213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3063 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3063  CoA-binding  100 
 
 		 162 aa  325  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1854  CoA-binding domain-containing protein  73.19 
 
 		 138 aa  200  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0446458  normal  0.0146672 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1388  CoA-binding domain-containing protein  65.62 
 
 		 136 aa  170  9e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.555595  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5544  CoA-binding domain protein  63.41 
 
 		 154 aa  160  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1164  CoA-binding domain protein  61.36 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2545  hypothetical protein  55.97 
 
 		 138 aa  145  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1891  CoA-binding domain protein  57.14 
 
 		 139 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.272605 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  50 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0534  CoA-binding domain-containing protein  45.32 
 
 		 141 aa  122  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563863  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  47.76 
 
 		 137 aa  121  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  49.22 
 
 		 137 aa  120  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  49.22 
 
 		 137 aa  120  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  49.22 
 
 		 137 aa  120  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  49.22 
 
 		 137 aa  120  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  49.22 
 
 		 137 aa  120  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  48.44 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  48.44 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0671  CoA-binding domain protein  50.37 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  48.44 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  42.64 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1762  CoA-binding domain-containing protein  47.01 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0753564  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0985  CoA-binding domain protein  47.37 
 
 		 152 aa  117  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4117  CoA-binding domain protein  51.15 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  44.78 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  45.76 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  43.28 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  43.41 
 
 		 139 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4825  CoA-binding domain-containing protein  46.77 
 
 		 130 aa  110  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  46.32 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2690  CoA-binding domain protein  41.79 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_50959  predicted protein  44.6 
 
 		 146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  47.69 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  44.92 
 
 		 134 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  42.54 
 
 		 137 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  43.18 
 
 		 176 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4799  CoA-binding domain protein  51.13 
 
 		 137 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2533  CoA-binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0861335  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2622  CoA-binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3207  CoA-binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0196992  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  40.58 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2396  CoA-binding  40.77 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.972486  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1976  CoA-binding domain-containing protein  43.38 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485695  normal  0.647487 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3341  CoA-binding domain-containing protein  40.44 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  36.43 
 
 		 149 aa  100  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  40.6 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0728  CoA-binding domain-containing protein  42.11 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.298785 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2340  CoA-binding domain protein  39.39 
 
 		 179 aa  99  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  38.33 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2004  CoA-binding domain protein  42.22 
 
 		 135 aa  98.6  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2075  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  41.55 
 
 		 612 aa  97.8  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.313252  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1166  CoA-binding  43.38 
 
 		 145 aa  97.4  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365479  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2525  hypothetical protein  39.23 
 
 		 139 aa  97.1  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.550629  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2421  CoA-binding  46.55 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000330878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2574  hypothetical protein  43.61 
 
 		 161 aa  95.5  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624453  hitchhiker  0.000000425683 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0429  CoA-binding domain protein  40.46 
 
 		 140 aa  94  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4331  CoA-binding domain-containing protein  43.26 
 
 		 182 aa  93.2  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.282355 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1421  CoA-binding domain-containing protein  33.08 
 
 		 134 aa  93.6  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000954781  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4258  CoA-binding  43.44 
 
 		 143 aa  92.8  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  33.58 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  42.97 
 
 		 140 aa  91.7  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0742  CoA-binding domain-containing protein  30.66 
 
 		 159 aa  91.3  5e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000457668  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  37.4 
 
 		 135 aa  91.3  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2358  CoA-binding domain-containing protein  41.84 
 
 		 138 aa  91.3  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1672  CoA-binding protein  47.93 
 
 		 143 aa  90.9  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996781  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1687  hypothetical protein  40.15 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.863027  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1943  CoA-binding  38.71 
 
 		 142 aa  88.2  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.19202  normal  0.743605 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0375  CoA-binding domain-containing protein  44.26 
 
 		 154 aa  88.2  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  0.413983 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0145  CoA-binding domain protein  40.43 
 
 		 181 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2085  CoA-binding domain protein  32.81 
 
 		 154 aa  87.8  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2493  CoA-binding domain-containing protein  41.01 
 
 		 152 aa  87.8  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.244493  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3508  CoA-binding domain protein  40.28 
 
 		 154 aa  87.4  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0120178 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  29.01 
 
 		 140 aa  87  9e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1948  CoA-binding domain-containing protein  31.11 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1479  CoA-binding domain protein  36.92 
 
 		 134 aa  87  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1328  CoA-binding domain protein  41.35 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0242548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4615  CoA-binding domain-containing protein  40.43 
 
 		 180 aa  87  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.305914  normal  0.0136961 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3286  CoA-binding domain-containing protein  36.97 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120452  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2240  hypothetical protein  38.73 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394786  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  35.38 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2836  CoA-binding domain-containing protein  42.18 
 
 		 155 aa  85.1  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.758344  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2417  CoA-binding domain protein  45 
 
 		 193 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1144  CoA-binding  33.59 
 
 		 142 aa  84.7  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1630  CoA-binding domain protein  36.15 
 
 		 137 aa  84.7  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1048  CoA-binding domain-containing protein  39.1 
 
 		 139 aa  84.3  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.417839  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2248  CoA-binding domain-containing protein  36.07 
 
 		 137 aa  84.3  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000439003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3394  CoA-binding domain-containing protein  36.97 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0763288  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3344  CoA-binding  38.97 
 
 		 145 aa  84.3  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3659  CoA-binding domain-containing protein  36.97 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000120048  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2254  CoA-binding domain-containing protein  39.71 
 
 		 138 aa  84  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0324206  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3313  hypothetical protein  39.58 
 
 		 153 aa  84  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3618  CoA-binding domain-containing protein  36.97 
 
 		 137 aa  84  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000227272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3306  CoA-binding domain-containing protein  36.97 
 
 		 137 aa  84  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.007751  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3625  CoA binding domain family protein  36.97 
 
 		 137 aa  84  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000648968  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4595  hypothetical protein  40.29 
 
 		 194 aa  84  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2712  CoA-binding domain protein  42.86 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350227  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2489  CoA-binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.639017 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0162  hypothetical protein  35.16 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1875  CoA-binding domain protein  35.51 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1608  CoA binding domain family protein  36.13 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000441527  hitchhiker  0.00000000000716402 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0150  CoA-binding domain-containing protein  40.15 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.100452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>