208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2358 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2358  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 138 aa  273  5e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  61.59 
 
 		 139 aa  160  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  57.89 
 
 		 137 aa  156  8e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  57.14 
 
 		 137 aa  156  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1762  CoA-binding domain-containing protein  57.89 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0753564  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2690  CoA-binding domain protein  54.89 
 
 		 198 aa  151  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_50959  predicted protein  57.04 
 
 		 146 aa  150  5.9999999999999996e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  54.89 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3207  CoA-binding domain-containing protein  54.89 
 
 		 138 aa  148  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0196992  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2622  CoA-binding domain-containing protein  54.89 
 
 		 138 aa  148  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2533  CoA-binding domain-containing protein  54.89 
 
 		 138 aa  148  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0861335  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  54.14 
 
 		 137 aa  147  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  54.14 
 
 		 137 aa  147  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  54.14 
 
 		 137 aa  147  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  54.14 
 
 		 137 aa  147  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  54.14 
 
 		 137 aa  147  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  54.14 
 
 		 137 aa  147  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  53.38 
 
 		 137 aa  147  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  53.38 
 
 		 137 aa  147  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  53.38 
 
 		 137 aa  146  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  55.64 
 
 		 137 aa  143  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2493  CoA-binding domain-containing protein  52.24 
 
 		 152 aa  140  8e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.244493  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1875  CoA-binding domain protein  50.71 
 
 		 147 aa  135  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0145  CoA-binding domain protein  55.3 
 
 		 181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  47.1 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1948  CoA-binding domain-containing protein  44.36 
 
 		 151 aa  130  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2251  CoA-binding  54.35 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1328  CoA-binding domain protein  53.73 
 
 		 142 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0242548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4615  CoA-binding domain-containing protein  55.3 
 
 		 180 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.305914  normal  0.0136961 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2489  CoA-binding domain-containing protein  54.14 
 
 		 193 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.639017 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2417  CoA-binding domain protein  53.38 
 
 		 193 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2712  CoA-binding domain protein  54.14 
 
 		 193 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350227  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1166  CoA-binding  50.75 
 
 		 145 aa  125  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365479  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1687  hypothetical protein  55.91 
 
 		 150 aa  124  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.863027  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1241  CoA-binding domain protein  52.63 
 
 		 142 aa  124  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2836  CoA-binding domain-containing protein  55.64 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.758344  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4825  CoA-binding domain-containing protein  52.8 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2075  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  53.08 
 
 		 612 aa  120  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.313252  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2240  hypothetical protein  53.15 
 
 		 148 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394786  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1177  CoA-binding domain-containing protein  53.62 
 
 		 205 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1976  CoA-binding domain-containing protein  53.28 
 
 		 169 aa  119  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485695  normal  0.647487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2704  CoA-binding  52.63 
 
 		 194 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0866  CoA-binding domain-containing protein  51.88 
 
 		 144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226245  normal  0.636529 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  52.94 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0915  CoA-binding domain-containing protein  51.75 
 
 		 148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.157936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3103  hypothetical protein  50 
 
 		 194 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.210422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2693  CoA-binding  50.75 
 
 		 180 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2668  CoA-binding  51.88 
 
 		 194 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4595  hypothetical protein  49.62 
 
 		 194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2254  CoA-binding domain-containing protein  47.79 
 
 		 138 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0324206  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1479  CoA-binding domain protein  44.36 
 
 		 134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5544  CoA-binding domain protein  48.76 
 
 		 154 aa  110  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3313  hypothetical protein  45.71 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2457  CoA-binding  48.87 
 
 		 194 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.618512  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3508  CoA-binding domain protein  45.86 
 
 		 154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0120178 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  40.91 
 
 		 135 aa  107  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2052  CoA-binding  45.59 
 
 		 154 aa  107  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0534  CoA-binding domain-containing protein  48.85 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563863  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  44.03 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3344  CoA-binding  43.48 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3183  CoA-binding domain protein  45.8 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0079  CoA-binding domain protein  46.27 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02340  predicted CoA-binding protein  46.88 
 
 		 171 aa  103  6e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  46.32 
 
 		 140 aa  103  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  40.77 
 
 		 149 aa  103  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  41.73 
 
 		 139 aa  103  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4331  CoA-binding domain-containing protein  47.37 
 
 		 182 aa  103  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.282355 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2574  hypothetical protein  46.04 
 
 		 161 aa  103  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624453  hitchhiker  0.000000425683 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1684  hypothetical protein  49.24 
 
 		 154 aa  103  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1672  CoA-binding protein  51.64 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996781  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1630  CoA-binding domain protein  41.41 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  43.09 
 
 		 133 aa  100  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2396  CoA-binding  41.27 
 
 		 138 aa  100  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.972486  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0530  CoA-binding domain-containing protein  45.38 
 
 		 164 aa  100  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0989  CoA-binding domain protein  41.27 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1164  CoA-binding domain protein  45.67 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  42.15 
 
 		 134 aa  98.6  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  39.39 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0985  CoA-binding domain protein  45.74 
 
 		 152 aa  97.8  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  42.15 
 
 		 134 aa  97.8  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1049  CoA-binding domain protein  35.77 
 
 		 138 aa  97.8  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2004  CoA-binding domain protein  39.29 
 
 		 135 aa  97.4  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1014  CoA-binding domain protein  42.86 
 
 		 136 aa  97.1  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0937  CoA-binding domain-containing protein  31.85 
 
 		 153 aa  97.1  8e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.962686  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0162  hypothetical protein  42.75 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3341  CoA-binding domain-containing protein  39.72 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0584  CoA-binding domain-containing protein  43.8 
 
 		 175 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1891  CoA-binding domain protein  47.58 
 
 		 139 aa  94.7  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.272605 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0747  CoA-binding  44.03 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0309601  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1379  CoA-binding domain protein  43.65 
 
 		 161 aa  94.7  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1048  CoA-binding domain-containing protein  39.1 
 
 		 139 aa  94  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.417839  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0742  CoA-binding domain-containing protein  34.85 
 
 		 159 aa  93.6  9e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000457668  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1388  CoA-binding domain-containing protein  42.98 
 
 		 136 aa  93.6  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.555595  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4799  CoA-binding domain protein  43.7 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3824  CoA-binding domain-containing protein  43.7 
 
 		 150 aa  92.8  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19320  predicted CoA-binding protein  43.65 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0866422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2545  hypothetical protein  42.96 
 
 		 138 aa  92  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1672  CoA-binding domain-containing protein  31.85 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 140 aa  92  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1009  CoA-binding domain-containing protein  29.63 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>