245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1166 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1166  CoA-binding  100 
 
 
145 aa  293  7e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365479  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1328  CoA-binding domain protein  65.71 
 
 
142 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0242548  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1241  CoA-binding domain protein  66.43 
 
 
142 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4331  CoA-binding domain-containing protein  59.31 
 
 
182 aa  176  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.282355 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1687  hypothetical protein  60.71 
 
 
150 aa  173  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.863027  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2493  CoA-binding domain-containing protein  60.9 
 
 
152 aa  164  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.244493  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0866  CoA-binding domain-containing protein  59.29 
 
 
144 aa  157  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226245  normal  0.636529 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3103  hypothetical protein  52.41 
 
 
194 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.210422  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2704  CoA-binding  53.79 
 
 
194 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2668  CoA-binding  53.47 
 
 
194 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0145  CoA-binding domain protein  53.15 
 
 
181 aa  148  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4595  hypothetical protein  52.08 
 
 
194 aa  144  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2693  CoA-binding  51.72 
 
 
180 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149948  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2457  CoA-binding  54.86 
 
 
194 aa  142  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.618512  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4615  CoA-binding domain-containing protein  52.45 
 
 
180 aa  142  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.305914  normal  0.0136961 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1762  CoA-binding domain-containing protein  51.11 
 
 
137 aa  137  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0753564  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  52.99 
 
 
137 aa  137  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  49.63 
 
 
137 aa  136  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2690  CoA-binding domain protein  49.64 
 
 
198 aa  136  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  52.24 
 
 
137 aa  135  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  49.63 
 
 
137 aa  135  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  52.24 
 
 
137 aa  135  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  50.37 
 
 
137 aa  135  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  52.24 
 
 
137 aa  135  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  52.24 
 
 
137 aa  135  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  52.24 
 
 
137 aa  135  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  52.24 
 
 
137 aa  135  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2254  CoA-binding domain-containing protein  52.59 
 
 
138 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0324206  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  52.67 
 
 
137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  51.49 
 
 
137 aa  134  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  51.49 
 
 
137 aa  134  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2240  hypothetical protein  54.07 
 
 
148 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394786  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  56.49 
 
 
139 aa  132  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0915  CoA-binding domain-containing protein  53.33 
 
 
148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.157936 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2622  CoA-binding domain-containing protein  46.38 
 
 
138 aa  128  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3207  CoA-binding domain-containing protein  46.38 
 
 
138 aa  128  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0196992  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2533  CoA-binding domain-containing protein  46.38 
 
 
138 aa  128  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0861335  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1875  CoA-binding domain protein  50.36 
 
 
147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  47.45 
 
 
144 aa  127  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2052  CoA-binding  45.93 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2417  CoA-binding domain protein  50.35 
 
 
193 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452114  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2712  CoA-binding domain protein  49.65 
 
 
193 aa  124  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350227  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2489  CoA-binding domain-containing protein  49.65 
 
 
193 aa  124  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.639017 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2075  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  46.48 
 
 
612 aa  124  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.313252  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1684  hypothetical protein  48.55 
 
 
154 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1948  CoA-binding domain-containing protein  44.44 
 
 
151 aa  122  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2358  CoA-binding domain-containing protein  50.75 
 
 
138 aa  120  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_50959  predicted protein  45.52 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1177  CoA-binding domain-containing protein  47.97 
 
 
205 aa  117  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1943  CoA-binding  45.97 
 
 
142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.19202  normal  0.743605 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  40.44 
 
 
144 aa  110  5e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  46.22 
 
 
134 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  47.06 
 
 
134 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5334  CoA-binding protein  48.31 
 
 
144 aa  107  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  40.6 
 
 
140 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  39.23 
 
 
140 aa  105  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2574  hypothetical protein  43.28 
 
 
161 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624453  hitchhiker  0.000000425683 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1304  coenzyme A binding protein  39.26 
 
 
136 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2798  CoA-binding  41.61 
 
 
156 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.254267  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2251  CoA-binding  44.44 
 
 
140 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  44.62 
 
 
139 aa  105  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1988  CoA-binding domain-containing protein  44.44 
 
 
140 aa  104  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370858  normal  0.185314 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3824  CoA-binding domain-containing protein  45.19 
 
 
150 aa  103  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2004  CoA-binding domain protein  44.63 
 
 
135 aa  103  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0272  CoA-binding domain protein  44.26 
 
 
136 aa  103  9e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  45.93 
 
 
142 aa  102  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2836  CoA-binding domain-containing protein  45.77 
 
 
155 aa  102  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.758344  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1049  CoA-binding domain protein  39.1 
 
 
138 aa  100  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  43.88 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  41.8 
 
 
133 aa  99.4  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0390  CoA-binding domain-containing protein  36.57 
 
 
146 aa  99.4  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2827  hypothetical protein  41.18 
 
 
133 aa  98.6  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0856697 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0687  CoA-binding domain-containing protein  41.35 
 
 
138 aa  99  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.44778  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  41.54 
 
 
139 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2525  hypothetical protein  41.43 
 
 
139 aa  98.6  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.550629  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1976  CoA-binding domain-containing protein  45.19 
 
 
169 aa  97.8  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485695  normal  0.647487 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  39.55 
 
 
135 aa  98.2  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  39.53 
 
 
149 aa  97.8  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4825  CoA-binding domain-containing protein  43.75 
 
 
130 aa  97.1  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0985  CoA-binding domain protein  48.67 
 
 
152 aa  97.1  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5544  CoA-binding domain protein  41.41 
 
 
154 aa  97.1  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0987  CoA-binding domain-containing protein  40.3 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3286  CoA-binding domain-containing protein  39.68 
 
 
137 aa  95.9  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120452  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  41.35 
 
 
176 aa  95.9  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0530  CoA-binding domain-containing protein  42.64 
 
 
164 aa  95.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  42.86 
 
 
151 aa  94.7  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1144  CoA-binding  37.69 
 
 
142 aa  94.7  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1630  CoA-binding domain protein  37.31 
 
 
137 aa  94.4  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2248  CoA-binding domain-containing protein  39.84 
 
 
137 aa  93.6  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000439003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3394  CoA-binding domain-containing protein  39.68 
 
 
137 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0763288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3659  CoA-binding domain-containing protein  39.68 
 
 
137 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000120048  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0162  hypothetical protein  39.39 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3618  CoA-binding domain-containing protein  39.68 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000227272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3306  CoA-binding domain-containing protein  39.68 
 
 
137 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.007751  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3625  CoA binding domain family protein  39.68 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000648968  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1762  CoA-binding domain protein  41.86 
 
 
140 aa  92  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.823906  normal  0.0190292 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3356  CoA-binding domain-containing protein  38.89 
 
 
137 aa  91.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000642937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3610  CoA binding domain family protein  38.89 
 
 
137 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5882599999999998e-27 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3707  CoA binding domain family protein  38.89 
 
 
137 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000701886  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3363  CoA-binding domain protein  45.45 
 
 
199 aa  91.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0719099  normal  0.0150565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>