227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2533 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2533  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 
138 aa  276  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0861335  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3207  CoA-binding domain-containing protein  99.28 
 
 
138 aa  275  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0196992  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2622  CoA-binding domain-containing protein  99.28 
 
 
138 aa  275  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1762  CoA-binding domain-containing protein  77.37 
 
 
137 aa  219  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0753564  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  77.37 
 
 
137 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2690  CoA-binding domain protein  75.91 
 
 
198 aa  209  9e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  75.18 
 
 
137 aa  209  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  73.72 
 
 
137 aa  206  6e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  70.8 
 
 
137 aa  201  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  70.8 
 
 
137 aa  201  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  70.8 
 
 
137 aa  201  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  70.8 
 
 
137 aa  201  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  70.8 
 
 
137 aa  201  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  70.8 
 
 
137 aa  201  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  70.07 
 
 
137 aa  201  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  70.07 
 
 
137 aa  201  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  70.07 
 
 
137 aa  200  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  70.07 
 
 
137 aa  200  5e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  61.07 
 
 
139 aa  155  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  56.82 
 
 
144 aa  150  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_50959  predicted protein  56.72 
 
 
146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1875  CoA-binding domain protein  52.52 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1948  CoA-binding domain-containing protein  46.67 
 
 
151 aa  137  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2358  CoA-binding domain-containing protein  54.89 
 
 
138 aa  135  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1328  CoA-binding domain protein  55.64 
 
 
142 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0242548  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2075  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  53.79 
 
 
612 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.313252  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2493  CoA-binding domain-containing protein  51.13 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.244493  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2712  CoA-binding domain protein  51.45 
 
 
193 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350227  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2489  CoA-binding domain-containing protein  51.45 
 
 
193 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.639017 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1166  CoA-binding  46.38 
 
 
145 aa  128  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365479  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0145  CoA-binding domain protein  50.76 
 
 
181 aa  127  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2417  CoA-binding domain protein  50.72 
 
 
193 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452114  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4615  CoA-binding domain-containing protein  50.76 
 
 
180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.305914  normal  0.0136961 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1241  CoA-binding domain protein  52.63 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0866  CoA-binding domain-containing protein  54.14 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226245  normal  0.636529 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2251  CoA-binding  53.38 
 
 
140 aa  124  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2836  CoA-binding domain-containing protein  54.81 
 
 
155 aa  124  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.758344  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4331  CoA-binding domain-containing protein  51.45 
 
 
182 aa  123  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.282355 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1687  hypothetical protein  51.18 
 
 
150 aa  122  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.863027  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1177  CoA-binding domain-containing protein  49.65 
 
 
205 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3103  hypothetical protein  51.47 
 
 
194 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.210422  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2254  CoA-binding domain-containing protein  47.83 
 
 
138 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0324206  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  43.51 
 
 
140 aa  120  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2704  CoA-binding  50 
 
 
194 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2668  CoA-binding  50 
 
 
194 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02340  predicted CoA-binding protein  50.78 
 
 
171 aa  118  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  46.62 
 
 
142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2574  hypothetical protein  48.87 
 
 
161 aa  117  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624453  hitchhiker  0.000000425683 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  49.59 
 
 
134 aa  117  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  47.24 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  49.6 
 
 
133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2693  CoA-binding  47.06 
 
 
180 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149948  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1976  CoA-binding domain-containing protein  44.78 
 
 
169 aa  114  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485695  normal  0.647487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  47.24 
 
 
176 aa  114  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0079  CoA-binding domain protein  45.38 
 
 
145 aa  114  5e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  47.93 
 
 
134 aa  114  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0162  hypothetical protein  46.51 
 
 
145 aa  114  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0530  CoA-binding domain-containing protein  50 
 
 
164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2240  hypothetical protein  43.48 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394786  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4825  CoA-binding domain-containing protein  47.2 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5544  CoA-binding domain protein  45.6 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  45.52 
 
 
139 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2052  CoA-binding  45.11 
 
 
154 aa  111  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1672  CoA-binding protein  50 
 
 
143 aa  110  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996781  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0985  CoA-binding domain protein  48.36 
 
 
152 aa  110  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3508  CoA-binding domain protein  44.96 
 
 
154 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0120178 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1049  CoA-binding domain protein  40.91 
 
 
138 aa  110  8.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4595  hypothetical protein  46.32 
 
 
194 aa  110  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1388  CoA-binding domain-containing protein  48.36 
 
 
136 aa  110  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.555595  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0915  CoA-binding domain-containing protein  42.03 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.157936 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0429  CoA-binding domain protein  43.7 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  47.86 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3183  CoA-binding domain protein  44.88 
 
 
153 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2457  CoA-binding  44.85 
 
 
194 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.618512  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0160  CoA-binding protein  46.62 
 
 
139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0169  CoA-binding domain-containing protein  46.62 
 
 
139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0150  CoA-binding domain-containing protein  46.62 
 
 
139 aa  107  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.100452 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0728  CoA-binding domain-containing protein  40.31 
 
 
135 aa  107  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.298785 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3313  hypothetical protein  45.11 
 
 
153 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0390  CoA-binding domain-containing protein  39.39 
 
 
146 aa  106  9.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3341  CoA-binding domain-containing protein  43.7 
 
 
140 aa  105  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125699  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1379  CoA-binding domain protein  46.83 
 
 
161 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1164  CoA-binding domain protein  48.18 
 
 
140 aa  105  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  42.42 
 
 
135 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  40.15 
 
 
144 aa  105  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0584  CoA-binding domain-containing protein  47.45 
 
 
175 aa  104  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3824  CoA-binding domain-containing protein  42.96 
 
 
150 aa  104  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4587  CoA-binding domain protein  41.35 
 
 
142 aa  103  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2396  CoA-binding  44.7 
 
 
138 aa  103  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.972486  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3344  CoA-binding  42.03 
 
 
145 aa  103  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3436  CoA-binding domain protein  46.03 
 
 
180 aa  103  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  45.3 
 
 
151 aa  103  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3286  CoA-binding domain-containing protein  41.6 
 
 
137 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120452  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2340  CoA-binding domain protein  43.31 
 
 
179 aa  102  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19320  predicted CoA-binding protein  47.62 
 
 
165 aa  102  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0866422  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0687  CoA-binding domain-containing protein  40.46 
 
 
138 aa  102  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.44778  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3394  CoA-binding domain-containing protein  41.6 
 
 
137 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0763288  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3306  CoA-binding domain-containing protein  41.6 
 
 
137 aa  101  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.007751  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3659  CoA-binding domain-containing protein  41.6 
 
 
137 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000120048  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0989  CoA-binding domain protein  42.64 
 
 
140 aa  101  4e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>