252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2153 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  100 
 
 
137 aa  280  5.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  99.27 
 
 
137 aa  278  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  99.27 
 
 
137 aa  278  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  99.27 
 
 
137 aa  278  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  99.27 
 
 
137 aa  278  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  99.27 
 
 
137 aa  278  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  98.54 
 
 
137 aa  276  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  97.81 
 
 
137 aa  276  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  97.81 
 
 
137 aa  276  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  95.62 
 
 
137 aa  268  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1762  CoA-binding domain-containing protein  72.26 
 
 
137 aa  207  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0753564  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  70.8 
 
 
137 aa  202  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  70.8 
 
 
137 aa  202  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  70.07 
 
 
137 aa  201  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2622  CoA-binding domain-containing protein  70.07 
 
 
138 aa  200  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2533  CoA-binding domain-containing protein  70.07 
 
 
138 aa  200  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0861335  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3207  CoA-binding domain-containing protein  70.07 
 
 
138 aa  200  5e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0196992  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2690  CoA-binding domain protein  69.34 
 
 
198 aa  197  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  61.83 
 
 
139 aa  155  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_50959  predicted protein  51.49 
 
 
146 aa  142  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  55.38 
 
 
144 aa  141  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1948  CoA-binding domain-containing protein  44.85 
 
 
151 aa  138  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2358  CoA-binding domain-containing protein  54.89 
 
 
138 aa  137  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1166  CoA-binding  52.99 
 
 
145 aa  137  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365479  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1875  CoA-binding domain protein  48.89 
 
 
147 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2493  CoA-binding domain-containing protein  51.88 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.244493  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2254  CoA-binding domain-containing protein  53.62 
 
 
138 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0324206  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2075  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  53.08 
 
 
612 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.313252  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0145  CoA-binding domain protein  53.85 
 
 
181 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1328  CoA-binding domain protein  56.15 
 
 
142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0242548  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5544  CoA-binding domain protein  51.59 
 
 
154 aa  127  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4615  CoA-binding domain-containing protein  53.08 
 
 
180 aa  128  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.305914  normal  0.0136961 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  47.66 
 
 
140 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1241  CoA-binding domain protein  53.85 
 
 
142 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  48.87 
 
 
142 aa  124  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  52.14 
 
 
151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0866  CoA-binding domain-containing protein  54.62 
 
 
144 aa  124  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226245  normal  0.636529 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1687  hypothetical protein  51.97 
 
 
150 aa  122  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.863027  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1976  CoA-binding domain-containing protein  48.12 
 
 
169 aa  123  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485695  normal  0.647487 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2251  CoA-binding  51.85 
 
 
140 aa  120  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2836  CoA-binding domain-containing protein  54.81 
 
 
155 aa  120  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.758344  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4331  CoA-binding domain-containing protein  53.85 
 
 
182 aa  120  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.282355 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  50.41 
 
 
134 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2240  hypothetical protein  49.28 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394786  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  46.4 
 
 
133 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  50.4 
 
 
134 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4825  CoA-binding domain-containing protein  48.41 
 
 
130 aa  119  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1177  CoA-binding domain-containing protein  50.72 
 
 
205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0915  CoA-binding domain-containing protein  48.55 
 
 
148 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.157936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2417  CoA-binding domain protein  49.62 
 
 
193 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452114  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  45.8 
 
 
139 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  52.34 
 
 
140 aa  115  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2489  CoA-binding domain-containing protein  48.87 
 
 
193 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.639017 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0985  CoA-binding domain protein  50 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2712  CoA-binding domain protein  48.87 
 
 
193 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350227  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  47.29 
 
 
176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0079  CoA-binding domain protein  47.66 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2574  hypothetical protein  50.38 
 
 
161 aa  115  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624453  hitchhiker  0.000000425683 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1388  CoA-binding domain-containing protein  49.59 
 
 
136 aa  115  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.555595  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3508  CoA-binding domain protein  44.44 
 
 
154 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0120178 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2052  CoA-binding  46.62 
 
 
154 aa  114  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1672  CoA-binding protein  51.24 
 
 
143 aa  114  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996781  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3103  hypothetical protein  49.23 
 
 
194 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.210422  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  43.94 
 
 
135 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3183  CoA-binding domain protein  43.7 
 
 
153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0530  CoA-binding domain-containing protein  50.77 
 
 
164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3286  CoA-binding domain-containing protein  44.44 
 
 
137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120452  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2396  CoA-binding  48.8 
 
 
138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.972486  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3356  CoA-binding domain-containing protein  43.65 
 
 
137 aa  111  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000642937  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3306  CoA-binding domain-containing protein  43.65 
 
 
137 aa  111  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.007751  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3707  CoA binding domain family protein  43.65 
 
 
137 aa  111  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000701886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1608  CoA binding domain family protein  43.65 
 
 
137 aa  111  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000441527  hitchhiker  0.00000000000716402 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3610  CoA binding domain family protein  43.65 
 
 
137 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5882599999999998e-27 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3618  CoA-binding domain-containing protein  43.65 
 
 
137 aa  110  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000227272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3394  CoA-binding domain-containing protein  43.65 
 
 
137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0763288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3659  CoA-binding domain-containing protein  43.65 
 
 
137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000120048  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1164  CoA-binding domain protein  51.18 
 
 
140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3625  CoA binding domain family protein  43.65 
 
 
137 aa  110  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000648968  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2693  CoA-binding  47.37 
 
 
180 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149948  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02340  predicted CoA-binding protein  48.84 
 
 
171 aa  110  7.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3063  CoA-binding  49.62 
 
 
162 aa  110  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3313  hypothetical protein  44.44 
 
 
153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2421  CoA-binding  48.31 
 
 
130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000330878  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0162  hypothetical protein  42.64 
 
 
145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  43.09 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2248  CoA-binding domain-containing protein  41.27 
 
 
137 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000439003  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  42.06 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2668  CoA-binding  46.92 
 
 
194 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0584  CoA-binding domain-containing protein  44.6 
 
 
175 aa  107  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4595  hypothetical protein  46.15 
 
 
194 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  44.96 
 
 
139 aa  107  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1854  CoA-binding domain-containing protein  46.4 
 
 
138 aa  107  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0446458  normal  0.0146672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4258  CoA-binding  47.41 
 
 
143 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2704  CoA-binding  45.11 
 
 
194 aa  105  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0390  CoA-binding domain-containing protein  37.98 
 
 
146 aa  105  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3341  CoA-binding domain-containing protein  42.96 
 
 
140 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125699  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2545  hypothetical protein  44.19 
 
 
138 aa  105  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3824  CoA-binding domain-containing protein  45.19 
 
 
150 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1479  CoA-binding domain protein  39.85 
 
 
134 aa  105  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2457  CoA-binding  45.86 
 
 
194 aa  104  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.618512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>