233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0966 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0966  CoA-binding domain protein  100 
 
 
129 aa  264  2.9999999999999995e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  56.69 
 
 
537 aa  152  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0846  CoA-binding domain-containing protein  55.46 
 
 
137 aa  136  8.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  52.03 
 
 
144 aa  135  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1421  CoA-binding domain-containing protein  48.78 
 
 
134 aa  133  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000954781  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0916  CoA-binding domain-containing protein  54.62 
 
 
137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.7124  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  50.81 
 
 
140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0742  CoA-binding domain-containing protein  47.15 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000457668  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1144  CoA-binding  49.59 
 
 
142 aa  120  6e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  42.5 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  42.52 
 
 
134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0985  CoA-binding domain protein  41.82 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5544  CoA-binding domain protein  34.17 
 
 
154 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3341  CoA-binding domain-containing protein  40.98 
 
 
140 aa  102  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125699  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1048  CoA-binding domain-containing protein  37.5 
 
 
139 aa  101  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.417839  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  38.33 
 
 
140 aa  101  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2340  CoA-binding domain protein  40.83 
 
 
179 aa  100  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  37.3 
 
 
139 aa  100  9e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  37.21 
 
 
137 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  37.21 
 
 
137 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  37.21 
 
 
137 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  37.21 
 
 
137 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  37.4 
 
 
176 aa  99.4  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  36.43 
 
 
137 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  36.43 
 
 
137 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1672  CoA-binding protein  37.5 
 
 
143 aa  98.2  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996781  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1479  CoA-binding domain protein  39.23 
 
 
134 aa  98.6  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  36.43 
 
 
137 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  36.43 
 
 
137 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  36.43 
 
 
137 aa  98.6  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  39.02 
 
 
133 aa  97.8  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  35.94 
 
 
137 aa  97.8  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  42.02 
 
 
139 aa  97.8  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2525  hypothetical protein  36.75 
 
 
139 aa  97.8  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.550629  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  37.9 
 
 
135 aa  97.4  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2421  CoA-binding  38.66 
 
 
130 aa  97.1  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000330878  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  35.25 
 
 
140 aa  96.3  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1049  CoA-binding domain protein  37.9 
 
 
138 aa  95.9  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2240  hypothetical protein  35.16 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394786  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3824  CoA-binding domain-containing protein  37.88 
 
 
150 aa  95.5  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0915  CoA-binding domain-containing protein  34.38 
 
 
148 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.157936 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  35.34 
 
 
151 aa  93.6  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3618  CoA-binding domain-containing protein  36.67 
 
 
137 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000227272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3625  CoA binding domain family protein  36.67 
 
 
137 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000648968  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  37.69 
 
 
139 aa  93.2  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  34.38 
 
 
137 aa  93.2  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3286  CoA-binding domain-containing protein  35.83 
 
 
137 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120452  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2545  hypothetical protein  30.65 
 
 
138 aa  92  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1762  CoA-binding domain-containing protein  34.38 
 
 
137 aa  92.8  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0753564  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  34.88 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3356  CoA-binding domain-containing protein  35.83 
 
 
137 aa  91.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000642937  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3306  CoA-binding domain-containing protein  35.83 
 
 
137 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.007751  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3707  CoA binding domain family protein  35.83 
 
 
137 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000701886  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  30.33 
 
 
149 aa  91.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  33.06 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4825  CoA-binding domain-containing protein  37.3 
 
 
130 aa  91.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3610  CoA binding domain family protein  35.83 
 
 
137 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5882599999999998e-27 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2254  CoA-binding domain-containing protein  32.03 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0324206  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2248  CoA-binding domain-containing protein  35.83 
 
 
137 aa  92  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000439003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3394  CoA-binding domain-containing protein  35.83 
 
 
137 aa  91.7  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0763288  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2004  CoA-binding domain protein  33.07 
 
 
135 aa  91.3  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3659  CoA-binding domain-containing protein  35.83 
 
 
137 aa  91.7  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000120048  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2690  CoA-binding domain protein  33.59 
 
 
198 aa  91.3  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2533  CoA-binding domain-containing protein  36.72 
 
 
138 aa  90.5  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0861335  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2622  CoA-binding domain-containing protein  36.72 
 
 
138 aa  90.5  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3207  CoA-binding domain-containing protein  36.72 
 
 
138 aa  90.5  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0196992  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1388  CoA-binding domain-containing protein  31.97 
 
 
136 aa  90.5  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.555595  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0728  CoA-binding domain-containing protein  31.2 
 
 
135 aa  90.1  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.298785 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1608  CoA binding domain family protein  35 
 
 
137 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000441527  hitchhiker  0.00000000000716402 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  34.88 
 
 
137 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4587  CoA-binding domain protein  33.33 
 
 
142 aa  89.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3313  hypothetical protein  36.22 
 
 
153 aa  88.6  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3183  CoA-binding domain protein  35.11 
 
 
153 aa  88.6  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1164  CoA-binding domain protein  28.33 
 
 
140 aa  88.6  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1630  CoA-binding domain protein  32.52 
 
 
137 aa  89  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0725  CoA-binding domain-containing protein  34.13 
 
 
139 aa  88.6  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000455945 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_50959  predicted protein  35.2 
 
 
146 aa  88.2  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1166  CoA-binding  35.61 
 
 
145 aa  87.8  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365479  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0584  CoA-binding domain-containing protein  33.08 
 
 
175 aa  87  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3508  CoA-binding domain protein  35.11 
 
 
154 aa  87  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0120178 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0162  hypothetical protein  33.87 
 
 
145 aa  87  8e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0429  CoA-binding domain protein  34.15 
 
 
140 aa  87  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3344  CoA-binding  32.12 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1616  CoA-binding domain protein  37.5 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000180037  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1379  CoA-binding domain protein  32.26 
 
 
161 aa  86.3  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02340  predicted CoA-binding protein  36.15 
 
 
171 aa  85.9  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1875  CoA-binding domain protein  33.07 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  30.16 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1976  CoA-binding domain-containing protein  30.71 
 
 
169 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485695  normal  0.647487 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0530  CoA-binding domain-containing protein  33.06 
 
 
164 aa  84.3  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1009  CoA-binding domain-containing protein  38.4 
 
 
149 aa  83.6  8e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2559  CoA-binding domain protein  35.83 
 
 
139 aa  83.6  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1209  CoA-binding domain-containing protein  40.8 
 
 
145 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1562  CoA-binding domain-containing protein  33.88 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.477139  normal  0.0705808 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2358  CoA-binding domain-containing protein  32.81 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1762  CoA-binding domain protein  33.33 
 
 
140 aa  82  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.823906  normal  0.0190292 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2798  CoA-binding  34.92 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.254267  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3436  CoA-binding domain protein  31.45 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1672  CoA-binding domain-containing protein  40 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2075  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  34.11 
 
 
612 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.313252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>