202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1328 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1328  CoA-binding domain protein  100 
 
 
142 aa  287  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0242548  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1241  CoA-binding domain protein  92.96 
 
 
142 aa  255  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1687  hypothetical protein  73.05 
 
 
150 aa  200  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.863027  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1166  CoA-binding  65.71 
 
 
145 aa  195  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365479  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2493  CoA-binding domain-containing protein  63.97 
 
 
152 aa  175  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.244493  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4331  CoA-binding domain-containing protein  65 
 
 
182 aa  175  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.282355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4595  hypothetical protein  63.57 
 
 
194 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3103  hypothetical protein  62.86 
 
 
194 aa  167  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.210422  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0866  CoA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
144 aa  165  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226245  normal  0.636529 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2668  CoA-binding  60.71 
 
 
194 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0145  CoA-binding domain protein  64.49 
 
 
181 aa  164  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4615  CoA-binding domain-containing protein  60.87 
 
 
180 aa  160  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.305914  normal  0.0136961 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2704  CoA-binding  57.86 
 
 
194 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2693  CoA-binding  60.56 
 
 
180 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149948  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2457  CoA-binding  63.57 
 
 
194 aa  153  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.618512  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1684  hypothetical protein  65.22 
 
 
154 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1762  CoA-binding domain-containing protein  56.92 
 
 
137 aa  147  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0753564  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2254  CoA-binding domain-containing protein  56.3 
 
 
138 aa  140  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0324206  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2690  CoA-binding domain protein  53.68 
 
 
198 aa  139  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2712  CoA-binding domain protein  59.71 
 
 
193 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350227  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2622  CoA-binding domain-containing protein  55.64 
 
 
138 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3207  CoA-binding domain-containing protein  55.64 
 
 
138 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0196992  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2489  CoA-binding domain-containing protein  59.71 
 
 
193 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.639017 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2533  CoA-binding domain-containing protein  55.64 
 
 
138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0861335  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  53.73 
 
 
137 aa  138  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1875  CoA-binding domain protein  52.94 
 
 
147 aa  138  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  53.38 
 
 
137 aa  138  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  56.92 
 
 
137 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  56.92 
 
 
137 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  56.92 
 
 
137 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  56.92 
 
 
137 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  56.92 
 
 
137 aa  137  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  56.92 
 
 
137 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  56.92 
 
 
137 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  56.92 
 
 
137 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2417  CoA-binding domain protein  57.97 
 
 
193 aa  137  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452114  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  57.03 
 
 
137 aa  136  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  56.15 
 
 
137 aa  135  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1177  CoA-binding domain-containing protein  58.04 
 
 
205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  61.42 
 
 
139 aa  134  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  51.49 
 
 
137 aa  134  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2075  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  54.35 
 
 
612 aa  134  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.313252  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2358  CoA-binding domain-containing protein  54.14 
 
 
138 aa  132  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2240  hypothetical protein  53.33 
 
 
148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394786  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0915  CoA-binding domain-containing protein  52.59 
 
 
148 aa  130  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.157936 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2052  CoA-binding  51.82 
 
 
154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  50.38 
 
 
144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1948  CoA-binding domain-containing protein  47.14 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_50959  predicted protein  52.24 
 
 
146 aa  125  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2836  CoA-binding domain-containing protein  55.71 
 
 
155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.758344  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2574  hypothetical protein  52.41 
 
 
161 aa  124  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624453  hitchhiker  0.000000425683 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3824  CoA-binding domain-containing protein  46.72 
 
 
150 aa  113  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2798  CoA-binding  46.32 
 
 
156 aa  112  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.254267  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2251  CoA-binding  50.39 
 
 
140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2004  CoA-binding domain protein  43.28 
 
 
135 aa  110  9e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  40 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2525  hypothetical protein  45 
 
 
139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.550629  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  43.51 
 
 
134 aa  105  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  43.51 
 
 
134 aa  105  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5544  CoA-binding domain protein  44.35 
 
 
154 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  42.65 
 
 
140 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0160  CoA-binding protein  45.52 
 
 
139 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0169  CoA-binding domain-containing protein  45.52 
 
 
139 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1988  CoA-binding domain-containing protein  42.96 
 
 
140 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370858  normal  0.185314 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2827  hypothetical protein  41.35 
 
 
133 aa  102  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0856697 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  38.64 
 
 
140 aa  103  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0150  CoA-binding domain-containing protein  44.78 
 
 
139 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.100452 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1943  CoA-binding  40.32 
 
 
142 aa  101  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.19202  normal  0.743605 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  41.67 
 
 
135 aa  100  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2545  hypothetical protein  44.53 
 
 
138 aa  100  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0742  CoA-binding domain-containing protein  42.06 
 
 
159 aa  100  6e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000457668  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5334  CoA-binding protein  43.09 
 
 
144 aa  100  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  43.08 
 
 
139 aa  100  8e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  45.99 
 
 
142 aa  100  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1014  CoA-binding domain protein  43.8 
 
 
136 aa  99.4  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3193  CoA-binding domain protein  44.78 
 
 
181 aa  98.6  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  37.31 
 
 
144 aa  97.8  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02340  predicted CoA-binding protein  46.15 
 
 
171 aa  98.2  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  45.04 
 
 
133 aa  97.4  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0272  CoA-binding domain protein  40 
 
 
136 aa  96.3  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0985  CoA-binding domain protein  44.63 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2396  CoA-binding  43.75 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.972486  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1304  coenzyme A binding protein  35.82 
 
 
136 aa  94  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0530  CoA-binding domain-containing protein  45.31 
 
 
164 aa  93.6  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1854  CoA-binding domain-containing protein  38.52 
 
 
138 aa  93.6  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0446458  normal  0.0146672 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0584  CoA-binding domain-containing protein  41.89 
 
 
175 aa  92.8  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3313  hypothetical protein  44.44 
 
 
153 aa  92  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1164  CoA-binding domain protein  48.74 
 
 
140 aa  92  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0390  CoA-binding domain-containing protein  37.78 
 
 
146 aa  91.7  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1144  CoA-binding  34.85 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3183  CoA-binding domain protein  43.45 
 
 
153 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3341  CoA-binding domain-containing protein  40.44 
 
 
140 aa  91.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125699  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  40.31 
 
 
176 aa  91.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1976  CoA-binding domain-containing protein  43.07 
 
 
169 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485695  normal  0.647487 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1388  CoA-binding domain-containing protein  40.32 
 
 
136 aa  91.3  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.555595  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  38.97 
 
 
139 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0429  CoA-binding domain protein  40.74 
 
 
140 aa  90.5  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3508  CoA-binding domain protein  45.11 
 
 
154 aa  90.5  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0120178 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0987  CoA-binding domain-containing protein  36.64 
 
 
143 aa  90.5  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1762  CoA-binding domain protein  40.15 
 
 
140 aa  90.1  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.823906  normal  0.0190292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>