59.84 
 
 		 154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1388  CoA-binding domain-containing protein  59.5 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.555595  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1164  CoA-binding domain protein  61.36 
 
 		 140 aa  140  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2545  hypothetical protein  52.99 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1891  CoA-binding domain protein  57.5 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.272605 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0534  CoA-binding domain-containing protein  49.63 
 
 		 141 aa  116  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563863  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  48.03 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  40.91 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  47.24 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0985  CoA-binding domain protein  52.34 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4117  CoA-binding domain protein  51.64 
 
 		 139 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  43.09 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0671  CoA-binding domain protein  51.56 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  47.2 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  46.4 
 
 		 137 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2396  CoA-binding  37.88 
 
 		 138 aa  106  9.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.972486  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2690  CoA-binding domain protein  40.74 
 
 		 198 aa  106  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  44 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  45.6 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  45.6 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  45.6 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  45.6 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  45.6 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  42.74 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1762  CoA-binding domain-containing protein  43.2 
 
 		 137 aa  104  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0753564  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  43.18 
 
 		 137 aa  104  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  43.59 
 
 		 134 aa  104  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4825  CoA-binding domain-containing protein  45.53 
 
 		 130 aa  104  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  44.85 
 
 		 142 aa  104  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  44.8 
 
 		 137 aa  103  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  44.8 
 
 		 137 aa  103  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  44.8 
 
 		 137 aa  103  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  42.86 
 
 		 139 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  47.2 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2075  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  43.07 
 
 		 612 aa  98.6  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.313252  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  42.62 
 
 		 151 aa  98.6  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  40 
 
 		 144 aa  98.6  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_50959  predicted protein  41.35 
 
 		 146 aa  97.4  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1976  CoA-binding domain-containing protein  44.12 
 
 		 169 aa  96.7  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485695  normal  0.647487 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2574  hypothetical protein  42.86 
 
 		 161 aa  94.7  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624453  hitchhiker  0.000000425683 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2004  CoA-binding domain protein  40 
 
 		 135 aa  93.6  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  34.65 
 
 		 149 aa  93.2  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3207  CoA-binding domain-containing protein  40 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0196992  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2622  CoA-binding domain-containing protein  40 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2533  CoA-binding domain-containing protein  40 
 
 		 138 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0861335  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  42.52 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2340  CoA-binding domain protein  40.6 
 
 		 179 aa  92.8  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4331  CoA-binding domain-containing protein  41.73 
 
 		 182 aa  92  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.282355 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3341  CoA-binding domain-containing protein  40.44 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4258  CoA-binding  41.8 
 
 		 143 aa  90.5  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0429  CoA-binding domain protein  42.64 
 
 		 140 aa  90.5  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0728  CoA-binding domain-containing protein  41.88 
 
 		 135 aa  89.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.298785 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2421  CoA-binding  45.87 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000330878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0375  CoA-binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 154 aa  87.8  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  0.413983 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1421  CoA-binding domain-containing protein  34.15 
 
 		 134 aa  87.8  4e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000954781  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2085  CoA-binding domain protein  34.62 
 
 		 154 aa  87.4  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2052  CoA-binding  41.18 
 
 		 154 aa  87  9e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1687  hypothetical protein  38.46 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.863027  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1166  CoA-binding  37.8 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365479  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4799  CoA-binding domain protein  43.51 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3286  CoA-binding domain-containing protein  36.13 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120452  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0272  CoA-binding domain protein  36.57 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2525  hypothetical protein  36.36 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.550629  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  27.87 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2493  CoA-binding domain-containing protein  37.86 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.244493  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  34.62 
 
 		 135 aa  84  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1328  CoA-binding domain protein  38.52 
 
 		 142 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0242548  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3618  CoA-binding domain-containing protein  36.13 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000227272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3394  CoA-binding domain-containing protein  36.13 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0763288  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3306  CoA-binding domain-containing protein  36.13 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.007751  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3659  CoA-binding domain-containing protein  36.13 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000120048  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0162  hypothetical protein  33.88 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4587  CoA-binding domain protein  39.34 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3625  CoA binding domain family protein  36.13 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000648968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3356  CoA-binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000642937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3610  CoA binding domain family protein  35.29 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5882599999999998e-27 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3508  CoA-binding domain protein  40.71 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0120178 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2240  hypothetical protein  41.13 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394786  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3707  CoA binding domain family protein  35.29 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000701886  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1762  CoA-binding domain protein  37.98 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.823906  normal  0.0190292 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1943  CoA-binding  38.93 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.19202  normal  0.743605 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1608  CoA binding domain family protein  35.29 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000441527  hitchhiker  0.00000000000716402 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2358  CoA-binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2248  CoA-binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000439003  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1948  CoA-binding domain-containing protein  30.65 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1048  CoA-binding domain-containing protein  39.55 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.417839  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1144  CoA-binding  30.33 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0966  CoA-binding domain protein  27.5 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19320  predicted CoA-binding protein  39.68 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0866422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1630  CoA-binding domain protein  34.85 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0530  CoA-binding domain-containing protein  37.01 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0915  CoA-binding domain-containing protein  39.72 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.157936 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0742  CoA-binding domain-containing protein  29.03 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000457668  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3183  CoA-binding domain protein  41.35 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1241  CoA-binding domain protein  38.28 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  35.29 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1379  CoA-binding domain protein  38.1 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0160  CoA-binding protein  36.22 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>